已經(jīng)確權(quán)的土地有糾紛的解決辦法如下：

1、協(xié)商處理。土地爭議產(chǎn)生后在自愿互諒的基礎(chǔ)上，依照法律的規(guī)定直接進(jìn)行協(xié)商；

2、政府處理。當(dāng)事人協(xié)商不成的由人民政府處理。兩個個人或者個人與單位之間的爭議，由鄉(xiāng)級人民政府處理。兩個單位之間的爭議由縣級人民政府處理。人民政府裁決申請后會對當(dāng)事人先進(jìn)行調(diào)解，調(diào)解不成的進(jìn)行行政裁決。行政裁決須以人民政府的名義并出具處理決定書，該決定書加蓋人民政府處理土地所有權(quán)和使用權(quán)爭議的專用章；

3、提起訴訟。土地糾紛雙方對有關(guān)人民政府的處理決定不服的，可以自接到處理決定之日起30日內(nèi)，向人民法院起訴。

征收土地應(yīng)當(dāng)依法及時足額支付土地補償費、安置補助費以及農(nóng)村村民住宅、其他地上附著物和青苗等的補償費用，并安排被征地農(nóng)民的社會保障費用。征收農(nóng)用地的土地補償費、安置補助費標(biāo)準(zhǔn)由省、自治區(qū)、直轄市通過制定公布區(qū)片綜合地價確定。制定區(qū)片綜合地價應(yīng)當(dāng)綜合考慮土地原用途、土地資源條件、土地產(chǎn)值、土地區(qū)位、土地供求關(guān)系、人口以及經(jīng)濟(jì)社會發(fā)展水平等因素，并至少每三年調(diào)整或者重新公布一次。

征收農(nóng)用地以外的其他土地、地上附著物和青苗等的補償標(biāo)準(zhǔn)，由省、自治區(qū)、直轄市制定。對其中的農(nóng)村村民住宅，應(yīng)當(dāng)按照先補償后搬遷、居住條件有改善的原則，尊重農(nóng)村村民意愿，采取重新安排宅基地建房、提供安置房或者貨幣補償?shù)确绞浇o予公平、合理的補償，并對因征收造成的搬遷、臨時安置等費用予以補償，保障農(nóng)村村民居住的權(quán)利和合法的住房財產(chǎn)權(quán)益。

當(dāng)事人協(xié)商解決：所謂協(xié)商解決是指土地糾紛發(fā)生以后，由當(dāng)事人在自愿、互諒的基礎(chǔ)上，按照有關(guān)法律規(guī)定，在不損害他人利益的前提下，直接進(jìn)行磋商，自行解決糾紛的辦法。協(xié)商解決后，當(dāng)事人雙方應(yīng)當(dāng)簽署協(xié)議。該協(xié)議由當(dāng)事人自愿執(zhí)行，沒有法律的約束力。如果當(dāng)事人一方后悔，拒絕執(zhí)行，另一方可以申請人民政府土地管理部門進(jìn)行調(diào)處。

《中華人民共和國土地管理法》第十六條 單位之間的爭議，由縣級以上人民政府處理；個人之間、個人與單位之間的爭議，由鄉(xiāng)人民政府或縣級以上人民政府處理。當(dāng)事人對有關(guān)人民政府處理不服的，可以自接到處理決定通知之日起三十日內(nèi)，向人民法院起訴。在 土地所有權(quán) 和使用權(quán)爭議解決以前，任何一方不得改變土地現(xiàn)狀。

根據(jù)我國相關(guān)法律規(guī)定，對于土地確權(quán)后有糾紛的解決問題，是可以由雙方當(dāng)事人進(jìn)行協(xié)商的；對于協(xié)商不成的情形，是可以向人民政府申請?zhí)幚淼模粚τ诋?dāng)事人對有關(guān)人民政府的處理決定不服的，可以自接到處理決定通知之日起三十日內(nèi)以作出處理決定的人民政府為被告提起行政訴訟。1、土地所有權(quán)和使用權(quán)爭議，由當(dāng)事人協(xié)商解決；協(xié)商不成的，由人民政府處理。 2、單位之間的爭議，由縣級以上人民政府處理；個人之間、個人與單位之間的爭議，由鄉(xiāng)級人民政府或者縣級以上人民政府處理。 人民法院受理公民之間、法人之間、其他組織之間以及他們相互之間因財產(chǎn)關(guān)系和人身關(guān)系提起的民事訴訟，適用本法的規(guī)定。

法律依據(jù)：《中華人民共和國土地管理法》 第十四條 土地所有權(quán)和使用權(quán)爭議，由當(dāng)事人協(xié)商解決；協(xié)商不成的，由人民政府處理。

單位之間的爭議，由縣級以上人民政府處理；個人之間、個人與單位之間的爭議，由鄉(xiāng)級人民政府或者縣級以上人民政府處理。

當(dāng)事人對有關(guān)人民政府的處理決定不服的，可以自接到處理決定通知之日起三十日內(nèi)，向人民法院起訴。

在土地所有權(quán)和使用權(quán)爭議解決前，任何一方不得改變土地利用現(xiàn)狀。