目前如果 建設工程合同 無效后 工程款結算 的話，具體來說，建設工程將涉及發包人、承包人和轉承包人三方主體的關系，也涉及發包人與承包人之間簽訂的建設工程合同以及承包人與轉承包人之間簽訂的 工程轉包合同 兩個合同關系，工程款結算也因此需要考慮以下三方面的關系。 發包人與承包人之間的工程款結算： 在以往一些司法實踐中，有認為無效的轉包合同不應影響雙方簽訂的建設工程 合同的效力 ，因此雙方仍應按照合同約定進行工程款結算。但是，這種處理等于變相認可了承包人隨意轉包工程、破壞建筑市場秩序的行為，似有不妥。 考慮到承包人非法轉包工程違反了法律的強制性規定，且其事實上在合同簽訂后并沒有任何實際的履約行為，其行為是違法行為同時也是違約行為，承包人要求發包人按合同約定計算工程價款缺乏事實和法律依據。承包人有權要求發包人支付其所支出的成本，而對于合同約定的工程價款中包含的管理費和利潤等則屬于非法利益，可以根據《 建設工程施工合同 司法解釋》第4條的規定予以收繳。實踐中，裁判機構也有根據案件的具體情況作出不同的處理，按照 實際施工人 的資質等級據實 結算工程款 ，但其裁判宗旨仍應符合“任何人不得從其違法行為中獲利”的原則。

　　應視為違約行為或違法解除合同，須按合同約定承擔相應的法律后果。
　　同時，可以在解除時合同時，就相應事項達成協議，按協議執行，如果相對方愿意，全額承付工程款法律不限。
　　如果是因發包方違約導致施工合同解除，對于已完成工程價款的結算，應當注意一下問題：
　　一、應當核對確認已經完成的工程量。
　　二、應當確認已完工程量是否合格；工程質量不合格的，應當整改達到合格。
　　三、對于工程質量合格的，經雙方協商不能就工程價款達成一致的，如果合同中約定的計價方式為可調價，應當按照定額進行工程造價鑒定，據實結算。如何合同中約定的是固定單價或者是固定總價的，則不能完全按照合同約定的固定價結算。因為合同中約定的固定價，是以工程項全部完工為條件的，半拉子工程，已經改變了固定價的固定條件，合同中約定的工程量尚未全部做完，如果仍然機械的按照合同約定的固定價，套用已經完工部分占全部工程量的比例結算工程款，顯然不符合實際情況。比如一個地下兩層，地上二十層的住宅樓，剛剛完成地下兩層，合同解除了。就不能按照合同約定的每平方米1500元進行結算。因為地下部分的工程造價相對較高。這種情況下，就要對已經完成的工程價款進行鑒定，參照合同約定，結算工程款。
　　四、對于按照合同約定未到給付期限的工程款和工程保修款，應當一并進行結算。因為合同解除以后，承包方將不再繼續履行施工義務，未到期的債權，因合同解除已經轉化為到期債權。
　　五、承包方可以依據合同法的規定，向發包方主張其它損失及合同未履行部分的預期利潤。《合同法》第一百一十三條規定， “當事人一方不履行合同義務或者履行合同義務不符合約定，給對方造成損失的，損失賠償額應當相當于因違約所造成的損失，包括合同履行后可以獲得的利益”。
　　六、建設工程施工合同解除，并不必然免除承包人對已經完工部分工程的保修責任。承包人就已經完成部分的工程，要按照合同約定承擔保修義務。
《建設工程質量管理條例》第四十一條規定，“建設工程在保修范圍和保修期限內發生質量問題的，施工單位應當履行保修義務，并對造成的損失承擔賠償責任”。
　　可見，工程保修是承包方的后合同義務，而且是法定義務，因此，合同解除以后，并不免除承包方對于建設工程的保修義務。