1、申請：由房屋登記申請人向行政服務中心不動產登記窗口提出農村自建房的辦理手續申請，并提交相關證明材料。
2、受理：對符合農村自建房的辦理手續條件的登記申請予以接受。
3、審核：對受理的農村自建房的辦理手續申請事項進行審查，對材料的一致性、合法性進行審核。
4、記載于登記簿：經審核符合登記條件的，將申請農村自建房的辦理手續事項記載于登記簿。
5、領取《不動產權證書》。
農村辦不動產證要哪些材料?
1、根據《房屋登記辦法》的規定，因合法建造房屋申請房屋所有權初始登記的，應當提交下列材料：登記申請書;申請人的身份證明;宅基地使用權證明或者集體所有建設用地使用權證明;
2、申請登記房屋符合城鄉規劃的證明;房屋測繪報告或者村民住房平面圖;其他必要材料。申請村民住房所有權初始登記的，還應當提交申請人屬于房屋所在地農村集體經濟組織成員的證明。
不動產登記如何申請?
1、當事人準備好一份房屋異議登記申請書。在申請書請將申請人、被申請人、申請事項、申請理由等事項詳細寫清楚，會方便房屋交易中心的人員辦理相關手續。攜帶本人身份證、結婚證、申請書到不動產所在地的房地產交易中心辦理異議登記手續。
2、房地產交易中心一般會設有專門辦理不動產異議登記手續的柜臺。根據柜臺工作人員的要求，申請人填寫相關的表格。交納異議登記費。
3、領取房地產管理部門發放的異議同意書，異議登記手續辦理完畢。異議登記辦理完畢后第二天開始計算，15日內到法院起訴。成功立案后，將法院出具的案件受理通知書送回房屋交易中心異議登記柜臺。在整個訴訟期間，房屋過戶都處于凍結的狀態。

農村房產證辦理流程主要是依據《房屋登記辦法》的部分規定。下面為您介紹相關規定，各地根據當地實際情況也有一些具體的規定，建議去當地房屋管理部門去詳細咨詢。

農村房產證辦理流程主要是依據《房屋登記辦法》的如下規定：

第八十二條

依法利用宅基地建造的村民住房和依法利用其他集體所有建設用地建造的房屋，可以依照本辦法的規定申請房屋登記。法律、法規對集體土地范圍內房屋登記另有規定的，從其規定。

第八十三條

因合法建造房屋申請房屋所有權初始登記的，應當提交下列材料：

(一)登記申請書;

(二)申請人的身份證明;

(三)宅基地使用權證明或者集體所有建設用地使用權證明;

(四)申請登記房屋符合城鄉規劃的證明;

(五)房屋測繪報告或者村民住房平面圖;

(六)其他必要材料。

申請村民住房所有權初始登記的，還應當提交申請人屬于房屋所在地農村集體經濟組織成員的證明。農村集體經濟組織申請房屋所有權初始登記的， 還應當提交經村民會議同意或 者由村民會議授權經村民代表會議同意的證明材料。

第八十四條

辦理村民住房所有權初始登記、農村集體經濟組織所有房屋所有權初始登記，房屋登記機構受理登記申請后，應當將申請登記事項在房屋所在地

農村集體經濟組織內進行公告。經公告無異議或者異議不成立的，方可予以登記。

第八十五條

發生下列情形之一的，權利人應當在有關法律文件生效或者事實發生后申請房屋所有權變更登記：

(一)房屋所有權人的姓名或者名稱變更的;

(二)房屋坐落變更的;

(三)房屋面積增加或者減少的;

(四)同一所有權人分割、合并房屋的;

(五)法律、法規規定的其他情形。

第八十六條

房屋所有權依法發生轉移，申請房屋所有權轉移登記的，應當提交下列材料：

(一)登記申請書;

(二)申請人的身份證明;

(三)房屋所有權證書;

(四)宅基地使用權證明或者集體所有建設用地使用權證明;

(五)證明房屋所有權發生轉移的材料;

(六)其他必要材料。

申請村民住房所有權轉移登記的，還應當提交農村集體經濟組織同意轉移的證明材料。農村集體經濟組織申請房屋所有權轉移登記的，還應當提交經村民會議同意或者由村民會議授權經村民代表會議同意的證明材料。

第八十七條

申請農村村民住房所有權轉移登記，受讓人不屬于房屋所在地農村集體經濟組織成員的，除法律、法規另有規定外，房屋登記機構應當不予辦理。

第八十八條

依法以鄉鎮、村企業的廠房等建筑物設立抵押，申請抵押權登記的，應當提交下列材料：

(一)登記申請書;

(二)申請人的身份證明;

(三)房屋所有權證書;

(四)集體所有建設用地使用權證明;

(五)主債權合同和抵押合同;

(六)其他必要材料。

第八十九條

房屋登記機構對集體土地范圍內的房屋予以登記的，應當在房屋登記簿和房屋權屬證書上注明“ 集體土地 ”字樣。

第九十條

辦理集體土地范圍內房屋的地役權登記、預告登記、更正登記、異議登記等房屋登記，可以參照適用國有土地范圍內房屋登記的有關規定。

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1、認清不動產登記的意義
按照相關要求，宅基地和房產不動產登記是要由使用權人主動去申請的。不動產登記就是給自家的宅基地和房產辦“身份證”，有了這個證，才能在拆遷、轉讓、抵押、出租中更好地維護權益，才能避免不必要的矛盾糾紛。
2、正確提交相關材料
需要提交的材料包括：(1)不動產登記申請書;(2)申請人身份證明;(3)不動產權屬證書或者土地權屬來源材料;(4)房屋符合規劃或建設的相關材料;(5)不動產權籍調查表、宗地圖、房屋平面圖以及宗地界址點坐標等有關不動產界址、面積等材料;(6)法律、行政法規以及《實施細則》規定的其他材料。
3、一定得是合法的宅基地和房產
從申請登記需要提交的材料中可以看出，農村宅基地和房產不動產登記需要提供不動產權屬來源相關材料、房屋符合規劃或建設相關材料，也就是說，如果宅基地來源不明、房屋建設不符合規劃，違法占地、違規建設，是不能進行不動產登記的。
4、一定不能留有爭議糾紛
《不動產登記暫行條例》第22條明確指出：尚存在沒有解決的爭議的，不動產登記機構不予登記。如果你的宅基地和房產存有爭議，如想登記辦證要抓緊協調解決，協商不成的，可到土地管理部門申請裁決，如果對裁決不服，可到法院提出行政訴訟，但一定要把爭議糾紛解決登記之前。
5、一定要把所有合法宅基地和房產登記
在農村，有很多繼承而來暫時不住老宅，還有一些全家戶口遷入城市的住宅，這些能不能進行不動產登記呢?根據相關規定，只要你的宅基地和房產來源合法、符合規劃，不管你是不是集體經濟組織成員，不管你是“一戶一宅”還是“一戶多宅”，都能進行不動產登記、頒發不動產登記證書，因此要注意把所有的合法宅基地和房產進行登記領證。
無法辦理不動產登記的農村住宅1、沒有經過審批，私自建設的房子
說到違章建造的農村房屋，情況是很多種的，有很多年前建設的房子大部分都是沒有經過審批的，但是這類房子是要是符合規定的，后期還是可以申請補辦的，針對這類違規占用農村各地的房屋，肯定是屬于違規，沒有辦法辦理產權證。在農村建設房屋沒有取得宅基地使用權證以及沒有獲得建房審批的都屬于違規建設，這類房屋是拿不到產權證的。
2、超出審批面積的房屋
其實這類房屋在農村是存在很多的，很多農民在建設房子的時候，由于沒有嚴格的管理，所以在建造房屋的時候私自占了很多土地面積，但是對于已經建設好的房屋會有其他的措施，但這一類新建的房屋是不能辦理產權證的。
3、建了新房，舊房還沒有拆除的房屋
由于國家是在實施一戶一宅的政策，嚴禁一戶多宅的情況出現，為了控制只要是在農村新建房屋的村民，必須先拆除舊的房屋，所以想要為新建的房屋辦理產權證，舊的房屋沒有拆除是辦理不了的，這一點也是需要注意的。
4、購買別人的房屋，沒有辦理手續
有很多農村戶口的人，因為其他的原因購買別人的房屋，但是由于對產權意識沒有概念，一直都沒有辦理相關過戶手續，但是這類房屋可能是不會受到法律保護的，所以這類房屋也是辦理不了產權證的。
這類房屋都是沒有辦法辦理產權證的，除非是可以提供相關的證明，像購買宅基地協議書或者是律師證明等等。