建設工程施工合同糾紛可以采取協商、調解、仲裁、訴訟方式處理。協商、調解在當事人自愿、平等的基礎上進行，人民調解委員會調解民間糾紛，不收取任何費用。發生建設工程施工合同糾紛的，當事人可以依法向人民法院起訴。

《中華人民共和國仲裁法》
第二條
平等主體的公民、法人和其他組織之間發生的合同糾紛和其他財產權益糾紛，可以仲裁。

《中華人民共和國民事訴訟法》
第一百二十五條
當事人起訴到人民法院的民事糾紛，適宜調解的，先行調解，但當事人拒絕調解的除外。

《中華人民共和國民法典》
第八百零七條
發包人未按照約定支付價款的，承包人可以催告發包人在合理期限內支付價款。發包人逾期不支付的，除根據建設工程的性質不宜折價、拍賣外，承包人可以與發包人協議將該工程折價，也可以請求人民法院將該工程依法拍賣。建設工程的價款就該工程折價或者拍賣的價款優先受償。

法律分析：1、可以和解或調解，發生建設工程承包合同爭議時，當事人可以自行協商和解，或者通過第三者進行調解；

2、建設工程承包合同當事人如果不愿意和解、調解，或者和解、調解不成功，可以根據達成的仲裁協議，將合同爭議提交仲裁機構仲裁。

3、如果建設工程承包合同當事人沒有在合同中訂立仲裁條款，發生爭議后也沒有達成書面的仲裁協議，或者達成的仲裁協議無效，合同的任何一方當事人，都可向人民法院提起訴訟。

法律依據：《中華人民共和國民法典》 第七百九十五條 施工合同的內容一般包括工程范圍、建設工期、中間交工工程的開工和竣工時間；工程質量、工程造價、技術資料交付時間、材料和設備供應責任、撥款和結算、竣工驗收、質量保修范圍和質量保證期、相互協作等條款。

工程承包合同糾紛如何處理：可以通過和解、仲裁、調解、訴訟等方式處理。工程承包合同是確定工程發包單位與承包單位雙方之間權利與義務關系，并具有法律效力的經濟契約。

法律依據：《中華人民共和國民事訴訟法》第一百一十九條

起訴必須符合下列條件：

（一）原告是與本案有直接利害關系的公民、法人和其他組織；

（二）有明確的被告；

（三）有具體的訴訟請求和事實、理由；

（四）屬于人民法院受理民事訴訟的范圍和受訴人民法院管轄。

《中華人民共和民法典》第一百四十三條

具備下列條件的民事法律行為有效：

（一）行為人具有相應的民事行為能力；

（二）意思表示真實；

（三）不違反法律、行政法規的強制性規定，不違背公序良俗。