建設工程工期糾紛訴訟時效為三年。根據我國《民法總則》規定，向人民法院請求保護民事權利的訴訟時效期間為三年。法律另有規定的，依照其規定。訴訟時效期間自權利人知道或者應當知道權利受到損害以及義務人之日起計算。法律另有規定的，依照其規定。法律依據：《中華人民共和國民法典》 第一百八十八條 向人民法院請求保護民事權利的訴訟時效期間為三年。法律另有規定的，依照其規定。訴訟時效期間自權利人知道或者應當知道權利受到損害以及義務人之日起計算。法律另有規定的，依照其規定。但是，自權利受到損害之日起超過二十年的，人民法院不予保護，有特殊情況的，人民法院可以根據權利人的申請決定延長。

1、我國法律規定，工程欠款的訴訟時效為兩年，從知道或應當知道拖欠行為起算。訴訟時效可以通過一定的主張權利行為得以中斷，中斷后訴訟時效可以重新計算。
2、慎重選擇合作伙伴。慎重選擇合作伙伴是非常重要的，合作伙伴的資信能力對承包企業的權利實現是至關重要的，故必須對合作伙伴的情況要有所了解，主要包括合作伙伴的股東構成，企業信譽如何，有無違約記錄，對外負債，主要固定資產現狀如何，項目資金的來源、到位及監管情況等等。
3、審查建設手續。有些建設工程項目未經有關部門審批或者建設方的建設意圖超越審批范圍，如果承包方不問青紅皂白匆忙承建此工程很可能陷于困境，為以后索要工程款造成障礙。
4、請專業人員把好合同關。合同是承包方實現權利的最重要的憑證，合同是否規范、表達是否準確、嚴密、詳細對承包人來講十分關鍵。有的人常常認為施工合同都是格式文本，沒有什么可以發揮的。其實，這種認識是不正確的，建設部推薦的格式文本是為了雙方訂立合同方便、規范，但格式合同里是很多可以選擇的條款，并且有些是空白條款待當事人根據自己的具體情況填寫。簽訂合同時一定要特別注意把工程款的支付方式、支付期限及違約責任約定清楚。
5、完善施工手續。相當一部分工程款糾紛的承包方由于手續不完善，無法取得證據，給對方可乘之機。這種情況下處理糾紛就很被動。故施工過程中，手續一定要完備。比如，工程圖紙設計的更改、選材的變更、施工項目的增加等變簽單一定要有對方施工代表、監理的簽字。