二手房過戶尾款糾紛處理的方式是：協商支付并賠償損失、申請調解處理、起訴要求賠償等，對于二手房過戶的過程中，涉及到一方不支付尾款的行為，已經涉及到違約的情況，是需要追究相關法律責任的。

法律依據：《中華人民共和國民法典》第五百七十九條　當事人一方未支付價款、報酬、租金、利息，或者不履行其他金錢債務的，對方可以請求其支付。

《中華人民共和國民法典》第五百八十三條　當事人一方不履行合同義務或者履行合同義務不符合約定的，在履行義務或者采取補救措施后，對方還有其他損失的，應當賠償損失。

《中華人民共和國民法典》第五百八十四條　當事人一方不履行合同義務或者履行合同義務不符合約定，造成對方損失的，損失賠償額應當相當于因違約所造成的損失，包括合同履行后可以獲得的利益；但是，不得超過違約一方訂立合同時預見到或者應當預見到的因違約可能造成的損失。