1、協商解決：公民間發生的宅地糾紛，必須首先通過協商的方式解決。
2、行政解決：個人間、個人與單位間的糾紛，由鄉級人民政府或縣級以上人民政府處理。
3、司法解決：當事人對有關人民政府的處理決定不服的，可以自收到處理決定通知之日起30日內向人民法院起訴。
宅基地確權有爭議還會繼續確權嗎?
如果農村宅基地系有鄰里土地或房屋有爭議，是不能審批通過確權的，需要先協商處理好糾紛才能提交申請。
幾類常見糾紛的處理方法
1、對因國家、省、市、區建設道路被用作取土用土，且無法復墾的承包地，仍按原農村二輪承包面積確權登記，在備注欄內注明取土面積及用途，但對征用后的承包地多出的應當確認有承包戶以防止發生新的糾紛。
2、對村組內所建公路、機耕路、塘、壩、渠、學校、辦公室等生產公益事業占用的承包地，已辦理征用手續并給與補償的，不在計入承包地。未享受一次性補償的，仍按原農村二輪可承包面積確權登記，在到戶清冊備注欄中注明情況。
3、對二輪土地承包后，個別組以大穩定小調整的形式進行土地調整的，可以按照尊重歷史和現實的原則，在不違背政策法規的前提下，由組民實行民主協商，形成決議，可依據土地承包現狀予以確權登記頒證。
4、承包農戶因子女結婚要求分戶的，由承包雙方出具書面分割協議，在協議分戶后分割的承包面積，予以分戶確權登記。
5、承包戶因離婚要求分戶的，由離婚雙方當事人提供法院判決書或協議書，如果對承包地分割沒有異議的，并提出分戶申請的，分別予以確權登記，如果二輪承包人不同意的除外。
6、農村土地二輪承包期間，除死亡絕戶、全家遷入設區市的農戶外，承包地共有人原則上仍按二輪承包時的共有人登記，但在土地經營權證書備注欄注明農戶人員變動的情況。出嫁女、入贅女婿婚后在現生活家庭的，作為承包共有人登記，本人如提出在娘家有承包地經營權主張的，可根據當事人的意愿，而且娘家無任何異議，可在娘家進行確權登記。
7、承包戶家庭人員死亡的確權。家庭承包人員死亡的，其他成員還存在，也沒有與家庭死亡人員分戶的，家庭承包戶沒有消亡，還按原承包土地確權登記。家庭承包戶消亡的，原家庭承包土地不予確權登記(死亡人員與原家庭承包人是分戶的，死亡人員單獨立戶的;死亡人員的原家庭人員遷入設區的市或轉為國家在職公職人員或婚嫁后在居住地已取得承包田，只剩死亡人員的;死亡人員屬孤寡戶)。
8、承包農戶代種他人承包地的。現代種戶要求確權的，原則上不予確權。
9、農村土地二輪承包時，已經承包到戶的村組小農場或集體土地，可按二輪承包時實際發包到戶的面積確權登記，未承包到戶的原則上暫不確權登記，歸集體所有。

法律主觀：

《中華人民共和國 土地管理法 》第十六條規定，土地糾紛可以通過當事人雙方協商解決。協商必須遵循以下原則：1．自愿。即雙方愿意進行商談，并達成一致協議。任何一方，無論是單位、個人都不得將自己的意志強加給對方。任何單位或個人也不得非法干預。2．合法。雙方當事人達成的協議必須是合法的，不得違反國家法律法規，不得損害社會公共利益及他人的合法權益。該方法適用于因土地權屬不明、范圍不清、地界沒有標志引起的土地所有權和 使用權糾紛 。雙方協商后，應簽訂權屬地界協議書。爭議雙方當事人應當提請當地人民政府國土資源管理部門審查備案。 行政調解 當事人協商不成的，應申請人民政府國土資源行政主管部門調解。國土資源行政主管部門進行調解時應在雙方平等自愿的基礎上進行。調解時，應做到以下幾點：1．查明事實，分清是非，明確責任。2．依照法律法規、政策進行耐心的說服工作，講明利害關系。3．既要符合法律法規，有原則性，又要有靈活性。4．爭取有關部門的配合與支持。 當事人在國土資源行政主管部門主持下自愿達成的協議，應當由國土資源行政主管部門審查批準和雙方當事人蓋章。調解協議書一經送達當事人，即發生法律效力，成為雙方當事人履行法律的依據。如果當事人不愿調解或不服調解，或在調解成立后調解協議書送達前反悔的，依照法律規定，都可以直接要求人民政府處理。 調解時不能帶有自己的感情，不能決而不調，也不能久調不決。調解時間越久，越會給國土資源行政主管部門帶來麻煩和被動。行政調解不成時，要及時進入處理階段。 人民政府處理 人民政府處理即所謂的行政處理。《土地管理法》第十六條規定，單位之間的爭議，由縣級以上人民政府處理；個人之間、個人與單位之間的爭議由鄉級或者縣級以上人民政府處理。鄉級人民政府處理的土地糾紛主要是因為主體一方或雙方為個人的土地權屬爭議，爭議范圍不大，數量少，情節不太復雜。 為了及時解決土地糾紛，方便群眾，這類糾紛宜由鄉級人民政府處理。但是情節復雜，影響較大的權屬爭議，處理后牽涉登記、發證，因鄉級人民政府無權登記、發證，應由縣級人民政府處理為妥。但鄉級人民政府可以承擔受理。 行政處理是仲裁的一種形式，可參照《仲裁法》相關規定進行。國土資源行政主管部門進行處理時，要按照國土資源部《土地權屬爭議調查處理辦法》規定的程序進行，應先認真審閱爭議雙方提交的申請書、答辯書及有關證據材料。要調查事實、核實證據、查閱有關歷史資料和原始憑證，并可請有關部門協助調查或現場勘察。在爭議的基本事實調查清楚后，依據土地管理有關法律法規作出處理決定。處理后，要制作《土地糾紛處理決定書》，決定書要寫明下列各項：1．申請人和被申請人的姓名、地址以及代理人、代表人的姓名、職務。2．申請理由，爭議的事實和要求。3．處理認定的事實、理由和適用的法律。4．處理結果。5．不服處理的補救措施等。 國土資源行政主管部門在處理土地糾紛時，要注意審查申請人所遞交的申請書及有關證據材料，如發現有下列問題，受理機關在收到處理申請書 7個工作日內，應依法作出不予受理的書面通知：1．申請人與爭議的土地沒有直接利害關系。2．申請的具體要求不 符合法律規定 。3．無具體的處理請求和事實依據。4．不作為爭議案件受理的行政區域邊界爭議案件、土地違法案件、 農村土地承包 經營權爭議等案件。受理機關如發現上述問題仍然進入處理程序，將很可能使自己陷入尷尬境地。具體辦案人員如果和當事人有利害關系，應及早回避。當事人如對《土地糾紛處理決定書》不服，可在接到決定書 30日內向人民法院起訴或在 60日內向上級人民政府 提起行政復議 。 訴訟 訴訟權是公民的基本權利之一。任何單位或個人的土地利用 合法權益受到侵害 時，都有權請求國家運用法律來加以保障。訴訟作為土地糾紛處理的一種方法有三種形式，即民事訴訟、行政訴訟和刑事訴訟。 土地糾紛的民事訴訟。《土地管理法》規定的侵權行為，如未發生重大的人身事故，沒有引起生命財產等嚴重損害后果的訴訟屬民事訴訟。這類民事訴訟案件雖經過土地行政主管部門的行政調處，但這種行為是應當事人一方或雙方請求進行的，土地行政主管部門只是調處者，不是訴訟的參與者或關系人，所以不參與該項訴訟。訴訟當事人仍為原來爭議的雙方。這類案件土地行政主管部門進行行政處理，其目的是為了更快更好地解決土地糾紛，減少訴訟，以便及時保護當事人的合法權益，以平息事端。 土地糾紛的行政訴訟。土地糾紛雙方當事人如對人民政府的處理不服，可以自接到處理決定之日起 30日內向人民法院 提起行政訴訟 ，即不服處理一方的當事人作為原告，把人民政府作為被告。最高人民法院《關于房地產案件受理問題的通知》規定，公民、法人或其他組織對人民政府或者其主管部門就土地的所有權或者使用權歸屬的處理決定不服，對人民政府或其主管部門就房地產問題作出的 行政處罰決定 不服，可依法向人民法院提起行政訴訟，由房地產所在地的人民法院行政審判庭依法受理。《最高人民法院關于執行〈中華人民共和國行政訴訟法〉若干問題的解釋》第十六條規定：“農村土地承包人等 土地使用權人 對行政機關處分其使用的農村集體所有土地的行為不服，可以自己的名義提起訴訟。”

法律客觀：

《中華人民共和國土地管理法》
第十四條
土地所有權和使用權爭議，由當事人協商解決；
協商不成的，由人民政府處理。單位之間的爭議，由縣級以上人民政府處理；
個人之間、個人與單位之間的爭議，由鄉級人民政府或者縣級以上人民政府處理。當事人對有關人民政府的處理決定不服的，可以自接到處理決定通知之日起三十日內，向人民法院起訴。在土地所有權和使用權爭議解決前，任何一方不得改變土地利用現狀。

土地確權的原則。土地確權必須確定一些基本原則，這些原則應體現土地確權的精神實質，為正確界定土地權屬指明方向，并在整個土地確權中始終起指導作用。 a、尊重歷史，面對現實的原則； b、有利于生產和生活，有利于社會穩定的原則； c、政策和法律并用原則； d、分階段、區別不同情況處理原則； e、權利設定一般法定原則。 3、二輪承包全家已經轉入非農戶口的承包地的確權。《中華人民共和國 農村土地承包法 》第十六條規定“承包期內，承包方全家遷入設區的市，轉為 非農業戶口 的，應當將承包的耕地和草地交回發包方。承包方不交回的，發包方可以收回承包的耕地和草地”。