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保障性商品房與經濟適用房都是政府提供的社會保障性住房，都屬政策性住房，都是有限產權，購房取得產權未滿5年的不得直接上市交易。區別在于：
一、主要區別：

（1）申請保障性商品房不受收入和資產限制；經濟適用房受到收入與資產的限制。

（2）保障性商品房售價中包含基準地價，價格高于經濟適用房，轉讓時經濟適用房原購買價格與相應地段社會保障性住房上市交易指導價差價的90%向政府繳交增值收益，而保障性商品房僅需向政府繳交60%的增值收益。上市交易指導價由市政府定期制定發布。

(3)經濟適用住房的申請對象是低收入住房困難家庭,保障性商品房的申請對象是非低收入無住房家庭。

（4）申請經濟適用住房的家庭應申報收入和資產,并應符合家庭收入和資產控制標準,經濟適用住房和保障性商品房的價格組成不同,即對低收入家庭和非低收入家庭實行不同的銷售價格。
二、保障性住房和經濟適用房的申請條件不同：
1、符合下列條件，可以請求購買或許租借保障性住房：
(1)   家庭成員之間具有法定的奉養、撫育或許撫育聯絡，且一起生活。

（2）家庭成員具有本市鄉鎮常住戶口達到規定年限，且戶口在提出請求地點地的區(市)到達規定年限。

(3)  住宅面積低于規定限額。

（4）可支配收入和工業低于規定限額。

(5) 在提出請求前的規定年限內，任何成員未發作過住宅銷售行為。

2、符合下列條件，能夠請求購買或許租借經濟適用住宅：
(1)具有本市鄉鎮常住戶口到達規則年限，且戶口在提出請求地點地的區(市)到達規則年限。

(2)年紀符合規定標準。

(3)具有徹底民事行為能力。

（4）住宅面積低于規定限額。

(5)可支配收入和工業低于規定限額。

(6)在提出請求前的規定年限內，未發作過住宅銷售行為。

知識點拓展：

保障性住房和經濟適用房的請求人及請求程序：
家庭請求經濟適用住宅的，整體成員視為一同請求人，應推舉一名具有民事行為條件的成員作為請求人的代表。獨身人士請求經濟適用住宅的，本人為請求人。請求人代表和獨身請求人(以下合稱請求人)應當向戶籍地點地的大街(鄉鎮)社區業務受理效勞中心照實填寫請求文書，提交戶籍、身份證、房地產權屬證明、租借公房憑據、收入和工業證明等資料，并簽署贊同承受住宅和經濟狀況核對且核對成果予以公示的書面文件。

參考資料：

經濟適用房-百度百科

保障性住房-百度百科

經濟適用住房是指政府提供政策優惠，限定套型面積和銷售價格，按照合理標準建設，面向城市低收入住房困難家庭供應，具有保障性質的政策性住房。經濟適用房是具有社會保障性質的商品住宅，具有經濟性和適用性的特點。經濟性是指住宅價格相對于市場價格比較適中，能夠適應低收入家庭的承受能力；適用性是指在住房設計及其建筑標準上強調住房的使用效果。經濟適用住房建設用地以劃撥方式供應，住房建設項目免收城市基礎設施配套費等各種行政事業性收費和政府性基金。經濟適用住房單套的建筑面積一般在60平方米左右。申請購買經濟適用房應當具有當地城鎮戶口；家庭收入符合市、縣人民政府劃定的低收入家庭收入標準；無房或現有住房面積低于市、縣人民政府規定的住房困難標準。法律依據：《經濟適用住房管理辦法》第二條?本辦法所稱經濟適用住房，是指政府提供政策優惠，限定套型面積和銷售價格，按照合理標準建設，面向城市低收入住房困難家庭供應，具有保障性質的政策性住房。本辦法所稱城市低收入住房困難家庭，是指城市和縣人民政府所在地鎮的范圍內，家庭收入、住房狀況等符合市、縣人民政府規定條件的家庭。