辦理的程序：
1、土地登記申請;
2、地籍調(diào)查;
3、權(quán)屬審核;
4、注冊登記;
5、核發(fā)或者更換、注銷土地證書。
城鎮(zhèn)的土地是屬于國家所有，而農(nóng)村的土地是屬于集體所有。而具有使用權(quán)的農(nóng)民則需要辦理土地證，以證明自己擁有使用權(quán)。1、由土地使用者以書面形式到土地所在地的縣級人民政府土地行政主管部門申請辦證；
2、提交申請表、身份證明復(fù)印件、使用權(quán)證明材料等；
3、受理后，實(shí)地測量、調(diào)查；
4、符合條件的，登記造冊并頒發(fā)土地使用權(quán)證。
《中華人民共和國土地管理法實(shí)施條例》
第四條第二款農(nóng)民集體所有的土地依法用于非農(nóng)業(yè)建設(shè)的，由土地使用者向土地所在地的縣級人民政府土地行政主管部門提出土地登記申請，由縣級人民政府登記造冊，核發(fā)集體土地使用權(quán)證書，確認(rèn)建設(shè)用地使用權(quán)。
第六條依法改變土地的所有權(quán)、使用權(quán)，或者因依法買賣、轉(zhuǎn)讓地上建筑物、附著物等而使土地使用權(quán)轉(zhuǎn)移的，必須向縣級以上地方人民政府土地管理部門申請土地所有權(quán)、使用權(quán)變更登記，由縣級以上地方人民政府更換土地證書。
依法買賣、轉(zhuǎn)讓地上建筑物和附著物的，依照國家有關(guān)規(guī)定辦理過戶登記手續(xù)。

一、農(nóng)村自建房要辦理土地使用證
1、土地證可以證明該土地面積歸您享有，在遇到司法問題或強(qiáng)買強(qiáng)占時可以受到法律保護(hù)。每塊需要建房的土地都是需要辦理房屋土地使用證的，這樣才能保障好您的權(quán)益。
2、土地來源分為很多種，比如農(nóng)村機(jī)關(guān)單位劃分房、福利分房等公房轉(zhuǎn)私房的房子，在進(jìn)行土地使用證時需要過戶，過戶必須按照農(nóng)村當(dāng)?shù)氐?%地價來付出讓金。
所以農(nóng)村自建房是要辦理土地使用證的。
二、農(nóng)村辦理土地使用證程序
1、申請
（1）由農(nóng)村村民個人向所屬鄉(xiāng)鎮(zhèn)國土資源管理所提出申請，領(lǐng)取到土地登記申請審批表。
（2）提交個人身份證或農(nóng)村居民戶口簿復(fù)印件一份。
（3）土地權(quán)屬材料(82年5月14日以前，提交村、隊(duì)權(quán)屬來源的證明書；82年的5月14日以后，提交農(nóng)村建房的使用證；97年的4月以后提交農(nóng)村建房申請書、農(nóng)村建設(shè)用地批準(zhǔn)書等)。
2、調(diào)查
由鄉(xiāng)鎮(zhèn)國土資源管理所對申請者的用地進(jìn)行地籍調(diào)查、地籍測量、申請人現(xiàn)場指界、鄰宗地簽字蓋章，填寫地籍的調(diào)查表以及繪制出宗地草圖。
3、審核
先由鄉(xiāng)鎮(zhèn)國土資源管理所進(jìn)行審核，再報縣國土資源局審核，審核用地的材料是否合法，用地界線是否沒有爭議，用地面積是否準(zhǔn)確等等方面。
4、審批
經(jīng)審核符合“用地面積清楚，界址也準(zhǔn)確，權(quán)屬是合法，沒有爭議”原則的，可以批準(zhǔn)并進(jìn)行張榜公布，在公布一個月以內(nèi)無單位或個人對其提出爭議的，由縣人民政府頒發(fā)集體的土地使用證。
三、辦理農(nóng)村土地使用證所需要的資料
1、戶主身份證復(fù)印件(一份)。
2、土地使用權(quán)登記申請表(一份)。
3、地籍調(diào)查界址確認(rèn)表(一份)。
4、農(nóng)村私人建房用地呈報表(已經(jīng)政府批準(zhǔn)的一份)。
5、土地使用登記表(一份)。
6、其他要求提供的證明資料。