正在經營的商鋪要拆，賠償的方式如下：
1、協商賠償，拆遷前，可以與拆遷方進行協商，討論合理的賠償方案。這可能包括經濟補償、安置費用、搬遷費用等。協商過程可以通過雙方自行協商，或者由相關政府機構或仲裁機構協調；
2、法定賠償，根據國家或地區的規定，拆遷方可能需要按照法定標準進行賠償。這些標準可能涉及土地價值評估、商業損失計算、搬遷費用等；
3、訴訟維權，如果拆遷方的賠償方案不合理或未能達成協議，可以通過提起訴訟來維護自己的權益。
賠償具體如下：
1、可以要求支配建筑材料；房屋被依法強拆，但建筑材料仍然是拆遷戶的合法財產，拆遷戶可以要求自行支配，通過變賣、再建等方式挽回損失。實踐中大部分強拆過后，政府為了清理拆遷現場會把建筑材料統一清理，這是損害拆遷戶合法財產權益的行為，如果未能阻止，拆遷戶可以要求政府賠償相應的損失；
2、可以要求破壞建筑內財產的賠償；依據法律規定，執行強拆需要對房屋內的財產進行清點并列出清單，這是因為房屋內的財產仍然屬于拆遷戶的合法財產。如果遇到未清點財產就執行強拆的情形，可以將其定性為違法強拆，要求賠償；
3、可以要求拆遷補助費和臨時安置費；廣義的拆遷補償費包括房屋拆遷補償款、搬遷補助費和臨時安置費，在房屋被認定為“違法建筑”后，房屋拆遷補償款是拿不到的，但搬遷補助費和臨時安置費不得因房屋被定性為“違法建筑”而拒絕支付；
4、可以要求賠償其他合法權益的損失；在拆遷過程中，如果政府不合法、不合理的手段造成了拆遷戶其他合法權益的損失，拆遷戶也可以要求賠償。當然，該賠償的主張要在一定程度上遵循過錯責任原則，也就是要結合雙方的過錯分配責任承擔的比重。
綜上所述，作為商鋪拆遷賠償的受益人，確保知道自己的權益，并根據法律規定堅決維護。在面對拆遷賠償時，可以與拆遷方進行協商，討論并爭取合理的賠償方案，確保拆遷過程中合法權益得到充分保障。
【法律依據】：
《中華人民共和國城鄉規劃法》第六十五條
在鄉、村莊規劃區內未依法取得鄉村建設規劃許可證或者未按照鄉村建設規劃許可證的規定進行建設的，由鄉、鎮人民政府責令停止建設、限期改正；逾期不改正的，可以拆除。
第六十八條
城鄉規劃主管部門作出責令停止建設或者限期拆除的決定后，當事人不停止建設或者逾期不拆除的，建設工程所在地縣級以上地方人民政府可以責成有關部門采取查封施工現場、強制拆除等措施。