回遷房是否有房產證，首先需要看開發商是不是走正規程序審批之后取得的土地使用權，其產生的產權可能會有兩種：(1)沒有經過國家正規手續審批，今后也不可能取得產權證的房產，這類產權就是俗稱的“鄉產權”，屬于違規用地，也是現在正在打擊的一種違規建設行為，屬于“小產權”，不是正規的國家予以承認的產權；(2)經過正規的用地審批程序，比如說屬于危舊房改造、綠化隔離帶改造、舊村改造等性質的，今后可以辦理正規產權。這種產權性質叫做“等同于經濟適用房管理”，也就是說，其產權證下發之后將會被注明為“經濟適用房”產權性質，但是不完全受到經濟適用房制度的制約，取得房產證之后可以作為二手房買賣，但是需要交納成交價格3%的土地出讓金，補交之后等同于商品房性質。
回遷房的概念源于拆遷，這是中國特殊的拆遷政策的產物。拆遷安置過程中，采取貨幣補償的方式，拆遷戶用補償款購買商品房與普通人購買商品房沒有任何區別，都是花錢買房，購房者的身份是相同的。采取的是回遷的方式補償，拆遷房不是商品房，不能當作商品房出售，二者之間存在一些區別：
1、在房價款方面，商品房與拆遷房有區別，商品房可立即上市，且在銀行做抵押進行貸款。而回遷房享受國家政策的優惠，不含土地轉讓金，價格相對低廉且有小產權之說，故不享有商品房的上述權能。拆遷人以回遷房補償被拆遷人的，補償房屋由市政府有關主管部門參照經濟適用住房政策核定價格，并按照經濟適用住房政策管理。
2、商品房和回遷房買賣雙方的關系不同，商品房的購買基礎是開發商和購房者簽訂的《商品房買賣合同》，房屋的價款在合同中進行約定。而拆遷安置房屋的購買基礎是拆遷單位和被拆遷人簽訂的拆遷補償協議，在協議中進行約定。
另外，拆遷的是商品房，回遷房自然是應當商品房。拆遷的是集體土地上的私房，或者是經濟適用房，回遷房的性質一般不是商品房。購買回拆房一定要查清性質。經濟適用房不得買賣;集體土地上的私房拆遷的回遷房，回遷房的所占土地性質，一般是劃撥所得，沒有交土地出讓金，正式辦理過戶手續時，需交土地出讓金。

一、回遷房 辦理房產證 是在房產所在地的房地產管理局辦理的。二、依據《房屋登記辦法》規定：第三十三條申請 房屋所有權 轉移登記，應當提交下列材料：（一） 登記申請書 ；（二）申請人身份證明；（三） 房屋所有權證 書或者房地產權證書；（四）證明房屋所有權發生轉移的材料；（五）其他必要材料。前款第（四）項材料，可以是買賣合同、互換合同、贈與合同、受遺贈證明、繼承證明、分割協議、合并協議、人民法院或者 仲裁委員會 生效的法律文書，或者其他證明房屋所有權發生轉移的材料。三、依據《城市 房地產轉讓 管理規定》第七條房地產轉讓，應當按照下列程序辦理:(一)房地產轉讓當事人簽訂書面轉讓合同;(二)房地產轉讓當事人在房地產轉讓合同簽訂后90日內持房地產權屬證書、當事人的合法證明、轉讓合同等有關文件向房地產所在地的房地產管理部門提出申請，并申報成交價格;(三)房地產管理部門對提供的有關文件進行審查，并在7日內作出是否受理申請的書面答復，7日內未作書面答復的，視為同意受理;(四)房地產管理部門核實申報的成交價格，并根據需要對轉讓的房地產進行現場查勘和評估;(五)房地產轉讓當事人按照規定繳納有關稅費;(六)房地產管理部門辦理房屋權屬登記手續，核發房地產權屬證書。