一、概念區別：
1、商品房買賣合同是指出賣人轉移在建或已建商品房所有權及相關權利予買受人，買受人支付價款的合同。這里的房屋特指商品房，而不包括農村自建住房、單位集資建房等。
2、房產證是購房者通過交易，取得房屋的合法所有權，可依法對所購房屋行使占有、使用、收益和處分的權利的證件。
二、特征區別：
1、商品房買賣合同作為不動產買賣合同的主要類型，具有如下法律特征：
（1）標的物在法律上呈現出復雜的形態。交易的房屋既可能是已建好的房屋，也可能是尚未竣工的房屋，而且還包括建筑物和小區的公用設施、設備的所有權或使用權。
（2）標的物所有權的轉移以登記為成立條件。我國《合同法》第一百三十三條規定，標的物的所有權自標的物交付時起轉移，但法律另有規定或者當事人另有約定的除外。《物權法》第九條規定，不動產物權的設立、變更、轉讓和消滅，經依法登記，發生效力；未經登記，不發生效力，但法律另有規定的除外。
（3）行政干預強烈。由于土地房屋類不動產價值巨大，對國計民生影響很大，國家對房地產行政監管相對較為嚴格。如國家實行登記制度、推行合同示范文本、實行限購政策等。
2、作為證書之一種，房產證具有以下顯著特點：
（1）房產證只能由房地產主管機關發放。
（2）房產證是對特定房屋所有權歸屬的書面證明，并可記載特定房屋共有狀況以及是否設定擔保物權等狀況。基于一物一權主義，房產證以一房屋一房產證為原則，即一個具有獨立建筑結構與使用功能的房屋 (包括區分所有的房屋)只有一個所有權，在不動產登記上只能有一項所有權登記，并且據此只能發放一個房產證。
（3）房產證只能向特定房屋的所有權人發放，如房屋系共有，在房屋所有權證之外，還可向共有權人發放共有權證。
（4）房產證是登記機關在對特定房屋權屬情況進行登記之后，向特定權利人發放的權屬證明，房產證的內容應與登記簿的內容相一致。
三、所需材料區別：
1、商品房買賣合同登記的申報材料有商品房買賣合同登記申請表、雙方簽訂的重慶市商品房買賣合同、預售商品房分層分戶平面圖、銀行進帳憑證、開發企業法定代表人授權委托書及代理人身份證明、預購人是法人或其他組織應提交法人登記證書或者授權登記文件及代理人的授權委托書和身份證明、預購人是個人的提交身份證明、所購房屋是現房的須提交《房地產權證》、預購人是境外機構組織人員的提交經重慶市涉及國家安全事項建設項目審批辦公室審核同意的《審查意見通知書》原件。
2、房產證所需材料：
（1）買賣雙方進行房產交易后一個月內持房屋買賣合同和其他證件到房地產交易所辦理買賣過戶登記。去辦理登記需要攜帶身份證、戶口本、《商品房銷售合同》等證件和資料。
（2）買賣雙方接到交易所辦理過戶手續的通知后，應攜帶身份證、戶口本、圖章等，在交納了手續費、契稅、印花稅后就可以辦理過戶手續。交易所會給買方發放房產賣契，原則上房產證需買賣雙方共同辦理。買賣雙方或一方因故不能辦理買賣過戶手續和產權登記的，可出具委托書委托代理人代為辦理。
（3）辦理完買賣過戶手續后，買方應持房地產交易所發給的房產賣契，在三個月內到房屋所在地的市或區（縣）的房屋土地管理局登記申請。辦理申請需要的證件和資料有：賣方所有的整棟樓的房屋所有權證、《商品房購銷合同》、商品房銷售發票存根復印件、、身份證復印件、《房屋所有權轉移登記表》、《墻界表》、《面積計算表》。
擴展資料：
商品房買賣合同是指房地產開發企業將尚未建成或者已經竣工的房屋向社會銷售，轉移房屋所有權于買受人，買受人支付價款的合同。其中，商品房的認購、訂購、預訂等協議具備《商品房銷售管理辦法》第十六條規定的商品房買賣合同的主要內容，并且出賣人已經按照約定收受購房款的，該協議應當認定為商品房買賣合同（2001年4月4日由中華人民共和國建設部發布，自2001年6月1日起施行的《商品房銷售管理辦法》第十六條規定：商品房銷售時，房地產開發企業和買受人應當訂立書面商品房買賣合同。
房產證（Premises Permit）購房者通過交易，取得房屋的合法所有權，可依法對所購房屋行使占有、使用、收益和處分的權利的證件。即《房屋所有權證》，是國家依法保護房屋所有權的合法憑證。房屋所有者憑證管理和使用自己的房屋。房產證包括房屋所有權證和房屋共有權證，在通常意義上，房產證是房屋所有權證的簡稱，是由不動產登記機關發放的證明房屋所有權歸屬的書面憑證。
按照我國現行的房屋所有權登記制度，房屋登記是城鎮房屋權利歸屬的法定公示方法。2011年8月下旬稅務部門表示房產加名按房價一半征契稅 。2013年4月，北京市住建委稱，為防止虛假房屋買賣等行為，保障房屋交易安全，今后北京購房人拿到的房產證將可自愿并免費設立密碼，房屋如需辦理轉讓、變更、抵押等登記業務時，須提供密碼才可辦理。預計于2013年下半年實施。
例如，在房屋買賣時，房產證的交付并不產生房屋所有權移轉的效果，房產證受讓人并不能以取得出賣人的房產證為由，主張其已經取得房屋所有權。房產證遺失后，房屋所有權人并不因此失去房屋所有權，權利人可根據登記簿的記載主張和行使權利，并可要求機關根據登記簿上的記載補發房產證。可見，房產證不能脫離登記簿的記載而發揮其證明作用。
所謂“房屋權屬證書是權利人依法擁有房屋所有權并對房屋行使占有、使用、收益和處分權利的唯一合法憑證”的規定，實際上顛倒了房產證和不動產登記簿的關系，誤解了物權公示的原則、意義和適用規則。房產證也不具有代表房屋所有權的功能，這一點與證券大不相同。同是書面憑證，證書與證券在性質上的主要區別是：證書僅僅是證明法律事實的書面憑證，房產證作為權利證書，只能證明特定房屋所有權歸屬于誰，而不能代表其上記載的權利；證券不僅能夠證明權利的歸屬，如當事人在訴訟中即使只有持有證券這一孤證，亦可充分證明其擁有證券上的權利，而且還能代表其上記載的權利，移轉交付證券即產生權利移轉的效力。
當然，在與房屋有關的交易活動中，房產證還是能夠起到一定的證明作用。但是，房產證所起到的只是初步的證明作用。在房屋買賣的締約過程開始時，欲出賣房屋的一方出示房產證，可以初步證明自己是房屋所有權人，有關的締約談判可以據此展開。如果雙方初步達成一致并且準備簽訂房屋買賣合同時，一方當事人不應只根據對方房產證的記載就與之訂立合同，而應當到房地產主管機關查閱房屋登記簿，以了解對方是否為真正的房屋所有權人、該房屋上是否設定了抵押等情況，因為只有登記簿上的記載才是具有公信力的權利歸屬證明。
在房屋買賣合同履行時，賣方向買方交付房產證，并不產生房屋所有權移轉的法律效果，必須在不動產登記簿上進行所有權主體的變更登記(即通常所說的“過戶登記”)，才能產生房屋所有權移轉的法律效力。嚴格說來，在房屋所有權移轉過程中，房產證是不能隨之移轉的，房地產主管機關在進行過戶登記之后，不應將賣方原先持有的房產證經變更記載后轉交給買方，而應當將賣方原先持有的房產證收回，再向買方發放新的房產證。
可見，在房屋交易過程中，房產證的證明作用是極為有限的，遠不如生活中常見的其他一些證書，如身份證、畢業證、合同書等。當然，盡管房產證的交付不具有物權法上的效力，但在審判實踐中據此判斷是否存在債的關系方面，還是有一定的證明意義。
例如，房產證的交付可以證明雙方當事人之間可能存在房屋買賣合同關系，可以證明賣方有交付房屋所有權的意思表示；在涉及房屋抵押的交易活動中，抵押權人占有房產證可以證明抵押合同關系的存在等等。
參考資料：百度百科-商品房買賣合同 百度百科-房產證
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