派出所調解書會在案卷中歸檔，但不會作為其他檔案用途。
通常民事糾紛引起的打架斗毆等治安案件，由派出所依法調解，在調解后該協議依法應長期保存，時限為60年。此外，未生效的調解書必須由司法確認，否則不具備法律效力。
民事糾紛，由法院負責管轄并裁決，法院會對民事糾紛案件存檔。所以，民事糾紛案件，法院當然會有案件記錄(案底)。但這里的案底只是法院的案件檔案，不是行政處罰案底，也不是刑事犯罪案底。
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【法律依據】：
《中華人民共和國檔案法》第十九條國家檔案館保管的檔案，一般應當自形成之日起滿三十年向社會開放。經濟、科學、技術、文化等類檔案向社會開放的期限，可以少于三十年，涉及國家安全或者重大利益以及其他到期不宜開放的檔案向社會開放的期限，可以多于三十年，具體期限由國家檔案行政管理部門制訂，報國務院批準施行。檔案館應當定期公布開放檔案的目錄，并為檔案的利用創造條件，簡化手續，提供方便。中華人民共和國公民和組織持有合法證明，可以利用已經開放的檔案。