申請執行期限二年的意思是當事人向法院申請強制執行生效的法律文書中義務人履行義務的期限是兩年。
申請執行的期限為兩年，從法律文書規定履行期間的最后一日起計算。申請執行是指根據生效法律文書，享有權利的一方當事人在對方拒絕履行義務的情況下，向人民法院提出申請，請求人民法院強制執行。申請執行期限是指法律文書生效以后，義務人不履行法律文書確定的義務時，權利人依法享有的向人民法院申請強制執行的時間期限。
申請執行流程如下：
1、申請
發生法律效力的民事判決、裁定以及刑事判決、裁定，當事人必須履行。一方拒絕履行的，對方當事人可以向人民法院申請執行，也可以由審判員移送執行員執行。
2、法院受理
當事人、利害關系人認為執行行為違反法律規定的，可以向負責執行的人民法院提出書面異議。當事人、利害關系人提出書面異議的，人民法院應當自收到書面異議之日起15日內審查，理由成立的，裁定撤銷或者改正；理由不成立的，裁定駁回。
3、申請復議
當事人、利害關系人對裁定不服的，可以自裁定送達之日起10日內向上一級人民法院申請復議。
4、向被執行人發出執行通知
執行員接到申請執行書或者移交執行書，應當向被執行人發出執行通知，責令其在指定的期間履行，逾期不履行的，強制執行。
綜上所述，申請執行期限兩年即是判決書規定的期限期滿日，就是開始計算兩年執行時效的時間。比如，判決生效日，2年內履行，就是從判決生效日再加2年期滿開始算。
【法律依據】：
《中華人民共和國民事訴訟法》第二百四十六條
申請執行的期間為二年。申請執行時效的中止、中斷，適用法律有關訴訟時效中止、中斷的規定。
前款規定的期間，從法律文書規定履行期間的最后一日起計算；法律文書規定分期履行的，從最后一期履行期限屆滿之日起計算；法律文書未規定履行期間的，從法律文書生效之日起計算。
第二百四十七條
執行員接到申請執行書或者移交執行書，應當向被執行人發出執行通知，并可以立即采取強制執行措施。

執行時效法律規定：
1、執行期間；執行期間是六個月，如果法院自收到申請執行書之日起超過六個月未執行的，申請執行人可以向上一級人民法院申請執行；
2、申請期間；申請期間是二年，從法律文書規定履行期間的最后一日起計算。
申請執行需要提交以下文件：
1、申請執行書，申請書必須載明您和被執行人的基本情況以及請求執行的事項；
2、作為執行根據的生效法律文書，該法律文書須具有給付內容，執行標的和明確的被執行人；
3、身份證明；
4、如果作為繼承人或者權利承受人申請執行，還應當提交繼承或者承受權利的證明文件，被執行人在生效法律文書確定的期限內未履行義務。
法律依據：《中華人民共和國民事訴訟法》第二百三十九條
申請執行的期間為二年。申請執行時效的中止、中斷，適用法律有關訴訟時效中止、中斷的規定。
前款規定的期間，從法律文書規定履行期間的最后一日起計算；法律文書規定分期履行的，從規定的每次履行期間的最后一日起計算；法律文書未規定履行期間的，從法律文書生效之日起計算。