法人辭職了公司不配合變更可以起訴。
起訴的具體程序如下：
1、當事人起訴，首先應提交起訴書，并按對方當事人人數提交相應份數的副本；
2、根據誰主張誰舉證原則，原告向法院起訴應提交材料；
3、當事人向法院提交書證，應填寫一式兩份證據清單，詳細列明提交證據的名稱、頁數；
4、立案庭在當事人履行必須的手續和交齊有關證據材料之后，在七天內，對符合立案條件的，辦理立案手續，對不符合立案條件的，依法裁定不予受理；
5、當事人應在收到受理通知書之日起七天內預交案件受理費和其他訴訟費用；
6、立案手續后，案件由法院排期開庭，當事人應服從法院的各項工作安排，并于結案后到財務室結算訴訟費用。
公司變更法人的方法如下：
1、領取《公司變更登記申請表》，變更營業執照，填寫公司變更表格，加蓋公章，整理章程修正案、股東會決議、承諾書、公司營業執照正副本原件、到工商局辦證大廳辦理如果存在股權轉讓須填寫股權轉讓協議；
2、變更組織機構代碼證，填寫企業代碼證變更表格，加蓋公章，整理公司變更通知書、營業執照副本復印件、企業新法人身份證復印件、老的代碼證原件到質量技術監督局辦理；
3、變更稅務登記證，變更銀行信息，若材料無疑問或補充完畢并通過則領取變更通知書，在規定時間去工商局領取新的營業執照。
綜上所述，公司不配合變更法人信息的，當事人可以向法院申請起訴，提交相應的證據材料，法院會對案件進行審理判決。
【法律依據】：
《中華人民共和國市場主體登記管理條例》第八條
市場主體的一般登記事項包括：
（一）名稱；
（二）主體類型；
（三）經營范圍；
（四）住所或者主要經營場所；
（五）注冊資本或者出資額；
（六）法定代表人、執行事務合伙人或者負責人姓名。
除前款規定外，還應當根據市場主體類型登記下列事項：
（一）有限責任公司股東、股份有限公司發起人、非公司企業法人出資人的姓名或者名稱；
（二）個人獨資企業的投資人姓名及居所；
（三）合伙企業的合伙人名稱或者姓名、住所、承擔責任方式；
（四）個體工商戶的經營者姓名、住所、經營場所；
（五）法律、行政法規規定的其他事項。

首先針對關聯性的情況，離職后的法定代表人可以書面的方式向公司明確要求，進行法定代表人的變更登記。如果是董事長或者執行董事的，可以通過召開股東會的方式，要求變更法定代表人。如果是經理的話，則應向公司董事會發出正式的書面通知，要求召開股東會，提出變更法定代表人的請求;其次，除了對于公司發出書面通知外，還應該向與公司存在貿易往來的單位，如銀行、交易對手等發出明確的書面通知，告知法定代表人已經發生變更，提醒注意簽約的主體情況等，這種告知行為一方面可以督促公司盡快辦理法定代表人的變更登記手續，另一方面也可以作為在發生糾紛時的證據之一;最后，在窮盡上述幾種途徑后，公司仍拒不辦理變更登記時，則只能通過司法途徑進行解決，請求變更公司法定代表人登記。      一、公司法人逃跑應如何處理      公司法人逃跑如何處理:      1、公司法定代表人因個人債務問題失蹤的，可以變更法定代表人;      2、因法定代表人個人原因造成公司財產損失的，報警處理;      3、公司法定代表人應當依照公司章程的規定，由董事長、執行董事或者經理擔任，并登記。變更公司法定代表人的，應當辦理變更登記。      二、法人去世了怎么更改法人      法人去世了，更改法人的流程如下:      1、首先要向當地公證處申請，請求出具對法人已經死亡的公證書;      2、新法人代表準備好身份證原件與復印件;      3、向當地工商局提交公證書、繼承人身份證原件與復印件等;      4、到質監局更換組織機構代碼證;      5、稅務機關變更稅務登記證;      6、到開戶銀行變更法人名字。      一、公司法人變更的資料有以下內容:      1、公司變更登記申請書;      2、股東會決議;      3、章程修正案;      4、對原法人的免職文件;      5、對新法人的任職文件;      6、原法人身份證復印件;      7、新法人身份證復印件;      8、新法人履歷表及簽字備案書等。      二、公司法人變更條件是:      1、變更公司法人需要公司股東會、股東大會或者董事會作出關于變更事項的決議;      2、需要準備公司法定代表人簽署的變更登記申請書等公司登記機關規定要求提交的文件。      總而言之，公司一般是企業法人，法人是可以以自己的財產獨立承擔民事責任的，但是公司的法人代表一般是根據公司的章程選出來的，公司的法人代表是需要到有關的部門的登記的，如果要變更也要及時到有關的部門進行變更。公司法人過世，公司可以召開股東會、股東大會作出變更決議，再攜帶相關材料到公司登記機關辦理變更登記。      【本文關聯的相關法律依據】      《中華人民共和國公司法》第十三條公司法定代表人依照公司章程的規定，由董事長、執行董事或者經理擔任，并依法登記。公司法定代表人變更，應當辦理變更登記。

法定代表人不同意變更的處理：只要股東會或股東大會依法作出了變更的決議或者決定的，即使法定代表人不同意，其決議或決定也是有效的，法定代表人需要按照決議或者決定的內容履行，依法辦理變更的手續。
【法律依據】
《中華人民共和國公司登記管理條例》第二十七條公司申請變更登記，應當向公司登記機關提交下列文件：（一）公司法定代表人簽署的變更登記申請書；（二）依照《公司法》作出的變更決議或者決定；（三）國家工商行政管理總局規定要求提交的其他文件。公司變更登記事項涉及修改公司章程的，應當提交由公司法定代表人簽署的修改后的公司章程或者公司章程修正案。變更登記事項依照法律、行政法規或者國務院決定規定在登記前須經批準的，還應當向公司登記機關提交有關批準文件。第三十條公司變更法定代表人的，應當自變更決議或者決定作出之日起30日內申請變更登記。