法律分析：在此種情況下，實踐中往往有股權轉讓合同之一方當事人(出讓方或受讓方)或公司以未辦理工商登記為由要求確認其轉讓無效。但在目前我國的立法中，尚未見有有限責任公司股東轉讓股權，需于辦理工商變更手續后方為生效的規定。

法律依據：《中華人民共和國公司法》 第三十三條 記載于股東名冊的股東，可以依股東名冊主張行使股東權利。公司應當將股東的姓名或者名稱及其出資額向公司登記機關登記;登記事項發生變更的，應當辦理變更登記。未經登記或者變更登記的，不得對抗第三人。上述規定將公司變更登記作為股權轉讓的對抗條件，當事人未辦理登記手續不影響股權轉讓合同的效力。

法律分析：協議本身是有效的。經過工商變更登記才能完成股權的轉讓。股權轉讓協議的效力，與是否辦理變更登記沒有關系。股權轉讓協議的效力與以下事項有關：

（1）股權轉讓程序是否符合公司法及公司章程的規定。按照公司法的規定，將股權轉讓給股東以外的人，需要經過其他股東的過半數同意，還要確保其他股東的優先購買權。公司章程另有規定的，從其規定。

（2）股權轉讓協議有沒有法律規定的合同無效的情形。主要是一方以欺詐、脅迫的手段訂立合同，損害國家利益；惡意串通，損害國家、集體或者第三人利益；以合法形式掩蓋非法目的；損害社會公共利益；違反法律、行政法規的強制性規定。

（3）股權轉讓是否涉及行政審批手續，如果涉及審批手續的，股權轉讓合同效力也會有影響。

（4）如果是國有股權轉讓，則要考慮是否履行了國有資產處置的法定程序。

法律依據：《中華人民共和國民法典》

第一百四十三條 具備下列條件的民事法律行為有效：

(一)行為人具有相應的民事行為能力;

(二)意思表示真實;

(三)不違反法律、行政法規的強制性規定，不違背公序良俗。

第一百四十八條 一方以欺詐手段，使對方在違背真實意思的情況下實施的民事法律行為，受欺詐方有權請求人民法院或者仲裁機構予以撤銷。

第四百八十三條 承諾生效時合同成立，但是法律另有規定或者當事人另有約定的除外。