食品經營許可證的辦理流程如下：
一、申請：申報人通過食品藥品監督管理局網進行網上申報。
二、受理：網上提交成功后5個工作日內對資料進行審核，材料不齊全或不符合要求的，通過網上審批系統向申請人發出補正材料通知；不屬于本部門職權范圍或申請事項不需行政許可的，不予受理，并通過網上審批系統向申請人發出不予受理的理由及通知；符合申請要求的，向申請人發出電子《受理通知書》。
三、審查：審查過程中，如有需配合環節，申請人應積極配合。
四、決定：決定機構作出準予許可或不予許可的決定。
五、制證發證：
1、準予許可的事項，網上即時生成《藥品生產許可證》電子證書。生成電子證書的同時，即時通知申請人可獲取行政許可電子證書，或申請人可憑《受理通知單》和身份證領取證件。
2、不予許可的事項，網上發出電子《不予行政許可決定書》，系統即時通知企業，并同步在電子證書公示平臺上公示。
在其中，大家需要注意的是：食品經營許可證是到食藥監局辦理，在食藥監局網站上可以查詢所需的資料，有疑問的可以打電話到食藥監局進行咨詢。另外，如果食藥監局和工商局合并了，便是到市場監督局。
擴展資料：
一、食品經營許可證網上申請
1、企業用戶注冊登陸
企業用戶要想進行網上辦理食品流通許可業務，先注冊用戶，然后登陸進入系統進行網上申辦。
2、業務類型說明
選擇自己要辦理的選擇業務類型然后進行登記辦理。
3、填寫對應的申請信息
在對應的業務類型中填寫相應的信息，填寫完后請認真核對信息的正確性，點擊”保存“按鈕進行保存，點擊”打印“按鈕，打印出相應的申請表和申請回執。
4、到窗口申請
在網上進行了預報后，帶齊申請材料到對應的窗口(食藥監窗口)進行辦理。同意受理之后，會上門核查場地，這個環節過了，就等著拿證了。
法律依據：
《中華人民共和國行政許可法》第二十九條公民、法人或者其他組織從事特定活動，依法需要取得行政許可的，應當向行政機關提出申請。申請書需要采用格式文本的，行政機關應當向申請人提供行政許可申請書格式文本。申請書格式文本中不得包含與申請行政許可事項沒有直接關系的內容。申請人可以委托代理人提出行政許可申請。但是，依法應當由申請人到行政機關辦公場所提出行政許可申請的除外。

食品經營許可證的辦理要求如下：
1、營業執照原件及復印件；
2、經營者的身份證原件及復印件；
3、經營者及從業人員健康證原件及復印件；
4、食品安全管理人員身份證復印件及培訓證明資料；
5、經營場所周邊環境圖、平面布局圖（圖紙需打印）；
6、保證食品安全的規章制度。
食品許可證辦理需要的材料如下：
1、食品經營許可證申請書；
2、公司營業執照復印件；
3、食品安全制度管理文本；
4、食品安全管理人員健康證、培訓證復印件（一般是公司法人）；
5、公司里從業人員健康證（2人以上）復印件，只要公司里面有健康證的員工即可；
6、公司平面圖、地理位置圖；
7、法人身份證復印件2份；
8、委托代理人身份證復印件。
綜上所述，生產生產許可證是由國家相關機構頒發的權利憑證，授權企業在規定范圍內以符合安全、品質標準的方式生產一定范圍內的產品。它的頒發是為了保證產品的質量與安全，其頒發通常會根據企業的生產設備、管理制度、技術規范等因素進行綜合評估，只有符合相關要求的企業才會獲得頒發。
【法律依據】：
《食品流通許可證管理辦法》第三條
在流通環節從事食品經營的，應當依法取得食品流通許可。
取得食品生產許可的食品生產者在其生產場所銷售其生產的食品，不需要取得食品流通的許可；取得餐飲服務許可的餐飲服務提供者在其餐飲服務場所出售其制作加工的食品，不需要取得食品流通的許可。