股權變更需要繳納以下兩種費用：　1. 個人所得稅：根據《中華人民共和國個人所得稅法》及其實施條例的規定，原股東取得股權轉讓所得，應按“財產轉讓所得”項目征收個人所得稅。如股權轉讓方是個人，需要交納個人所得稅。交納標準：按照轉讓成交價減去當初出資價和費用，按照此差額的20%交納個人所得稅；2. 印花稅：企業企業股權轉讓所立的書據，雙方按照產權轉移就股權轉讓書據計貼印花稅。適用稅率為書據所載金額5‰。

法律依據：《中華人民共和國個人所得稅法》第三條 個人所得稅的稅率：一、工資、薪金所得，適用超額累進稅率，稅率為百分之三至百分之四十五。二、個體工商戶的生產、經營所得和對企事業單位的承包經營、承租經營所得，適用百分之五至百分之三十五的超額累進稅率(稅率表附后)。三、稿酬所得，適用比例稅率，稅率為百分之二十，并按應納稅額減征百分之三十。四、勞務報酬所得，適用比例稅率，稅率為百分之二十。對勞務報酬所得一次收入畸高的，可以實行加成征收，具體辦法由國務院規定。五、特許權使用費所得，利息、股息、紅利所得，財產租賃所得，財產轉讓所得，偶然所得和其他所得，適用比例稅率，稅率為百分之二十。

公司股權變更會產生哪些費用，一、股權變更可能產生的費用 1、個人所得稅 在公司股權轉讓的過程里，股東在轉讓股權的時候獲得了收益，那么是需要按照20%的個人所得稅繳納 2、企業所得稅 如果在股權轉讓的時候，發生在企業之間，那么出讓方和受讓方都需要繳納一定的企業所得稅 3、印花稅 企業經營過程中，涉及到股份轉讓的，需要按照規定交易印花稅 二、公司股權變更流程 1、如果是對外的股權變更，需要先召開股東會議，經過股權大會決議允許通過后，才可以進行公司的股權變更，同時要公司的其余股東確定放棄優先購買權的承諾或證明 2、與第三方簽訂股權轉讓協議，雙方約定股權的轉讓價格、債務債權、股權轉讓款等等一系列的相關事項 3、召開新股東會議，經過新股東會表決同意，任命新股東的相關職務，參加會議的股東在《股東會決議》上簽字蓋章。討論新的公司《章程》，通過后在新的公司《章程》上簽字蓋章 4、在章程文件修改簽署的30日內，需要向公司的工商管理部門提交股權轉讓協議，以及股東會議決議和公司的新章程等等，進行工商的股權變更登記 三、公司股權變更的注意事項 1、公司外部股權變更，是需要先經過公司內部的股東進行決議后才可以進行變更的， 內部的股權變更則不需要股東大會的決議，并且公司內部的股東對于該股權是具有優先購買權的 2、某些公司股權變更是需要涉及到相關的審批的，比如說主管部門的審批。常見的需審批的有國有股權企業，外資企業等等 3、股權雙方需要對股權的相關責任進行明確的承諾與保證 4、公司如果發生了股權變更，需要注意在規定的時間內進行公司股權的變更

公司股權變更的費用包括印花稅、個人所得稅等稅費，其中印花稅是變更股權的總價款的萬分之五，而個人所得稅適用的是比例稅率，應當由轉讓人，按照百分之二十的稅率來繳納。
【法律依據】
《中華人民共和國個人所得稅法》第二條
下列各項個人所得，應當繳納個人所得稅：
（六）利息、股息、紅利所得；
（七）財產租賃所得；
（八）財產轉讓所得；
（九）偶然所得。
第三條
個人所得稅的稅率：
（一）綜合所得，適用百分之三至百分之四十五的超額累進稅率（稅率表附后）；
（二）經營所得，適用百分之五至百分之三十五的超額累進稅率（稅率表附后）；
（三）利息、股息、紅利所得，財產租賃所得，財產轉讓所得和偶然所得，適用比例稅率，稅率為百分之二十。
第六條
應納稅所得額的計算：
（五）財產轉讓所得，以轉讓財產的收入額減除財產原值和合理費用后的余額，為應納稅所得額。
（六）利息、股息、紅利所得和偶然所得，以每次收入額為應納稅所得額。