清算公司的清算程序如下：
1、成立清算組，人民法院應當在宣告企業(yè)破產(chǎn)之日起十五日內(nèi)成立清算組，如果是有限責任公司的，清算組應由由股東組成，如果是股份有限公司的，清算組應由董事或者股東大會確定的人員組成，在破產(chǎn)宣告后，清算組成員由法院指定成立；
2、清算組接管破產(chǎn)公司，破產(chǎn)企業(yè)由清算組接管，負責對破產(chǎn)企業(yè)的財產(chǎn)進行管理、清理、估價、處理、分配，破產(chǎn)財產(chǎn)分配，由清算組提出分配方案，在債權人會上討論通過，報人民法院批準后由清算組具體執(zhí)行；
3、債權人會議作為一個臨時性的機構，僅代表債權人的利益，而不能代表債務人的利益，不能管理和清算破產(chǎn)人的財產(chǎn)，清算終結，申請人民法院裁定破產(chǎn)終結，注銷登記。
法律依據(jù)：《中華人民共和國公司法》第一百八十六條
清算組在清理公司財產(chǎn)、編制資產(chǎn)負債表和財產(chǎn)清單后，應當制定清算方案，并報股東會、股東大會或者人民法院確認。
公司財產(chǎn)在分別支付清算費用、職工的工資、社會保險費用和法定補償金，繳納所欠稅款，清償公司債務后的剩余財產(chǎn)，有限責任公司按照股東的出資比例分配，股份有限公司按照股東持有的股份比例分配。
清算期間，公司存續(xù)，但不得開展與清算無關的經(jīng)營活動。公司財產(chǎn)在未依照前款規(guī)定清償前，不得分配給股東。
第一百八十八條
公司清算結束后，清算組應當制作清算報告，報股東會、股東大會或者人民法院確認，并報送公司登記機關，申請注銷公司登記，公告公司終止。

企業(yè)破產(chǎn)清算意味著宣告股份有限公司破產(chǎn)，由清算組接管公司，對破產(chǎn)財產(chǎn)進行清算、評估和處理、分配。企業(yè)破產(chǎn)清算，一般由人民法院依據(jù)有關法律的規(guī)定，組織股東、有關機關及有關專業(yè)人士組成。包括國有資產(chǎn)管理部門、政府主管部門、證券管理部門等，專業(yè)人員一般包括會計師、律師、評估師等。
企業(yè)破產(chǎn)清算是根據(jù)《公司法》中的破產(chǎn)清算規(guī)定執(zhí)行的，是處理企業(yè)經(jīng)濟上破產(chǎn)時債務如何清償?shù)囊环N法律制度，即在債務人喪失清償能力時，由法院強制執(zhí)行其全部財產(chǎn)，公平清償全體債權人的法律制度。破產(chǎn)專指破產(chǎn)清算制度，即對債務人宣告破產(chǎn)、清算還債的法律制度。
公司破產(chǎn)清算的程序是：
(一)成立清算組。人民法院應當在宣告企業(yè)破產(chǎn)之日起十五日內(nèi)成立清算組，接管破產(chǎn)企業(yè)，清算組應當由股東、有關機關及專業(yè)人士組成;
(二)清算組接管破產(chǎn)公司。人民法院宣告企業(yè)破產(chǎn)后，破產(chǎn)企業(yè)由清算組接管，負責對破產(chǎn)企業(yè)的財產(chǎn)進行管理、清理、估價、處理、分配，代表破產(chǎn)企業(yè)參與民事活動，其行為對人民法院負責并匯報工作;
(三)破產(chǎn)財產(chǎn)分配。分配破產(chǎn)財產(chǎn)，由清算組提出分配方案，在債權人會上討論通過，報人民法院批準后由清算組具體執(zhí)行;
清算組分配破產(chǎn)財產(chǎn)前，首先應撥付清算費用，包括：
1、破產(chǎn)財產(chǎn)管理、變賣、分配所需的費用;
2、破產(chǎn)案件訴訟費;
3、為債權人的共同利益而在破產(chǎn)程序中支付的其他費用。
(四)清算終結。破產(chǎn)財產(chǎn)清算分配完畢，由清算組向人民法院匯報清算分配工作的情況，并申請人民法院裁定破產(chǎn)終結，未得到清償?shù)膫鶛啵辉龠M行清償;
(五)注銷登記。企業(yè)破產(chǎn)，破產(chǎn)財產(chǎn)分配完畢，企業(yè)法人依法終止其民事行為能力，清算組向破產(chǎn)公司的原登記機關申請注銷原公司登記。

企業(yè)破產(chǎn)清算的目的是什么？
一、保護股東權益
公司破產(chǎn)危機的原因復雜多樣，可能是正常生產(chǎn)經(jīng)營出現(xiàn)決策失誤，也可能是從事欺詐投資者的事務，面臨破產(chǎn)困境。那么，在企業(yè)破產(chǎn)清算過程中，如何保護股東的權益呢？
這時候通過《企業(yè)破產(chǎn)法》中的清算程序來查找是否有公司高管需要承擔責任，也是恰到好處的。如果有責任人，股東可以在《公司法》或《證券法》提起訴訟。
另外，法律也給了股東選擇權，是清算還是重整，可以根據(jù)自己的判斷來選擇。如果啟動重組程序，公司可能會恢復活力，股東也不會血本無歸。
第二，保護債權人權益
1.及時申請公司債務人破產(chǎn)。
根據(jù)《破產(chǎn)法》第七條規(guī)定:債務人不能清償?shù)狡趥鶆盏模瑐鶛嗳丝梢韵蛉嗣穹ㄔ荷暾垖鶆杖诉M行重整或者破產(chǎn)清算。公司破產(chǎn)的原因往往是經(jīng)營不善。因此，公司作為債權人，一旦發(fā)現(xiàn)債務人不能清償?shù)狡趥鶆眨屹Y產(chǎn)不足以清償全部債務或明顯缺乏清償能力，應依法及時申請破產(chǎn)，防止債務人財務狀況進一步惡化。這就需要公司關注債務人的經(jīng)營情況，及時保護其合法權益。
2、區(qū)分該債權是否屬于破產(chǎn)債權。
所謂破產(chǎn)債權，是指對破產(chǎn)企業(yè)的債權，只有通過破產(chǎn)程序才能得到補償。并非所有針對破產(chǎn)人的債權都是破產(chǎn)債權。抵押、質(zhì)押、留置等有財產(chǎn)擔保的債權。，優(yōu)先于其他債權人，所以有擔保的債權可以不經(jīng)過破產(chǎn)程序而得到清償。因此，區(qū)分是否屬于破產(chǎn)債權的意義在于，破產(chǎn)債權只能通過破產(chǎn)程序清償，其他債權可以通過變賣抵押物、主張取回權、主張擔保權等方式實現(xiàn)。
3、必須積極向人民法院申報債權。
債權人必須明確自己對破產(chǎn)企業(yè)的債權，并應在規(guī)定時間內(nèi)積極向法院申報。法院一旦受理破產(chǎn)案件，就會通知已知的債權人，并發(fā)布相關公告和通知。人民法院受理破產(chǎn)申請后，應當確定債權人申報債權的期限。債權申報期限自人民法院宣布受理破產(chǎn)申請之日起計算，最短不得少于三十日，最長不得超過三個月。債權人應當在報告期內(nèi)向法院申報債權，說明債權數(shù)額及是否有財產(chǎn)擔保，并提交相關證明材料。在此期限內(nèi)未申報債權的，可以在破產(chǎn)財產(chǎn)最終分配前進行補充申報；但是之前已經(jīng)做過的分配，不再補充。審查確認補充債權申報的費用由補充申請人承擔。因此，補充申報對債權人極為不利。因此，債權人應及時向法院申報債權，維護自身權益。