根據相關的法律規定，公司清算的程序具體如下：1、企業宣告解散、破產的，就應當立即成立清算機構。2、對企業的財產、物資、債權、債務進行全面清查，編制資產負債表和財產目錄，提出財產作價和計算依據，制定清算方案。3、企業應當在依法清算完畢后，申請辦理注銷登記。 根據相關的法律規定，公司清算的程序具體如下：
1、企業宣告解散、破產的，就應當立即成立清算機構。清算組的確定可由人民法院指定，也可由公司依照法律規定自行組成清算組。
2、清算機構成立后，就應對企業的財產、物資、債權、債務進行全面清查，編制資產負債表和財產目錄，提出財產作價和計算依據，制定清算方案，具體處理企業未了結的業務、收取企業債權、向股東收取已認繳而未繳納的股金、清算納稅事宜、償還企業債務、處分企業剩余財產。
3、企業應當在依法清算完畢后，申請辦理注銷登記。公司未經依法清算即辦理注銷登記，股東或者第三人在公司登記機關辦理注銷登記時承諾對公司債務承擔責任，債權人主張其對公司債務承擔相應民事責任的，人民法院應依法予以支持。
《財政部、國家稅務總局關于企業清算業務企業所得稅處理若干問題的通知》
第五條
企業全部資產的可變現價值或交易價格減除清算費用，職工的工資、社會保險費用和法定補償金，結清清算所得稅、以前年度欠稅等稅款，清償企業債務。按規定計算可以向所有者分配的剩余資產。被清算企業的股東分得的剩余資產的金額，其中相當于被清算企業累計未分配利潤和累計盈余公積中按該股東所占股份比例計算的部分，應確認為股息所得。剩余資產減除股息所得后的余額，超過或低于股東投資成本的部分，應確認為股東的投資轉讓所得或損失。被清算企業的股東從被清算企業分得的資產應按可變現價值或實際交易價格確定計稅基礎。

企業自行清算流程經過的步驟是組建清算組、清算公司的財產、擬定清算的方案、對公司的債務和債權進行了結、清償后有剩余的財產進行分配等。公司破產后一定要按照規定進行公司清算。 1、清算公司財產、制訂清算方案
調查和清理公司財產。清算組在催告債權人申報債權的同時，應當調查和清理公司的財產。根據債權人的申請和調查清理的情況編制公司資產負債表、財產清單和債權、債務目錄。應當指出的是，清算組在編制資產負債表時，不得將公司財產價值低估。
制訂清算方案。編制公司財務會計報告之后，清算組應當制訂清算方案，提出收取債權和清償債務的具體安排。
提交股東會通過或者報主管機關確認。清算方案是公司清算的總方案。因此，股份有限公司的清算組應將清算方案提交股東大會通過。但是，有限責任公司的清算組成員是由股東組成的，所以，無須提交股東會另行通過。將清算方案提交有關主管機關確認的規定，適用于因違法而解散的清算公司。
另外，如果公司清算組在清理公司財產、編制資產負債表和財產清單時，發現公司財產不足清償債務的，清算組有責任立即向有管轄權的人民法院申請宣告破產。經人民法院裁定宣告破產后，清算組應當將清算事務移交人民法院。
2、了結公司債權、債務
處理公司未了結的業務。清算期間，公司不得開展新的經營活動。但是，公司清算組為了清算的目的，有權處理公司尚未了結的業務。
收取公司債權。清算組應當及時向公司債務人要求清償已經到期的公司債權。對于未到期的公司債權，應當盡可能要求債務人提前清償，如果債務人不同意提前清償的，清算組可以通過轉讓債權等方法變相清償。
清償公司債務。公司清算組通過清理公司財產、編制資產負債表和財產清單之后，確認公司現有的財產和債權大于所欠債務，并且足以償還公司全部債務時，應當按照法定的順序向債權人清償債務。首先，應當支付公司清算費用，包括公司財產的評估、保管、變賣和分配等所需的費用，公告費用，清算組成員的報酬，委托注冊會計師、律師的費用，以及訴訟費用等;其次，支付職工工資和勞動保險費用;再次，繳納所欠稅款;最后是償還其他公司債務。
在清償公司債務時，應注意以下幾點：
第一，償還公司債務，一向沒有嚴格先后、順序之分，但是，公司財產必須能夠清償公司債務;
第二，在催告債術人申報的期限屆滿前，公司一般不得先行清償債務;
第三，在公司清償全部公司債務前，不得向公司股東分配公司財產。
3、分配公司剩余財產
公司清償了全部公司債務之后，如果公司財產還有剩余的，清算組才能夠將公司剩余財產分配給股東。有限責任公司按照各股東的出資比例進行分配;股份有限公司按照各股東持有的股份比例進行分配。取得公司剩余財產的分配權，是公司股東自益權的一項重要內容，是公司股東的基本權利。在分配方式上可采取貨幣分配、實物分配或者作價分配等形式，其基本要求是：既最大限度保護股東的權益，又體現出平等和公平分配原則。
公司解散不是公司主體資格的終結，公司解散后應進入公司清算程序，只有經過合法有效的清算程序后，公司主體資格才能真正的消亡。公司解散不清算，將導致清算主體被追責，股東甚至被要求承擔無限連帶責任。

公司注銷后如何進行清算，一般分為兩個層面，首先是企業層面，即從事實體生產經營的公司需要進行企業所得稅的清算；其次是股東層面，指企業投資者的投資行為而取得的所得進行企業（個人）所得稅清算。
哪些企業需進行企業所得稅清算，主要包括：按《公司法》、《企業破產法》等規定需要進行清算的企業；企業重組中需要按清算處理的企業；不符合《財政部、國家稅務總局關于企業重組業務企業所得稅處理若干問題的通知》（財稅〔2009〕59號）規定的適用特殊稅務處理原則的重組業務，如企業由法人轉變為個人獨資企業、合伙企業、個體工商戶等非法人組織、或將登記注冊地轉移至中華人民共和國境外（包括港澳臺地區）；不適用特殊性稅務處理的企業合并、分立等，改組企業不需要履行上述清算程序，但需要視同清算進行所得稅處理。
企業終止生產經營開始清算之日的確定，包括企業章程規定的經營期限屆滿之日；企業股東會、股東大會或類似機構決議解散之日；企業依法被吊銷營業執照、責令關閉或者被撤銷之日；企業被人民法院依法予以解散或宣告破產之日。
清算期確定、清算備案和時間要求，根據《財政部、國家稅務總局關于企業清算業務企業所得稅處理若干問題的通知》（財稅〔2009〕60號）文件規定，企業應將整個清算期作為一個獨立的納稅年度計算清算所得。清算期所在的年度內，有兩個所得稅納稅年度，第一個納稅年度為1月1日到終止生產經營之日，第二個納稅年度為終止生產經營之日到注銷稅務登記之日。
進入清算期的企業應對清算事項，報主管稅務機關備案。企業應當自終止生產經營活動開始清算之日起15日內向主管稅務機關提交《企業清算所得稅事項備案表》并附送以下備案資料：納稅人終止正常生產經營活動并開始清算的證明文件或材料；管理人或清算組聯絡人員名單及聯系方式；清算方案或計劃書；欠稅報告表。
企業在清算期內取得來源于我國境外的所得，仍須依據《財政部、國家稅務總局關于企業境外所得稅收抵免有關問題的通知》（財稅〔2009〕125號）的相關規定，按照分國（地區）不分項原則，采取“抵免法”，計算按照我國稅法計算的在我國境內應補繳的企業所得稅稅額。
企業應當自清算結束之日起15日內，向主管稅務機關報送《中華人民共和國企業清算所得稅申報表》及其附表和下列資料，完成清算所得稅申報，結清稅款。

企業清算程序主要包括六個步驟。首先，成立清算組，接管公司，并開展相關業務。這包括接管財產，了結未了業務，收取債權并清理債務，分配剩余財產，注銷法人資格并吊銷營業執照。
其次，通知債權人申報債權。在此階段，清算組需確保債權人能夠了解清算情況并提交債權聲明。
隨后，提出清算方案。在清理公司財產、編制資產負債表和財產清單之后，清算組將擬定出清算方案，并提交給股東會討論通過或主管機關確認。該方案應詳細列出清算費用、職工工資、勞動保險費、稅款以及債務清償情況。
在方案通過后，進行剩余財產的分配。這一過程遵循公平原則，確保債權人、職工和股東能夠獲得合理補償。
最后，終結清算工作。完成上述步驟后，清算組需正式結束清算過程，注銷公司法人資格，并辦理相關注銷手續。