小產權房不能進行公證，公證的基礎是要合法，小產權房是不合法的，所以即使公證也是無效的;所謂小產權是國家不認可的，更不能上市交易的，公證處當然不能做這種公證，即使做了國家也是不認可的。
購買在建小產權房時，購房人與開發(fā)商簽訂合同并交付房款后，如果相關部門整頓鄉(xiāng)產權房的建設項目，可導致部分項目停建甚至被強迫拆除。購房人會面臨既無法取得房屋，又不能及時索回房款的尷尬境地。
小產權房如何交易?
1、買賣雙方先簽訂《房屋買賣合同》。
2、賣方處理好房屋未能滿足交易過戶條件的相關事宜(比如原有抵押貸款的，是轉按還是提前歸還了貸款，涂銷了原有的抵押后再進行交易等等)。
3、買方如果是按揭貸款購房的，找銀行申請貸款，并取得銀行的書面答復。(買方是一次性付款的，此步驟就不需要了)
4、雙方按當?shù)胤抗芫值囊髱浞慨a證、身份證等原件，前往房產交易所辦理交易申請。如果當?shù)匾筮f件前有部分稅費或費用是先繳交的，備好款項。
5、成功遞件并取得房產交易所收件回執(zhí)后，買方付按約定首期房款給賣方。
小產權房如何辦理房產證？
小產權房是直接辦不了房產證的，只有通過過戶才可以取得房產證。
1、小產權房屋開發(fā)人根據建房批復，城填規(guī)化許可證到土管局交納一定量的土地出讓金，變集體土地為國有土地。
2、小產權的建筑商到地稅部門交納百分之四點叁捌的建筑環(huán)節(jié)稅收。
3、根據變更的國有土地使用證和交納的建筑環(huán)稅收票證、建房批復、城鎮(zhèn)規(guī)化許可證到房管部門辦理房屋總證。
4、房屋購買者憑房屋總證，房屋產權過戶表，賣買雙方身份證復印件，購買房屋合同到財政部門(農村財政稅收和農村財務管理局)交納契稅稅。
5、到地稅部門交納房屋銷售環(huán)節(jié)的各項稅收。
6、憑以上各種手續(xù)和交納的稅收票據或稅收減免證到房屋管理部門辦理房產權手續(xù)。

小產權房的合同是不可以公證的，小產權房的合同本身并不具備效力，產權也不明確，公證處是不會給小產權房辦理公證的，此外像是律師見證也沒有用，很多的小產權房交易會找個律師做見證，其實也沒有什么意義，小產權房的交易本身就是不合規(guī)的。
小產權房有什么風險
1、沒有房產證、產權證
按照法律的角度來看，小產權房指的是沒有產權的房屋。也就是說這類房子是沒有國家頒發(fā)的土地使用證和預售許可證，當然購房合同也不可能在房管局備案。因此，無法擁有一本合法合規(guī)，有效的房產證。
此外，小產權房還無法辦理產權證。因為辦理產權證，需要擁有國有土地使用證、建設用地規(guī)劃許可證、建設工程規(guī)劃許可證、建筑工程施工許可證及商品房銷預售許可證。而這些小產權房的開發(fā)者是不具備五證，因此小產權房購買者無法到房管部門辦理相關房屋產權證。所以，小產權房是沒有房產證以及產權證的。
2、不能貸款、不能過戶
由于小產權房土地性質的原因，它只有居住功能，就連購房貸款都不能辦理。其實因為土地的原因，一切和官方有關的金融功能幾乎為零，也就是如果購房者買了小產權房子，不僅不能向銀行貸款，還不可以抵押，不可以按揭，也不可以到房管局去過戶，理論上不可以買賣，如果要私下買賣，也只有一紙合同或者協(xié)議而已，沒有房產證。
3、易出問題、維權難
購房者如果購買了小產權房，并和開發(fā)商簽訂合同并交付房款后，遇到政府整頓小產權房，那么可導致部分項目停建甚至被強迫拆除。購房人會面臨既無法取得房屋，又不能及時索回房款的尷尬境地。
就算小產權房的項目順利建成交工，購房者也有可能面臨其它問題。這是因為小產權房不受法律認可，也不用在房管部門備案，不在政府機構監(jiān)管范圍內。一些小產權房開發(fā)商為了賺錢會偷工減料，存在質量平安隱患。在使用房屋的過程中，如果購房者遇到一些房屋質量問題、公共設施維護問題，維權途徑非常有限。
4、物業(yè)和其它權益得不到保障
大多數(shù)小產權房所在的小區(qū)管理可能跟不上現(xiàn)代化的管理模式，因此物業(yè)服務得不到保障。除此之外，購房者在購得小產權房后，一旦遇到政府征地拆遷，由于小產權房并沒有國家頒發(fā)的房產證，因此，購房者也就并非合法的產權人，也就無法獲得相應的拆遷補償。
5、拆遷補償難、質量沒保證
由于小產權房沒有房屋合法所有人，無法對抗國家的征地和拆遷，購房者將來遇到拆遷，將很難得到補償。若小產權房屋違反國家政策被強拆，購房人可能面臨既無法取得房屋，又不能索回房款的尷尬局面。另外，現(xiàn)在不少的開發(fā)商在建設小產權房屋時，因職能部門監(jiān)管不力，為賺錢而對房屋使用的材料進行偷工減料，存在嚴重安全隱患。

小產權房不能進行公證，公證的基礎是要合法。而小產權是國家不認可的，更不能上市交易的，因此公證處自然是不能做這種公證的，即使做了國家也是不認可的。《中華人民共和國土地管理法》第九條 城市市區(qū)的土地屬于國家所有。農村和城市郊區(qū)的土地，除由法律規(guī)定屬于國家所有的以外，屬于農民集體所有;宅基地和自留地、自留山，屬于農民集體所有。《中華人民共和國土地管理法》第六十二條農村村民一戶只能擁有一處宅基地，其宅基地的面積不得超過省、自治區(qū)、直轄市規(guī)定的標準。人均土地少、不能保障一戶擁有一處宅基地的地區(qū)，縣級人民政府在充分尊重農村村民意愿的基礎上，可以采取措施，按照省、自治區(qū)、直轄市規(guī)定的標準保障農村村民實現(xiàn)戶有所居。農村村民建住宅，應當符合鄉(xiāng)(鎮(zhèn))土地利用總體規(guī)劃、村莊規(guī)劃，不得占用永久基本農田，并盡量使用原有的宅基地和村內空閑地。編制鄉(xiāng)(鎮(zhèn))土地利用總體規(guī)劃、村莊規(guī)劃應當統(tǒng)籌并合理安排宅基地用地，改善農村村民居住環(huán)境和條件。農村村民住宅用地，由鄉(xiāng)(鎮(zhèn))人民政府審核批準;其中，涉及占用農用地的，依照本法第四十四條的規(guī)定辦理審批手續(xù)。農村村民出賣、出租、贈與住宅后，再申請宅基地的，不予批準。國家允許進城落戶的農村村民依法自愿有償退出宅基地，鼓勵農村集體經濟組織及其成員盤活利用閑置宅基地和閑置住宅。國務院農業(yè)農村主管部門負責全國農村宅基地改革和管理有關工作。《城市房地產轉讓管理規(guī)定》第六條 下列房地產不得轉讓：(一)以出讓方式取得土地使用權但不符合本規(guī)定第十條規(guī)定的條件的;(二)司法機關和行政機關依法裁定，決定查封或者以其他形式限制房地產權利的;(三)依法收回土地使用權的;(四)共有房地產，未經其他共有人書面同意的;(五)權屬有爭議的;(六)未依法登記領取權屬證書的;(七)法律、行政法規(guī)規(guī)定禁止轉讓的其他情形。《中華人民共和國公證法》第三十一條 有下列情形之一的，公證機構不予辦理公證：(一)無民事行為能力人或者限制民事行為能力人沒有監(jiān)護人代理申請辦理公證的;(二)當事人與申請公證的事項沒有利害關系的;(三)申請公證的事項屬專業(yè)技術鑒定、評估事項的;(四)當事人之間對申請公證的事項有爭議的;(五)當事人虛構、隱瞞事實，或者提供虛假證明材料的;(六)當事人提供的證明材料不充分或者拒絕補充證明材料的;(七)申請公證的事項不真實、不合法的;(八)申請公證的事項違背社會公德的;(九)當事人拒絕按照規(guī)定支付公證費的。