遲到罰款是否違反《中華人民共和國勞動法》，一般因情況而定:
1、如果公司沒有相關規章制度規定，作出處罰是沒有依據的，是違法的；
2、嚴格的講公司對于遲到不是罰款，罰款是行政處罰的一種，必須有行政立法機關進行立法規定。

因為公司不是行政執法機關，沒有罰款權限。所謂的罰款其實是對工資的扣除，這個是合法的。
因勞動者本人原因給用人單位造成經濟損失的，用人單位可按照勞動合同的約定要求其賠償經濟損失。經濟損失的賠償，可從勞動者本人的工資中扣除。但每月扣除的部分不得超過勞動者當月工資的20%。若扣除后的剩余工資部分低于當地月最低工資標準，則按最低工資標準支付。工資分配應當遵循按勞分配原則，實行同工同酬。資水平在經濟發展的基礎上逐步提高。國家對工資總量實行宏觀調控。

罰款是行政處罰的一種，必須有行政立法機關進行立法規定。扣除勞動者本人的工資，每月扣除的部分不得超過勞動者當月工資的20%。

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【法律依據】:
《中華人民共和國勞動法》第五十條
工資應當以貨幣形式按月支付給勞動者本人。不得克扣或者無故拖欠勞動者的工資。
第五十一條
勞動者在法定休假日和婚喪假期間以及依法參加社會活動期間，用人單位應當依法支付工資。

一、公司處罰員工罰款合法嗎
1、公司對員工進行罰款的話是不合法的，勞動法上的用人單位不是行政執法機關，法律對于用人單位并沒有賦予法定上的罰款權利，無權對職工的違法行為進行罰款，所以在實際中遇到公司對違反規章的員工進行罰款處罰的是違反法律規定的。
2、法律依據：《中華人民共和國勞動法》第六條
國家提倡勞動者參加社會義務勞動，開展勞動競賽和合理化建議活動，鼓勵和保護勞動者進行科學研究、技術革新和發明創造，表彰和獎勵勞動模范和先進工作者。
二、公司制定罰款制度合法嗎
公司制定罰款制度不合法。員工完不成工作任務，公司可以以不勝任工作為由調崗或者再培訓，罰款損害了勞動者的合法權益，勞動者可以單方解除勞動合同并要求支付經濟補償金。勞動者可以去勞動局投訴或者去公司所在地勞動仲裁委申請勞動仲裁。用人單位不是行政處罰的主體，不具備實施經濟處罰權的主體資格，對員工進行罰款沒有法律依據。只有在勞動者給用人單位造成損失的情況下才可以進行罰款處罰且處罰是有金額限制的。