女方失蹤起訴離婚程序一般包括：
1、男方先向法院申請認定女方為失蹤人口；
2、法院會發出公告，公告期滿之后，對方還未出現的，法院會宣告其失蹤；
3、男方向法院起訴，法院判決離婚。

案例：李某和妻子2004年結婚并辦理了登記手續，后生育了一男孩，2009年妻子獨自外出務工后就與家人失去了聯系，至今下落不明?，F在李某想起訴離婚，于是到李某的住所地法院提交起訴狀，被告知應當向李某妻子(其戶口是外縣的一直沒有轉入李某家)的戶籍所在地法院起訴。李某向妻子戶籍所在地法院提交起訴狀，又被告知他們沒有管轄權。問：到底哪個法院才有權受理李某的離婚起訴?答：李某夫妻雙方已登記結婚，并生育小孩，現因妻子下落不明。李某要起訴離婚，雖李某妻子的戶口沒有遷移至李某家，但因其下落不明，且離開李某家及其住所地已超4年時間，起訴離婚應由李某所在地的人民法院管轄受理?！吨腥A人民共和國民事訴訟法》第21條規定，對公民提起民事訴訟，由被告住所地人民法院管轄。但由于李某提起的訴訟是離婚訴訟，根據《最高人民法院關于適用〈中華人民共和國民事訴訟法〉若干問題的意見》第12條的規定，可知像李某這樣的情形，明確規定夫妻一方離開住所地超過1年，另一方起訴離婚的案件，由原告住所地人民法院管轄。因此，本案應由李某所在地人民法院管轄。

丈夫失蹤滿兩年的，女方可以先請求法院宣告丈夫失蹤，當丈夫被法院宣告失蹤后，女方可再攜帶離婚所需的相關材料，到自己所在地的人民法院以對方失蹤為由向法院起訴離婚，經查證情況屬實的，法院會依法判決雙方離婚。

《中華人民共和國民法典》第一千零七十九條夫妻一方要求離婚的，可以由有關組織進行調解或者直接向人民法院提起離婚訴訟。 人民法院審理離婚案件，應當進行調解；如果感情確已破裂，調解無效的，應當準予離婚。 有下列情形之一，調解無效的，應當準予離婚： （一）重婚或者與他人同居； （二）實施家庭暴力或者虐待、遺棄家庭成員； （三）有賭博、吸毒等惡習屢教不改； （四）因感情不和分居滿二年； （五）其他導致夫妻感情破裂的情形。 一方被宣告失蹤，另一方提起離婚訴訟的，應當準予離婚。 經人民法院判決不準離婚后，雙方又分居滿一年，一方再次提起離婚訴訟的，應當準予離婚。

法律分析：丈夫失蹤后妻子是不可以協議離婚的。只能通過訴訟離婚。根據相關法律規定，對下落不明或者宣告失蹤的人提起的有關身份關系的訴訟，應當由由原告住所地或原告經常居住地人民法院管轄。

法律依據：《中華人民共和國民法典》

第一千零七十六條 夫妻雙方自愿離婚的，應當簽訂書面離婚協議，并親自到婚姻登記機關申請離婚登記。

離婚協議應當載明雙方自愿離婚的意思表示和對子女撫養、財產以及債務處理等事項協商一致的意見。

第一千零七十九條 夫妻一方要求離婚的，可以由有關組織進行調解或者直接向人民法院提起離婚訴訟。

人民法院審理離婚案件，應當進行調解；如果感情確已破裂，調解無效的，應當準予離婚。

有下列情形之一，調解無效的，應當準予離婚：

（一）重婚或者與他人同居；

（二）實施家庭暴力或者虐待、遺棄家庭成員；

（三）有賭博、吸毒等惡習屢教不改；

（四）因感情不和分居滿二年；

（五）其他導致夫妻感情破裂的情形。

一方被宣告失蹤，另一方提起離婚訴訟的，應當準予離婚。

經人民法院判決不準離婚后，雙方又分居滿一年，一方再次提起離婚訴訟的，應當準予離婚。

第一千零八十五條 離婚后，子女由一方直接撫養的，另一方應當負擔部分或者全部撫養費。負擔費用的多少和期限的長短，由雙方協議；協議不成的，由人民法院判決。

前款規定的協議或者判決，不妨礙子女在必要時向父母任何一方提出超過協議或者判決原定數額的合理要求。

第一千零八十七條 離婚時，夫妻的共同財產由雙方協議處理；協議不成的，由人民法院根據財產的具體情況，按照照顧子女、女方和無過錯方權益的原則判決。

對夫或者妻在家庭土地承包經營中享有的權益等，應當依法予以保護。