疫情期間公司扣工資員工應該打當地勞動保障部門的舉報電話，也可以去當地的勞動監察部門進行投訴。勞動保障部門的電話可以通過撥打12333來進行查詢。
一、疫情延遲復工，導致公司無法按時支付員工工資，企業是否需承擔責任?
如確因疫情導致公司確有無法克服的困難，無法按時支付員工工資，可以以不可抗力為由進行抗辯，不承擔逾期支付責任。但需與員工說明情況，并在阻礙因素消除后盡快支付，以盡量減少勞資糾紛，但公司也不得故意以疫情造成困難為由拒絕支付員工工資，發生爭議時，公司也需要對疫情導致無法克服的困難承擔舉證責任。
二、因疫情影響導致企業生產經營困難的，可否通過縮短勞動者工作時間，少發放工資?
企業可以采取縮短工時的方式穩定工作崗位，但前提是和職工協商一致。
由于縮短工時不是節假日，屬于企業自己確定的工作時間，按照多勞多得、少勞少得的原則，由于工時縮短的，企業可以相應減少勞動報酬，但不得低于最低工資標準。縮短工時和停工、停產并不相同，所以不受后者關于一個工資支付周期要正常支付工資等規定的影響。且在“穩定工作崗位，盡量不裁員或者少裁員”的目的下，可以理解為縮短工時后可以相應減少勞動報酬標準，但不應當低于最低工資標準。 法律依據：
《勞動保障監察條例》第二十六條 用人單位有下列行為之一的，由勞動保障行政部門分別責令限期支付勞動者的工資報酬、勞動者工資低于當地最低工資標準的差額或者解除勞動合同的經濟補償；逾期不支付的，責令用人單位按照應付金額50%以上1倍以下的標準計算，向勞動者加付賠償金：
(一)克扣或者無故拖欠勞動者工資報酬的；
(二)支付勞動者的工資低于當地最低工資標準的；
(三)解除勞動合同未依法給予勞動者經濟補償的。 《勞動保障監察條例》第九條任何組織或者個人對違反勞動保障法律、法規或者規章的行為，有權向勞動保障行政部門舉報。

向勞動局和勞動監察大隊投訴解決。首先勞動者應先固定證據，收集好自己確實出勤上班活在家上班的證據，如工作記錄、打卡考勤記錄、公司通知等等，投訴未果的情況直接申請勞動仲裁。因疫情影響導致企業生產經營困難的，經協商一致可以縮短勞動者的工作時間。縮短工時的，可以相應減少勞動報酬，但不應當低于最低工資標準。

目前新型冠狀病毒現在我國蔓延，我國也采取的強有力的措施進行防控，而在防控疫情期間，很多企業是停止經營活動的，那么，企業因受疫情致經營困難如何處理呢?我整理了以下內容為您答疑解惑，希望對您有所幫助。企業因受疫情致經營困難如何處理      依據我國相關通知的規定，企業因受疫情影響導致生產經營困難的，可以通過與職工協商一致采取調整薪酬、輪崗輪休、縮短工時等方式穩定工作崗位，盡量不裁員或者少裁員。      法律依據為《《人力資源社會保障部辦公廳關于妥善處理新型冠狀病毒感染的肺炎疫情防控期間勞動關系問題的通知》，企業因受疫情影響導致生產經營困難的，可以通過與職工協商一致采取調整薪酬、輪崗輪休、縮短工時等方式穩定工作崗位，盡量不裁員或者少裁員。符合條件的企業，可按規定享受穩崗補貼。企業停工停產在一個工資支付周期內的，企業應按勞動合同規定的標準支付職工工資。超過一個工資支付周期的，若職工提供了正常勞動，企業支付給職工的工資不得低于當地最低工資標準。職工沒有提供正常勞動的，企業應當發放生活費，生活費標準按各省、自治區、直轄市規定的辦法執行。

      對新型冠狀病毒感染的肺炎患者、疑似病人、密切接觸者在其隔離治療期間或醫學觀察期間以及因政府實施隔離措施或采取其他緊急措施導致不能提供正常勞動的企業職工，企業應當支付職工在此期間的工作報酬，并不得依據勞動合同法第四十條、四十一條與職工解除勞動合同。在此期間，勞動合同到期的，分別順延至職工醫療期期滿、醫學觀察期期滿、隔離期期滿或者政府采取的緊急措施結束。