勞動合同有5000的違約金是否合理需要看是否超過了合同總額的20%。合同違約金以當事人約定為準，法律沒有具體規定合同違約金上限，合同違約金以當事人約定為主，可以約定具體數額，也可以約定計算方法，如果約定的違約金過高或者過低，當事人可以請求予以減少或增加。如果是定金合同，約定定金數額不得超過主合同標的額的20%。【法律依據】《工資支付暫行規定》 第十六條 因勞動者本人原因給用人單位造成經濟損失的，用人單位可按照勞動合同的約定要求其賠償經濟損失。經濟損失的賠償，可從勞動者本人的工資中扣除。但每月扣除的部分不得超過勞動者當月工資的20%。若扣除后的剩余工資部分低于當地月最低工資標準，則按最低工資標準支付。
法律依據
《工資支付暫行規定》第十六條 因勞動者本人原因給用人單位造成經濟損失的，用人單位可按照勞動合同的約定要求其賠償經濟損失。經濟損失的賠償，可從勞動者本人的工資中扣除。但每月扣除的部分不得超過勞動者當月工資的20%。若扣除后的剩余工資部分低于當地月最低工資標準，則按最低工資標準支付。

勞動合同違約金最多損失的30%，《中華人民共和國勞動合同法》規定，勞動合同中可以設定違約金的情形進限于兩種：(1)勞動者違反服務期約定的，用人單位可以設定違約金。而用人單位設定服務期的情形只限于一種情形，即用人單位為勞動者提供專項培訓配用，對其進行專業技術培訓的，可以與勞動者訂立協議，約定服務期。(2)勞動者違反競業限制規定的，用人單位可以設定違約金。除此之外用人單位不得與勞動者約定由勞動者承擔違約金。《中華人民共和國勞動合同法》第三條訂立勞動合同，應當遵循合法、公平、平等自愿、協商一致、誠實信用的原則。依法訂立的勞動合同具有約束力，用人單位與勞動者應當履行勞動合同約定的義務。第十條建立勞動關系，應當訂立書面勞動合同。已建立勞動關系，未同時訂立書面勞動合同的，應當自用工之日起一個月內訂立書面勞動合同。用人單位與勞動者在用工前訂立勞動合同的，勞動關系自用工之日起建立。第三十六條用人單位與勞動者協商一致，可以解除勞動合同。

法律主觀：

用人單位在和勞動者存在勞動關系時，要簽訂勞動合同。一、勞動合同法關于辭職違約金的規定的只允許在兩種情況下，讓勞動者承擔違約金。第二十五條除本法第二十二條（提供培訓費）和第二十三條（給付競業限制經濟補償）規定的情形外，用人單位不得與勞動者約定由勞動者承擔違約金。該法第二十二條是用人單位為勞動者提供了培訓費用時可以約定違約金，并且違約金的數額不得超過用人單位提供的培訓費用。該法第二十三條是用人單位給付勞動者競業限制經濟補償，并且規定了競業限制的時間不得超過兩年。遺憾的是對競業限制的違約金沒有規定一個上限。除了上述兩種情況，用人單位以任何名義、任何形式約定違約金都是違法的。二、勞動合同法中的違約金規定《勞動合同法》第二十五條，除本法第二十二條和第二十三條規定的情形外，用人單位不得與勞動者約定由勞動者承擔違約金。第二十二條，用人單位為勞動者提供專項培訓費用，對其進行專業技術培訓的，可以與該勞動者訂立協議，約定服務期。勞動者違反服務期約定的，應當按照約定向用人單位支付違約金。違約金的數額不得超過用人單位提供的培訓費用。用人單位要求勞動者支付的違約金不得超過服務期尚未履行部分所應分攤的培訓費用。三、勞務派遣辭職要交違約金嗎勞務派遣與用人單位協商一致可以解除勞動合同，如果符合法律程序辭職的不需要交違約金。勞動者可單方離職，但需提前30天告知，需書寫辭職報告。關于違約金問題要看當初的合同是如何約定的，且約定的違約金是否符合法律規定。

法律客觀：

《 勞動合同法 》第二十二條，用人單位為勞動者提供專項培訓費用，對其進行專業技術培訓的，可以與該勞動者訂立協議，約定服務期。勞動者違反服務期約定的，應當按照約定向用人單位支付違約金。違約金的數額不得超過用人單位提供的培訓費用。用人單位要求勞動者支付的違約金不得超過服務期尚未履行部分所應分攤的培訓費用。用人單位與勞動者約定服務期的，不影響按照正常的 工資 調整機制提高勞動者在服務期期間的勞動報酬。