有集體土地使用證糾紛的解決辦法具體如下：
1、協(xié)商解決。協(xié)商是指當(dāng)事人在發(fā)生土地承包糾紛后，在自愿互諒的基礎(chǔ)上，依據(jù)法律、法規(guī)規(guī)定和合同的約定，直接進(jìn)行磋商，自行解決爭議。這是解決承包糾紛最基本、最有效的方法；
2、調(diào)解解決。調(diào)解，是指當(dāng)事人雙方發(fā)生糾紛后，在第三人的主持下，通過講理勸說，分清是非，在互諒互讓的基礎(chǔ)上，依據(jù)法律規(guī)定，雙方自愿達(dá)成協(xié)議，這也是解決土地承包合同糾紛的重要方式；
3、仲裁解決。仲裁是我國在特定的農(nóng)村土地承包經(jīng)營體制的前提下，為解決農(nóng)村土地承包糾紛的“準(zhǔn)司法”方式，不同于仲裁法規(guī)定的一般經(jīng)濟(jì)糾紛仲裁；
4、訴訟解決。訴訟是解決土地承包糾紛的終極途徑，任何一方均可以向法院提起訴訟，法院的判決結(jié)果是具有強制力的。
土地糾紛的類型：
1、村集體或村干部對村民利益的侵害。有的村干部素質(zhì)不高，工作責(zé)任心不強，在農(nóng)村土地承包合同的訂立中手續(xù)不完備造成不必要的失誤，履行中又漠視農(nóng)民權(quán)益成為糾紛產(chǎn)生的重要因素。有的村干部在發(fā)包土地時暗箱操作，引起群眾不滿。有的是在履行過程中常常因為村委會負(fù)責(zé)人更換，新舊班子之間或村干部之間有矛盾，導(dǎo)致現(xiàn)任村委會否認(rèn)原合同，私自變更合同條款或?qū)?biāo)的物重新發(fā)包，導(dǎo)致糾紛發(fā)生；
2、村民對村集體利益的損害。有的村民未按約履行承包合同造成糾紛。有的承包戶以低價承包，又以高價擅自轉(zhuǎn)包，從中坐收漁利。有的村民不遵守合同約定，故意拖欠承包費，制造各種事端，致使村干部催收困難。有的承包戶擅自改變土地用途，違反合同約定破壞土地和林業(yè)資源，損害集體的利益；
3、村民之間的土地利益糾紛。有的村民依仗各種權(quán)勢力或者力量，強行擠占他人土地。有的村民在耕種自己的土地時，侵犯其他村民的各種利益。在村民土地糾紛中最多的往往是地界糾紛，這種糾紛大多由于歷史原因涉及人員多、情況復(fù)雜而難以解決。
綜上所述，完善的糾紛解決機制是農(nóng)村土地糾紛解決的有效途徑和手段。根據(jù)本地這些年土地糾紛解決的統(tǒng)計資料來看，復(fù)雜的農(nóng)村土地糾紛能夠較好地解決多是由鄉(xiāng)村兩級以及上級土地管理、司法等有關(guān)部門相互配合的結(jié)果。
【法律依據(jù)】：
《中華人民共和國土地管理法》第十四條
土地所有權(quán)和使用權(quán)爭議，由當(dāng)事人協(xié)商解決；協(xié)商不成的，由人民政府處理。
單位之間的爭議，由縣級以上人民政府處理；個人之間、個人與單位之間的爭議，由鄉(xiāng)級人民政府或者縣級以上人民政府處理。
當(dāng)事人對有關(guān)人民政府的處理決定不服的，可以自接到處理決定通知之日起三十日內(nèi)，向人民法院起訴。
在土地所有權(quán)和使用權(quán)爭議解決前，任何一方不得改變土地利用現(xiàn)狀。

法律主觀：

《中華人民共和國土地管理法》第十六條規(guī)定，土地糾紛可以通過當(dāng)事人雙方協(xié)商解決。協(xié)商必須遵循以下原則：1．自愿。即雙方愿意進(jìn)行商談，并達(dá)成一致協(xié)議。任何一方，無論是單位、個人都不得將自己的意志強加給對方。任何單位或個人也不得非法干預(yù)。2．合法。雙方當(dāng)事人達(dá)成的協(xié)議必須是合法的，不得違反國家法律法規(guī)，不得損害社會公共利益及他人的合法權(quán)益。該方法適用于因土地權(quán)屬不明、范圍不清、地界沒有標(biāo)志引起的土地所有權(quán)和使用權(quán)糾紛。雙方協(xié)商后，應(yīng)簽訂權(quán)屬地界協(xié)議書。爭議雙方當(dāng)事人應(yīng)當(dāng)提請當(dāng)?shù)厝嗣裾畤临Y源管理部門審查備案。行政調(diào)解當(dāng)事人協(xié)商不成的，應(yīng)申請人民政府國土資源行政主管部門調(diào)解。國土資源行政主管部門進(jìn)行調(diào)解時應(yīng)在雙方平等自愿的基礎(chǔ)上進(jìn)行。調(diào)解時，應(yīng)做到以下幾點：1．查明事實，分清是非，明確責(zé)任。2．依照法律法規(guī)、政策進(jìn)行耐心的說服工作，講明利害關(guān)系。3．既要符合法律法規(guī)，有原則性，又要有靈活性。4．爭取有關(guān)部門的配合與支持。當(dāng)事人在國土資源行政主管部門主持下自愿達(dá)成的協(xié)議，應(yīng)當(dāng)由國土資源行政主管部門審查批準(zhǔn)和雙方當(dāng)事人蓋章。調(diào)解協(xié)議書一經(jīng)送達(dá)當(dāng)事人，即發(fā)生法律效力，成為雙方當(dāng)事人履行法律的依據(jù)。如果當(dāng)事人不愿調(diào)解或不服調(diào)解，或在調(diào)解成立后調(diào)解協(xié)議書送達(dá)前反悔的，依照法律規(guī)定，都可以直接要求人民政府處理。調(diào)解時不能帶有自己的感情，不能決而不調(diào)，也不能久調(diào)不決。調(diào)解時間越久，越會給國土資源行政主管部門帶來麻煩和被動。行政調(diào)解不成時，要及時進(jìn)入處理階段。人民政府處理人民政府處理即所謂的行政處理。《土地管理法》第十六條規(guī)定，單位之間的爭議，由縣級以上人民政府處理；個人之間、個人與單位之間的爭議由鄉(xiāng)級或者縣級以上人民政府處理。鄉(xiāng)級人民政府處理的土地糾紛主要是因為主體一方或雙方為個人的土地權(quán)屬爭議，爭議范圍不大，數(shù)量少，情節(jié)不太復(fù)雜。為了及時解決土地糾紛，方便群眾，這類糾紛宜由鄉(xiāng)級人民政府處理。但是情節(jié)復(fù)雜，影響較大的權(quán)屬爭議，處理后牽涉登記、發(fā)證，因鄉(xiāng)級人民政府無權(quán)登記、發(fā)證，應(yīng)由縣級人民政府處理為妥。但鄉(xiāng)級人民政府可以承擔(dān)受理。行政處理是仲裁的一種形式，可參照《仲裁法》相關(guān)規(guī)定進(jìn)行。國土資源行政主管部門進(jìn)行處理時，要按照國土資源部《土地權(quán)屬爭議調(diào)查處理辦法》規(guī)定的程序進(jìn)行，應(yīng)先認(rèn)真審閱爭議雙方提交的申請書、答辯書及有關(guān)證據(jù)材料。要調(diào)查事實、核實證據(jù)、查閱有關(guān)歷史資料和原始憑證，并可請有關(guān)部門協(xié)助調(diào)查或現(xiàn)場勘察。在爭議的基本事實調(diào)查清楚后，依據(jù)土地管理有關(guān)法律法規(guī)作出處理決定。處理后，要制作《土地糾紛處理決定書》，決定書要寫明下列各項：1．申請人和被申請人的姓名、地址以及代理人、代表人的姓名、職務(wù)。2．申請理由，爭議的事實和要求。3．處理認(rèn)定的事實、理由和適用的法律。4．處理結(jié)果。5．不服處理的補救措施等。國土資源行政主管部門在處理土地糾紛時，要注意審查申請人所遞交的申請書及有關(guān)證據(jù)材料，如發(fā)現(xiàn)有下列問題，受理機關(guān)在收到處理申請書7個工作日內(nèi)，應(yīng)依法作出不予受理的書面通知：1．申請人與爭議的土地沒有直接利害關(guān)系。2．申請的具體要求不符合法律規(guī)定。3．無具體的處理請求和事實依據(jù)。4．不作為爭議案件受理的行政區(qū)域邊界爭議案件、土地違法案件、農(nóng)村土地承包經(jīng)營權(quán)爭議等案件。受理機關(guān)如發(fā)現(xiàn)上述問題仍然進(jìn)入處理程序，將很可能使自己陷入尷尬境地。具體辦案人員如果和當(dāng)事人有利害關(guān)系，應(yīng)及早回避。當(dāng)事人如對《土地糾紛處理決定書》不服，可在接到?jīng)Q定書30日內(nèi)向人民法院起訴或在60日內(nèi)向上級人民政府提起行政復(fù)議。訴訟訴訟權(quán)是公民的基本權(quán)利之一。任何單位或個人的土地利用合法權(quán)益受到侵害時，都有權(quán)請求國家運用法律來加以保障。訴訟作為土地糾紛處理的一種方法有三種形式，即民事訴訟、行政訴訟和刑事訴訟。土地糾紛的民事訴訟。《土地管理法》規(guī)定的侵權(quán)行為，如未發(fā)生重大的人身事故，沒有引起生命財產(chǎn)等嚴(yán)重?fù)p害后果的訴訟屬民事訴訟。這類民事訴訟案件雖經(jīng)過土地行政主管部門的行政調(diào)處，但這種行為是應(yīng)當(dāng)事人一方或雙方請求進(jìn)行的，土地行政主管部門只是調(diào)處者，不是訴訟的參與者或關(guān)系人，所以不參與該項訴訟。訴訟當(dāng)事人仍為原來爭議的雙方。這類案件土地行政主管部門進(jìn)行行政處理，其目的是為了更快更好地解決土地糾紛，減少訴訟，以便及時保護(hù)當(dāng)事人的合法權(quán)益，以平息事端。土地糾紛的行政訴訟。土地糾紛雙方當(dāng)事人如對人民政府的處理不服，可以自接到處理決定之日起30日內(nèi)向人民法院提起行政訴訟，即不服處理一方的當(dāng)事人作為原告，把人民政府作為被告。最高人民法院《關(guān)于房地產(chǎn)案件受理問題的通知》規(guī)定，公民、法人或其他組織對人民政府或者其主管部門就土地的所有權(quán)或者使用權(quán)歸屬的處理決定不服，對人民政府或其主管部門就房地產(chǎn)問題作出的行政處罰決定不服，可依法向人民法院提起行政訴訟，由房地產(chǎn)所在地的人民法院行政審判庭依法受理。《最高人民法院關(guān)于執(zhí)行〈中華人民共和國行政訴訟法〉若干問題的解釋》第十六條規(guī)定：“農(nóng)村土地承包人等土地使用權(quán)人對行政機關(guān)處分其使用的農(nóng)村集體所有土地的行為不服，可以自己的名義提起訴訟。”

法律客觀：

《農(nóng)村土地承包經(jīng)營糾紛仲裁規(guī)則》第三條下列農(nóng)村土地承包經(jīng)營糾紛，當(dāng)事人可以向農(nóng)村土地承包經(jīng)營糾紛仲裁委員會申請仲裁：（一）因訂立、履行、變更、解除和終止農(nóng)村土地承包合同發(fā)生的糾紛；（二）因農(nóng)村土地承包經(jīng)營權(quán)轉(zhuǎn)包、出租、互換、轉(zhuǎn)讓、入股等流轉(zhuǎn)發(fā)生的糾紛；（三）因收回、調(diào)整承包地發(fā)生的糾紛；（四）因確認(rèn)農(nóng)村土地承包經(jīng)營權(quán)發(fā)生的糾紛；（五）因侵害農(nóng)村土地承包經(jīng)營權(quán)發(fā)生的糾紛；（六）法律、法規(guī)規(guī)定的其他農(nóng)村土地承包經(jīng)營糾紛。