個人所得稅的扣除辦法是自然人的應納所得稅額乘以個人所得稅的稅率即為公民應納稅款，應納所得稅額是用人單位對于已經扣除社會保險費后的職工本月的薪資減去起征點后剩下的，對于個人自主經營的，個人所得稅的應納稅額就不用扣除社會保險費用，直接減去起征點即可。

一、個人所得稅是怎么扣的?      扣除辦法是:本期應預扣預繳稅額=(累計預扣預繳應納稅所得額×預扣率-速算扣除數)-累計減免稅額-累計已預扣預繳稅額，累計預扣預繳應納稅所得額=累計收入-累計免稅收入-累計減除費用-累計專項扣除-累計專項附加扣除-累計依法確定其他扣除。累計減除費用按5000元/月乘以納稅人當年截至本月在本單位任職受雇月份數計算。二、個人所得稅的征稅對象是什么?      1、法定對象      我國個人所得稅的納稅義務人是在中國境內居住有所得的人，以及不在中國境內居住而從中國境內取得所得的個人，包括中國國內公民，在華取得所得的外籍人員和港、澳、臺同胞。      2、居民納稅義務人      在中國境內有住所，或者無住所而在境內居住滿1年的個人，是居民納稅義務人，應當承擔無限納稅義務，即就其在中國境內和境外取得的所得，依法繳納個人所得稅。      3、非居民納稅義務人      在中國境內無住所又不居住或者無住所而在境內居住不滿一年的個人，是非居民納稅義務人，承擔有限納稅義務，僅就其從中國境內取得的所得，依法繳納個人所得稅。三、個人所得稅的適用稅率是什么?      個人所得稅根據不同的征稅項目，分別規定了三種不同的稅率:      1、綜合所得(工資、薪金所得，勞務報酬所得，稿酬所得，特許權使用費所得)，適用7級超額累進稅率，按月應納稅所得額計算征稅。該稅率按個人月工資、薪金應稅所得額劃分級距，最高一級為45%，最低一級為3%，共7級。      2、經營所得適用5級超額累進稅率。適用按年計算、分月預繳稅款的個體工商戶的生產、經營所得和對企事業單位的承包經營、承租經營的全年應納稅所得額劃分級距，最低一級為5%，最高一級為35%，共5級。      3、比例稅率。對個人的利息、股息、紅利所得，財產租賃所得，財產轉讓所得，偶然所得和其他所得，按次計算征收個人所得稅，適用20%的比例稅率。      公民的每月收入達到個人所得稅起征點的，就應當向稅務機關繳納相應的個人所得稅，一般在用人單位上班的勞動者的個人所得稅是由用人單位進行代扣和代繳，而沒有在用人單位工作的，個人所得稅則由公民自己在法定期間內向稅務機關按時繳納。

扣除辦法是：本期應預扣預繳稅額=(累計預扣預繳應納稅所得額×預扣率-速算扣除數)-累計減免稅額-累計已預扣預繳稅額，累計預扣預繳應納稅所得額=累計收入-累計免稅收入-累計減除費用-累計專項扣除-累計專項附加扣除-累計依法確定其他扣除。累計減除費用按5000元/月乘以納稅人當年截至本月在本單位任職受雇月份數計算。
征稅對象
1、法定對象
個人所得稅的納稅義務人是在中國境內居住有所得的人，以及不在中國境內居住而從中國境內取得所得的個人，包括中國國內公民，在華取得所得的外籍人員和港、澳、臺同胞。
2、居民納稅義務人
在中國境內有住所，或者無住所而在境內居住滿1年的個人，是居民納稅義務人，應當承擔無限納稅義務，即就其在中國境內和境外取得的所得，依法繳納個人所得稅。
3、非居民納稅義務人
在中國境內無住所又不居住或者無住所而在境內居住不滿一年的個人，是非居民納稅義務人，承擔有限納稅義務，僅就其從中國境內取得的所得，依法繳納個人所得稅。
適用稅率
個人所得稅根據不同的征稅項目，分別規定了三種不同的稅率：
1、綜合所得(工資、薪金所得，勞務報酬所得，稿酬所得，特許權使用費所得)，適用7級超額累進稅率，按月應納稅所得額計算征稅。該稅率按個人月工資、薪金應稅所得額劃分級距，最高一級為45%，最低一級為3%，共7級。
2、經營所得適用5級超額累進稅率。適用按年計算、分月預繳稅款的個體工商戶的生產、經營所得和對企事業單位的承包經營、承租經營的全年應納稅所得額劃分級距，最低一級為5%，最高一級為35%，共5級。
3、比例稅率。對個人的利息、股息、紅利所得，財產租賃所得，財產轉讓所得，偶然所得和其他所得，按次計算征收個人所得稅，適用20%的比例稅率。
法律依據
《個人所得稅管理辦法》第三條
個人收入檔案管理制度是指，稅務機關按照要求對每個納稅人的個人基本信息、收入和納稅信息以及相關信息建立檔案，并對其實施動態管理的一項制度。

個人所得稅應納稅所得額的計算：
1、居民個人的綜合所得，以每一納稅年度的收入額減除費用六萬元以及專項扣除、專項附加扣除和依法確定的其他扣除后的余額，為應納稅所得額；
2、非居民個人的工資、薪金所得。
個人所得稅的納稅義務人，既包括居民納稅義務人，也包括非居民納稅義務人。居民納稅義務人負有完全納稅的義務，必須就其來源于中國境內、境外的全部所得繳納個人所得稅；而非居民納稅義務人僅就其來源于中國境內的所得，繳納個人所得稅。個人所得稅是國家對本國公民、居住在本國境內的個人的所得和境外個人來源于本國的所得征收的一種所得稅。在有些國家，個人所得稅是主體稅種，在財政收入中占較大比重，對經濟亦有較大影響。
個人所得稅是調整征稅機關與自然人（居民、非居民人）之間在個人所得稅的征納與管理過程中所發生的社會關系的法律規范的總稱。個人所得稅的征收方式可分為按月計征和按年計征。個體工商戶的生產、經營所得，對企業事業單位的承包經營、承租經營所得，特定行業的工資、薪金所得，從中國境外取得的所得，實行按年計征應納稅額，其他所得應納稅額實行按月計征。
【法律依據】
《中華人民共和國個人所得稅法》
第十二條 納稅人取得經營所得，按年計算個人所得稅，由納稅人在月度或者季度終了后十五日內向稅務機關報送納稅申報表，并預繳稅款；在取得所得的次年三月三十一日前辦理匯算清繳。納稅人取得利息、股息、紅利所得，財產租賃所得，財產轉讓所得和偶然所得，按月或者按次計算個人所得稅，有扣繳義務人的，由扣繳義務人按月或者按次代扣代繳稅款。