工資超過5000以上扣稅方法包括：

1、應納稅所得額=月度收入-5000元（起征點）-專項扣除（三險一金等）-專項附加扣除-依法確定的其他扣除；

2、中國個人所得稅的征收方式實行源泉扣繳與自行申報并用法，注重源泉扣繳。個人所得稅的征收方式可分為按月計征和按年計征：

（1）個體工商戶的生產、經營所得，對企業事業單位的承包經營、承租經營所得，特定行業的工資、薪金所得，從中國境外取得的所得，實行按年計征應納稅額；

（2）其他所得應納稅額實行按月計征。

比如說工資是6000元的話，那么繳稅的基數就是1000元乘以10%，也就是100元的個人所得稅，然后再減去專項扣除就可以了。

個稅征收范圍如下:

1、居民個人的綜合所得，以每一納稅年度的收入額減除費用六萬元以及專項扣除、專項附加扣除和依法確定的其他扣除后的余額，為應納稅所得額。

2、非居民個人的工資、薪金所得，以每月收入額減除費用五千元后的余額為應納稅所得額；勞務報酬所得、稿酬所得、特許權使用費所得，以每次收入額為應納稅所得額。

3、經營所得，以每一納稅年度的收入總額減除成本、費用以及損失后的余額，為應納稅所得額。

4、財產租賃所得，每次收入不超過四千元的，減除費用八百元；四千元以上的，減除百分之二十的費用，其余額為應納稅所得額。

5、財產轉讓所得，以轉讓財產的收入額減除財產原值和合理費用后的余額，為應納稅所得額。

6、利息、股息、紅利所得和偶然所得，以每次收入額為應納稅所得額。

工資扣稅標準：

1、工資范圍在1-5000元之間的，包括5000元，適用個人所得稅稅率為0%；

2、工資范圍在5000-8000元之間的，包括8000元，適用個人所得稅稅率為3%；

3、工資范圍在8000-17000元之間的，包括17000元，適用個人所得稅稅率為10%；

4、工資范圍在17000-30000元之間的，包括30000元，適用個人所得稅稅率為20%；

5、工資范圍在30000-40000元之間的，包括40000元，適用個人所得稅稅率為25%；

6、工資范圍在40000-60000元之間的，包括60000元，適用個人所得稅稅率為30%；

7、工資范圍在60000-85000元之間的，包括85000元，適用個人所得稅稅率為35%；

8、工資范圍在85000元以上的，適用個人所得稅稅率為45%。

個人所得稅的繳納流程包括：

1、工資薪金所得稅實行扣繳制，由企業在發放給職工前進行代扣代繳，先到地稅局辦理代扣代繳相關手續；

2、然后在發放工資前，由企業財務人員按照稅法規定，核算出每個人的應納稅所得額。統一到當地地稅局申報繳納即可；

3、扣繳義務人每月或者每次預扣、代扣的稅款，應當在次月十五日內繳入國庫，并向稅務機關報送扣繳個人所得稅申報表；

4、納稅人辦理匯算清繳退稅或者扣繳義務人為納稅人辦理匯算清繳退稅的，稅務機關審核后，按照國庫管理的有關規定辦理退稅。

《中華人民共和國個人所得稅法》

第二條 下列各項個人所得，應當繳納個人所得稅：

（一）工資、薪金所得；

（二）勞務報酬所得；

（三）稿酬所得；

（四）特許權使用費所得；

（五）經營所得；

（六）利息、股息、紅利所得；

（七）財產租賃所得；

（八）財產轉讓所得；

（九）偶然所得。 居民個人取得前款第一項至第四項所得（以下稱綜合所得），按納稅年度合并計算個人所得稅；非居民個人取得前款第一項至第四項所得，按月或者按次分項計算個人所得稅。納稅人取得前款第五項至第九項所得，依照本法規定分別計算個人所得稅。

不一定。

工資超過5千元，是否需要繳納個人所得稅，要看具體情況。
對于非居民個人，由于工資薪金所得是按月征收的，以每月收入額減除費用五千元后的余額為應納稅所得額，所以，非居民個人月工資超過5千元，是需要繳納個人所得稅的。
對于居民個人，由于工資薪金所得需要并入綜合所得，而且綜合所得是按年征收、按月預繳的，每年減除費用六萬元，平均每月減除費用5千元，而且，每月還要扣除專項扣除（五險一金）、專項附加扣除等等，所以，工資超過5千元是否繳納個人所得稅就不好說了。
總的來說，對于居民個人，如果全年綜合所得，減去6萬元減除費用、減去五險一金個人繳納部分、減去專項附加扣除等等還有余額，那么就需要繳納個人所得稅；否則就不需要繳納個人所得稅。