增值稅專用發票的抵扣流程：1、首先需要將稅控盤插到電腦的主機上，登錄到增值稅綜合服務平臺，點擊需要認證的月份；2、勾選好發票的開票日期，點擊查詢；3、勾選收到的紙質需要認證的發票，點擊確定并提交；4、提交之后選擇申請統計，勾選認證成功；5、最后進入電子稅務局填寫增值稅申報表進行抵扣。
法律客觀：《中華人民共和國發票管理辦法》第二十二條開具發票應當按照規定的時限、順序、欄目，全部聯次一次性如實開具，并加蓋發票專用章。任何單位和個人不得有下列虛開發票行為：（一）為他人、為自己開具與實際經營業務情況不符的發票；（二）讓他人為自己開具與實際經營業務情況不符的發票；（三）介紹他人開具與實際經營業務情況不符的發票。
1、應交的稅費等銷項稅減進項稅；
2、一般納稅人申請抵扣的防偽稅控系統；
3、以及其他需要認證抵扣的發票；
4、必須自該專用發票開具之日起180日內認證才可。
增值稅專用發票指專門用于結算銷售貨物和提供加工、修理修配勞務使用的一種發票。增值稅專用發票只限于增值稅一般納稅人領購使用，增值稅小規模納稅人不得領購使用。
1、應交的稅費等銷項稅減進項稅；
2、一般納稅人申請抵扣的防偽稅控系統；
3、以及其他需要認證抵扣的發票；
4、必須自該專用發票開具之日起180日內認證才可。
增值稅專用發票指專門用于結算銷售貨物和提供加工、修理修配勞務使用的一種發票。增值稅專用發票只限于增值稅一般納稅人領購使用，增值稅小規模納稅人的
增值稅抵扣的抵扣方式：當事人提供材料，證明存在從海關取得的海關進口增值稅專用繳款書、從稅務機關或者扣繳義務人取得的代扣代繳稅款的完稅憑證、從銷售方取得的增值稅專用發票等進項稅額。申請抵扣。扣稅機關認定情況屬實的，準予從銷項稅額中抵扣。
【【法律依據】】
《中華人民共和國增值稅暫行條例》第八條
納稅人購進貨物、勞務、服務、無形資產、不動產支付或者負擔的增值稅額，為進項稅橡者瞎額。
下列嫌鏈進項稅額準予從銷項稅額中抵扣：
（一）從銷售方取得的增值稅專用發票上注明的增值稅額。
（二）從海關取得的海關進口增值稅專用繳款書上注明的增值稅額。
（三）購進農產品，除取得增值稅專用發票或者海關進口增值稅專用繳款書外，按照農產品收購發票或者銷售發票上注明的農產品買價和11%的扣除率計算的進項稅額，梁空國務院另有規定的除外。進項稅額計算公式：進項稅額=買價×扣除率。
（四）自境外單位或者個人購進勞務、服務、無形資產或者境內的不動產，從稅務機關或者扣繳義務人取得的代扣代繳稅款的完稅憑證上注明的增值稅額。
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