農村合作醫療保險是由政府組織的，農民自愿參與的以大病統籌為主的新型農村合作醫療制度。農村合作醫療保險和城鎮居民醫療保險的性質是一致的，旨在為了緩解農民因病致貧。那么農村合作醫療保險報銷流程是怎樣的？農村合作醫療報銷流程【1】農村合作醫療的參保人員可以憑本人有效證件、醫療卡在區內鄉鎮級普通門診定點醫療機構直接刷卡報銷，區外市內定點醫療結構出院結賬是可直接刷卡報銷。【2】在市外2級或2級以上的公立醫院就診的，應在出院后3個月內攜帶原始發票、住院醫療費用清單、門診病歷、醫療卡、身份證等前往當地新農合窗口報銷醫療費用。以上就是針對不同就診情況農村合作醫療保險的報銷流程，對于參保了農村合作醫療保險的居民來說，在生病住院之后就可以參考以上流程進行報銷。

醫院新農合報銷流程具體如下：
1、新型農村合作醫療參保患者須憑本人醫療卡、本人有效身份證，經確認身份后，在區內鄉鎮級普通門診定點醫療機構可直接刷卡報銷，在區內及區外市內定點醫療機構住院，出院結帳時直接刷卡報銷；
2、在市外二級及二級以上公立醫療機構醫院住院治療的參保患者，應在出院后三個月內，由參保人或其家屬帶醫藥費用原始發票、住院醫藥費用匯總明細清單、出院小結及門診病歷、患者身份證、醫療卡、戶口簿、經辦人身份證到區行政服務中心新農合窗口報銷醫藥費用；
3、特殊病種門診報銷可持二級及二級以上定點醫療機構出具的病歷及有關檢查、化驗報告等相關資料及醫療機構證明書，以及《新型農村合作醫療特殊病種門診治療審批表》向新農合業管中心提出申請，經區新農合辦審核批準后，其門診醫藥費用可以列入新農合基金的報銷范圍，按住院報銷標準以年度為單位報銷；
4、因意外傷害的住院患者，出院后還需提交由戶口所在村（居）簽字蓋章的意外傷害引發的原因確認證明以及醫院的病案記錄。對于無法提供有效證明及記錄的，不予受理。報銷周期為經區行政服務中心一樓新農合窗口受理起30個工作日內完成，經新農合業管中心稽查人員調查、審核，屬實后予以報銷；責任由第三方負責的，不予報銷；住院患者自己也承擔部分責任的，憑協議書或相關證明到區行政服務中心一樓新農合窗口報銷自己承擔部分的醫藥費用。
新農合辦理流程：
1、個人申請。農村居民攜帶戶口簿、二代居民身份證原件和復印件到戶籍所在地村（居）委會提出參加農村醫療保險申請，選擇繳費檔次，填寫《新型農村社會醫療保險參保登記表》（以下簡稱《參保登記表》）一式二份；
2、村協理員檢查。村協理員負責檢查《參保登記表》、《農村戶籍老年人家庭社會關系表》是否填寫完整，填寫的姓名、二代身份證號碼等信息是否準確，是否有個人簽字或蓋章、按手印，檢查參保人員提供的相關材料是否齊全，檢查無誤后，在《參保登記表》上簽字，加蓋村委會公章，附上參保人員本人居民二代身份證和戶口簿復印件等材料，然后上報鄉鎮勞動保障事務所；
3、鄉鎮初審。鄉鎮勞動保障事務所對村里上報的參保登記有關材料進行初審，審核無誤后，經辦人員在《參保登記表》上簽字，加蓋鄉鎮保障所公章，及時將參保人員的基本信息錄入新農保信息系統，將《參保登記表》、二代居民身份證和戶口簿復印件等材料上報縣農保中心；
4、縣農保中心復核。縣農保中心收到鄉鎮上報的參保登記有關材料及時進行復核，無誤后，對鄉鎮勞動保障事務所錄入的參保人員基本信息進行確認，為參保人員建立個人賬戶；在《參保登記表》簽字、蓋章，將有關材料歸檔備案。
綜上所述，拿著戶口冊和身份證，帶上兩張照片，到戶口所在地的基層民政部門醫保辦辦理就行。農村合作醫療，當年購買，次年生效享受報銷。合作醫療并不支持異地醫療，在就醫前需要征得當地合作醫療管理機構的批準，最好回購買地指定醫療機構。
【法律依據】：
《中華人民共和國社會保險法》第二十條
國家建立和完善新型農村社會養老保險制度。
新型農村社會養老保險實行個人繳費、集體補助和政府補貼相結合。
第二十一條
新型農村社會養老保險待遇由基礎養老金和個人賬戶養老金組成。
參加新型農村社會養老保險的農村居民，符合國家規定條件的，按月領取新型農村社會養老保險待遇。

參保戶將報銷所需資料備齊后交村（社區）合作醫療聯絡員，由村（社區）合作醫療聯絡員審核后報鎮合作醫療聯絡員，再由鎮聯絡員送區農易辦結報中心進行報銷。
農村合作醫療保險的報銷，可以參照下列流程進行報銷即可。具體如下：
1、新農合參保患者可以憑本人身份證、醫保卡，在區內鄉鎮級普通門診定點醫療機構可直接刷卡報銷，在區內及區外市內定點醫療機構住院，出院結帳時直接刷卡報銷。
2、在市外二級及二級以上的公立醫療機構醫院住院治療的參保患者，應在出院后的3個月后，將擦那波人的醫藥費原始發票、住院醫藥費用匯總明細清單、出院小結、醫療卡、戶口本、門診病歷、經辦人身份證直接到新農合窗口報銷醫藥費用。
3、特殊病種門診報銷，參保患者可持二級及二級以上定點醫療機構出具的病歷及相關檢查報告資料以及《新農合特殊病種門診治療審批表》想新農合業管中心提出申請，經過審核批準之后，其門診醫藥費用是可以列入到新農合的報銷范圍內的。
4、因意外傷害住院的話只能和，出院后需要提交意外傷害引發的原因證明和醫院的病案記錄，對于一些無法提供有效證明和記錄的，不予進行受理。參保患者將資料調教之后，新農合窗口受理后的30個工作日內完成，不過，需要經過新農合業管中心稽查人員的調查和審核，情況屬實之后才能予以報銷。