食品經(jīng)營(yíng)許可證的辦理流程如下：
一、申請(qǐng)：申報(bào)人通過(guò)食品藥品監(jiān)督管理局網(wǎng)進(jìn)行網(wǎng)上申報(bào)。
二、受理：網(wǎng)上提交成功后5個(gè)工作日內(nèi)對(duì)資料進(jìn)行審核，材料不齊全或不符合要求的，通過(guò)網(wǎng)上審批系統(tǒng)向申請(qǐng)人發(fā)出補(bǔ)正材料通知；不屬于本部門職權(quán)范圍或申請(qǐng)事項(xiàng)不需行政許可的，不予受理，并通過(guò)網(wǎng)上審批系統(tǒng)向申請(qǐng)人發(fā)出不予受理的理由及通知；符合申請(qǐng)要求的，向申請(qǐng)人發(fā)出電子《受理通知書》。
三、審查：審查過(guò)程中，如有需配合環(huán)節(jié)，申請(qǐng)人應(yīng)積極配合。
四、決定：決定機(jī)構(gòu)作出準(zhǔn)予許可或不予許可的決定。
五、制證發(fā)證：
1、準(zhǔn)予許可的事項(xiàng)，網(wǎng)上即時(shí)生成《藥品生產(chǎn)許可證》電子證書。生成電子證書的同時(shí)，即時(shí)通知申請(qǐng)人可獲取行政許可電子證書，或申請(qǐng)人可憑《受理通知單》和身份證領(lǐng)取證件。
2、不予許可的事項(xiàng)，網(wǎng)上發(fā)出電子《不予行政許可決定書》，系統(tǒng)即時(shí)通知企業(yè)，并同步在電子證書公示平臺(tái)上公示。
在其中，大家需要注意的是：食品經(jīng)營(yíng)許可證是到食藥監(jiān)局辦理，在食藥監(jiān)局網(wǎng)站上可以查詢所需的資料，有疑問(wèn)的可以打電話到食藥監(jiān)局進(jìn)行咨詢。另外，如果食藥監(jiān)局和工商局合并了，便是到市場(chǎng)監(jiān)督局。
擴(kuò)展資料：
一、食品經(jīng)營(yíng)許可證網(wǎng)上申請(qǐng)
1、企業(yè)用戶注冊(cè)登陸
企業(yè)用戶要想進(jìn)行網(wǎng)上辦理食品流通許可業(yè)務(wù)，先注冊(cè)用戶，然后登陸進(jìn)入系統(tǒng)進(jìn)行網(wǎng)上申辦。
2、業(yè)務(wù)類型說(shuō)明
選擇自己要辦理的選擇業(yè)務(wù)類型然后進(jìn)行登記辦理。
3、填寫對(duì)應(yīng)的申請(qǐng)信息
在對(duì)應(yīng)的業(yè)務(wù)類型中填寫相應(yīng)的信息，填寫完后請(qǐng)認(rèn)真核對(duì)信息的正確性，點(diǎn)擊”保存“按鈕進(jìn)行保存，點(diǎn)擊”打印“按鈕，打印出相應(yīng)的申請(qǐng)表和申請(qǐng)回執(zhí)。
4、到窗口申請(qǐng)
在網(wǎng)上進(jìn)行了預(yù)報(bào)后，帶齊申請(qǐng)材料到對(duì)應(yīng)的窗口(食藥監(jiān)窗口)進(jìn)行辦理。同意受理之后，會(huì)上門核查場(chǎng)地，這個(gè)環(huán)節(jié)過(guò)了，就等著拿證了。
法律依據(jù)：
《中華人民共和國(guó)行政許可法》第二十九條公民、法人或者其他組織從事特定活動(dòng)，依法需要取得行政許可的，應(yīng)當(dāng)向行政機(jī)關(guān)提出申請(qǐng)。申請(qǐng)書需要采用格式文本的，行政機(jī)關(guān)應(yīng)當(dāng)向申請(qǐng)人提供行政許可申請(qǐng)書格式文本。申請(qǐng)書格式文本中不得包含與申請(qǐng)行政許可事項(xiàng)沒有直接關(guān)系的內(nèi)容。申請(qǐng)人可以委托代理人提出行政許可申請(qǐng)。但是，依法應(yīng)當(dāng)由申請(qǐng)人到行政機(jī)關(guān)辦公場(chǎng)所提出行政許可申請(qǐng)的除外。

一、食品許可證辦理流程是什么
1、食品許可證辦理流程如下：
（1）首先填寫好食品經(jīng)營(yíng)許可證的申請(qǐng)表；
（2）準(zhǔn)備法人身份證復(fù)印件、從業(yè)人員身份證復(fù)印件和健康證；
（3）繪制店鋪的平面圖；
（4）到當(dāng)?shù)厥袌?chǎng)監(jiān)督管理局提交如下資料；
（5）資料提交成功之后，市場(chǎng)監(jiān)督管理局會(huì)安排人員來(lái)看場(chǎng)地；
（6）檢查通過(guò)后，在一定時(shí)間內(nèi)通知申請(qǐng)人來(lái)領(lǐng)取食品經(jīng)營(yíng)許可證。
2、法律依據(jù)：《食品經(jīng)營(yíng)許可管理辦法》第十二條
申請(qǐng)食品經(jīng)營(yíng)許可，應(yīng)當(dāng)向申請(qǐng)人所在地縣級(jí)以上地方食品藥品監(jiān)督管理部門提交下列材料：
（一）食品經(jīng)營(yíng)許可申請(qǐng)書；
（二）營(yíng)業(yè)執(zhí)照或者其他主體資格證明文件復(fù)印件；
（三）與食品經(jīng)營(yíng)相適應(yīng)的主要設(shè)備設(shè)施布局、操作流程等文件；
（四）食品安全自查、從業(yè)人員健康管理、進(jìn)貨查驗(yàn)記錄、食品安全事故處置等保證食品安全的規(guī)章制度。
利用自動(dòng)售貨設(shè)備從事食品銷售的，申請(qǐng)人還應(yīng)當(dāng)提交自動(dòng)售貨設(shè)備的產(chǎn)品合格證明、具體放置地點(diǎn)，經(jīng)營(yíng)者名稱、住所、聯(lián)系方式、食品經(jīng)營(yíng)許可證的公示方法等材料。
申請(qǐng)人委托他人辦理食品經(jīng)營(yíng)許可申請(qǐng)的，代理人應(yīng)當(dāng)提交授權(quán)委托書以及代理人的身份證明文件。
二、申請(qǐng)食品經(jīng)營(yíng)許可，應(yīng)當(dāng)符合哪些條件
申請(qǐng)食品經(jīng)營(yíng)許可，應(yīng)當(dāng)符合下列條件：
1、具有與經(jīng)營(yíng)的食品品種、數(shù)量相適應(yīng)的食品原料處理和食品加工、銷售、貯存等場(chǎng)所，保持該場(chǎng)所環(huán)境整潔，并與有毒、有害場(chǎng)所以及其他污染源保持規(guī)定的距離；
2、具有與經(jīng)營(yíng)的食品品種、數(shù)量相適應(yīng)的經(jīng)營(yíng)設(shè)備或者設(shè)施，有相應(yīng)的消毒、更衣、盥洗、采光、照明、通風(fēng)、防腐、防塵、防蠅、防鼠、防蟲、洗滌以及處理廢水、存放垃圾和廢棄物的設(shè)備或者設(shè)施；
3、有專職或者兼職的食品安全管理人員和保證食品安全的規(guī)章制度；
4、具有合理的設(shè)備布局和工藝流程，防止待加工食品與直接入口食品、原料與成品交叉污染，避免食品接觸有毒物、不潔物；
5、法律、法規(guī)規(guī)定的其他條件。