法律主觀：

農村合作醫療的報銷流程是： 1、參保人員可以前往定點醫療機構辦理報銷手續； 2、經確認身份后，可直接刷卡報銷。 符合基本醫療保險藥品目錄、診療項目、醫療服務設施標準以及急診、搶救的醫療費用，可以由基本醫療保險基金進行報銷。

法律客觀：

《中華人民共和國社會保險法》第二十八條 符合基本醫療保險藥品目錄、診療項目、醫療服務設施標準以及急診、搶救的醫療費用，按照國家規定從基本醫療保險基金中支付。 《中華人民共和國社會保險法》第二十九條 參保人員醫療費用中應當由基本醫療保險基金支付的部分，由社會保險經辦機構與醫療機構、藥品經營單位直接結算。 社會保險行政部門和衛生行政部門應當建立異地就醫醫療費用結算制度，方便參保人員享受基本醫療保險待遇。

農村合作醫療保險報銷流程是什么？
1、參加了新型農村合作醫療保險的患者可憑本人有效證件、醫療卡，經確認身份后，在區內鄉鎮級普通門診定點醫療機構可以直接刷卡報銷，在區內及區外市內定點醫療機構住院，出院結帳時可以直接刷卡報銷；
2、在市外2級及2級以上公立醫院住院治療的參保患者，應在出院后的3個月內，由參保人或其家屬帶醫療費用原始發票、住院醫療費用匯總明細清單、出院小結、門診病歷、醫療卡、患者身份證、戶口簿、經辦人身份證到區行政服務中心新農合窗口報銷醫藥費用；
3、特殊病種門診報銷可持2級及2級以上定點醫療機構出具的病例以及相關檢查、化驗報告、醫療機構證明書等資料以及《新型農村合作醫療特殊病種門診治療審批表》向新農合業管中心提出申請，經審核批準后，其門診醫藥費用可以列入新農合基金的報銷范圍，可按照住院報銷標準以年度為單位進行報銷；
4、因意外傷害的住院患者，出院后需要提交有戶口所在村（居）簽字蓋章的意外傷害引發的原因確認證明以及醫院的病案記錄。對于無法提供有效證明及記錄的，不予受理。一旦經過新農合調查、審核之后，一旦屬實則予以報銷。如果責任是由第三方負責的，是不予報銷的。
農村合作醫療保險報銷比例是多少？
1、門診補償
在村衛生室及村中心衛生室就診，可以報銷60%的醫療費用；在鄉衛生院就診，可以報銷40%的醫療費用；在二級醫院就診，可以報銷30%的醫療費用；在三級醫院就診，可以報銷20%的醫療費用；
2、住院報銷比例
在鄉衛生院就診，可以報銷60%的醫療費用；在二級醫院就診，可以報銷40%的醫療費用；在三級醫院就診，可以報銷30%的醫療費用；
3、大病補償
凡是參加新農合的住院病人一次性或全年累計的醫療費用超過5000以上的部分是分段進行賠償的，即5001—1萬元補償65%，10001—1.8萬元補償70%。
綜上所述，參加了新型農村合作醫療保險的農民，一旦生病住院可以參照以上方法進行報銷，這樣可以加快報銷辦理手續，給您帶來更多的便利。
【法律依據】：
《中華人民共和國社會保險法》
第二十八條
符合基本醫療保險藥品目錄、診療項目、醫療服務設施標準以及急診、搶救的醫療費用，按照國家規定從基本醫療保險基金中支付。第二十九條參保人員醫療費用中應當由基本醫療保險基金支付的部分，由社會保險經辦機構與醫療機構、藥品經營單位直接結算。 社會保險行政部門和衛生行政部門應當建立異地就醫醫療費用結算制度，方便參保人員享受基本醫療保險待遇。