完善結構性減稅實際還有另一個更重要的內容就是完善現行稅制，盡量保持稅制的中性，減少稅制對正常經濟活動的干預和扭曲。
　　企業的目標是盈利，但不同的企業獲取同樣的利潤水平會采取不同的商業模式。如果我們的稅制僅因為人家商業模式不同（即方式的不同），就對同樣的結果征收不同的稅收，則這樣的稅制就不太中性。就好比現在大家總喜歡搞工資、薪金個人所得稅籌劃一樣，同樣的兩個人，每年都拿50000萬的工資，但僅因為一個人是按月平均拿的，一個是每月拿一部分，最后拿年終獎的，結果他們的稅后收入就因為稅制的原因而差異，這樣的稅制就并不好。社會為這些問題進行籌劃發生的成本實際是一種資源的浪費。
　　當然，我們現在也在做這方面工作。比如國家啟動的營業稅改征增值稅的改革就是一個很好的案例。相對于營業稅而言，增值稅的確具有中性稅制的特征。不管企業采用什么商業模式，只要增值額一樣，理論上講征收的增值稅就是一樣的。這一點，總額征稅的營業稅是不具備的。再比如，如果我們個人所得稅實行綜合征收，按年計算的話，則能很好的避免一年內工資發放不平均導致的稅負差異問題。
　　但總體來看，我們在提高稅制中性上做的還不夠。現在似乎理論界也很少談論這個問題了。但是，一個好的稅制不僅提高經濟運行的質量，減少資源浪費。也能和諧征納關系，提高征收效率。
　　因此，在結構性減稅的大背景下，對于現行稅制的完善和改良同樣是非常重要的內容，甚至遠比降低一點稅率、給一點免稅對中國經濟的長遠發展有更大的益處。

1、減稅呼聲不斷。美國《福布斯》雜志2007年發布的一份“全球稅負痛苦指數”顯示，中國稅負僅次于法國、比利時，名列世界第三。雖然不能斷定這個排名的科學性，但是近年我國公眾對稅負過高一直呼吁不斷。根據中國稅負現狀，順應全球性減稅趨勢，選擇“完善稅制、適度減稅”的稅改政策必將對國民經濟的各個方面產生重大影響。 　　2、稅收總體實力不斷增強。稅收對經濟的刺激作用是輔助的，如果總量太小、占比太低，對刺激經濟所起的作用就更小。近年來中國稅收總體實力不斷增強。2007年稅收總額占GDP的比重達到22%，減稅會對刺激經濟發展有一定影響力。所以，現在正是實施結構性減稅的好時機。 　　3、優化稅制結構的需要。中國現行的稅負結構存在諸多不合理，一定程度上抑制了投資與消費需求的增長。中國1994年分稅制改革后確定了“雙主體”的稅制結構模式，但在實際運行中，流轉稅收入在稅收收入總額中所占比重高達約70%，所得稅的比重卻僅為20%左右，“雙主體”稅制實際上是“跛足稅制”。因此，實行結構性減稅也是優化現行稅制結構的需要。

就是有的行業減稅，有的不減。主要是對一些節能環保高科技類現代產業減稅。

很直接。就是給國家鼓勵的企業減稅；不給希望淘汰的產業減稅。達到供給結構改變的目的。