根據新《合伙企業法》，你這種合伙企業屬于“有限合伙企業”，自然人屬于普通合伙人，另一家企業屬于有限合伙人。普通合伙人要對合伙企業承擔無限連帶責任。而有限合伙人雖不參與經營，但只以出資額為限承擔有限責任。在此種前提下，如果你們幾個朋友選一個人作為承擔無限責任的普通合伙人，這里面的法律風險和道德風險會相當多。而且，無法為你們訂立合法的合同來保護這種隱性合伙關系。所以一般而言，不推薦你們的這種合伙方式。
你們的選擇有二：
1、每個自然人都以普通合伙人的身份與那家企業一起成立新的合伙企業。這樣法律責任和義務比較清晰。對每一方也公平。
2、如果那家企業不同意那么多普通合伙人，那么可以你們幾個朋友先成立一家有限責任公司，再以這家公司與那家企業成立新的有限責任公司。那么每一方都可以以出資額為限承擔有限責任，這樣也比較公平。

找到我們三人商量一起做，但是該店一直以個體形式營業，之前考慮的是入股，...個人獨資企業投資人以其個人財產或者家庭共有財產對企業債務承擔無限責任，合伙...

這是正常的現象，公司的經營模式，以及老板的盈利方法來的。

一般情況下，根據本人經驗主要是從以下方面考量：
一是你所謂的“合伙人公司”實際上是個合伙企業或者有限合伙企業，起到的是一個持股平臺的作用，實踐當中，有的公司為了吸引投資，在社會上拉來很多投資人，但是因為《公司法》對有限公司的股東人數的限制，為了突破該限制，公司的股東中設立一家合伙企業或者眾多合伙企業，來分散“股東人數”。
二是出于控制的考慮。實際控制人可能通過持股平臺如合伙企業或者有限合伙企業，加強對公司的控制。
三是從稅務籌劃的角度考慮。你應該能注意到，很多投資公司尤其是股權投資公司的股東會有合伙企業，且多數合伙企業注冊在稅收洼地，原因在于，股權投資公司有可能通過股權投資獲得具額收益。公司在取得經營利潤后，在依《公司法》提取公積后的利潤要繳納企業所得稅，然后分紅，如果分給的是合伙企業，合伙企業不征企業所得稅，合伙企業的合伙人只需要繳納個人所得稅即可。如果合伙企業注冊在稅收洼地，作為自然人的合伙人所繳納的個人所得稅如果采用核定征收并享受稅收返還政策的，自然人合伙人的稅務負擔會減少很多很多很多。

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牛B
沒個5千萬，就回家種田去。

幾個人合伙人購買了一個公司A，又成立了一個新公司B。
如用A公司的固定資產處置設立了新公司B，新公司借固定資產，貸實收資本；B公司為A公司的子公司。
如用A公司的資金處置設立了新公司B，新公司借貨幣資金，貸實收資本；B公司為A公司的子公司。
如幾個合伙人用自己的資金或資產重新設立新公司B，新公司借貨幣資金或資產，貸實收資本；B公司和A公司無直接關系。
僅供參考。