“收視率是萬惡之源”，這是崔永元對自己為何患上抑郁癥的回答。
從1999年開始，崔永元的王牌節目《實話實說》因為受到了國內電視媒體的紛紛效仿，收視率開始下降。相同節目多了，用現在的話講就是被“分流”了，而且當時還分的很嚴重，從一度高達5.4%的收視率，降到了0.66%的低谷，崔永元使盡了渾身解數，也沒能將收視率重新挽救回來。
所以崔永元開始焦慮，心情煩躁，又特別的糾結，節目有不斷的給他施加壓力。聽說哪些日子里，崔永元一直都夜不能寐，甚至經常自己回到家里就把頭往墻上撞，大罵自己沒用！最后患上抑郁癥。
也是因為重度抑郁，崔永元離開了《實話實說》這個舞臺，當年在家里，父母都害怕崔永元尋短見，搬來個單人床，每晚都“陪夜”，生怕崔永元想不開自殺了。
不過所幸，后來崔永元在父母的陪同下展開了全面化的治療，抑郁癥得到緩解，精神一點點的開始好轉。最終痊愈。

崔永元離開央視和崔永元與方舟子的爭論沒有任何關系，但是崔永元卻公然對媒體說是方舟子去央視告他的狀才導致他離開央視，且不說央視不大可能因為不相干的人告狀而開除一個著名主持人，就算開除了崔永元也不可能是方舟子去告的狀，因為方舟子既然和他交惡爭辯，就沒必要否認告狀這件事，更何況現在方舟子都公開起訴崔永元造謠誹謗了，起訴書都是在騰訊微博公開置頂的。
之前也有崔永元離開央視加入某衛視的報道，那時候崔永元和方舟子的爭執還都沒開始?？梢娺@事純粹就是崔永元的一面之辭，或許他有被迫害妄想癥，或許他又抑郁了。總之，只有他自己知道為什么要離開央視。
目前崔永元和方舟子辯論轉基因的問題也進入白熱化階段，崔永元的微博上基本上出口成臟，造謠傳謠抹黑無所不用其極，使不少粉絲對已經證實安全的轉基因上市產品產生了懷疑甚至是恐慌；而方舟子則逐條回應，通過科普和說理來為轉基因辟謠。
雙方在爭辯期間都發生了很多精彩環節，崔永元對方舟子開始進行人身攻擊，而方舟子則指出崔永元掛在紅十字會名下的基金賬目缺失、虛報價格騙取管理費等重重問題；之后崔永元搬出著名方黑“大洋彼岸的紳士”、“獨立調查員”、著名反轉人士曹明華、水變油專家陳一文等一干人作為后援，不斷轉發他們攻擊方舟子的微博；于是方舟子公開起訴崔永元造謠誹謗，海淀法院受理并在微博上宣布公開直播庭審過程；之后崔永元接受南方周末采訪大談質疑轉基因并且推薦能治愈癌癥的有機食品，方舟子逐條批駁；最后崔永元拼湊了一篇譏諷方舟子的長文作為這次爭論里唯一一段超過三句半的微博，方舟子回應了三句半。。。。。。
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