(一)本罪與放火罪、決水罪、爆炸罪、投毒罪的界限上述方法也可能被用來破壞生產經營，這時，行為不僅觸犯了破壞生產經營罪，同時也觸犯了上述危害公共安全罪，對這種同時觸犯兩種罪名的行為，一般應按照危害公共安全罪論處，不定破壞生產經營罪，因為這種行為危害的主要是公共安全，但是，如果實施上述行為危害的主要是生產經營，而不是公共安全時，則按破壞生產經營罪論處。(二)本罪與破壞交通工具、破壞交通設備、破壞電力設備及易燃易爆設備罪的界限破壞上述特定對象，往往會直接或者間接地使生產經營遭到破壞，對這種破壞行為定性，主要從犯罪對象和客體上分析，凡破壞生產過程中的上述工具、設備，危害的主要是生產經營的，定破壞生產經營罪，凡破壞的是用于公共生活的上述工具、設備。危害的主要是公共安全的，分別按破壞交通工具罪、破壞交通設備罪、破壞電力設備罪和破壞易燃易爆設備罪定性。(三)本罪與重大責任事故罪的界限區別這兩種罪，關鍵要查明行為人主觀罪過的內容，首先查明破壞行為是故意實施的，還是過失實施的，其次查明行為人有無泄憤報復等個人目的。過失實施破壞行為，給生產造成重大損失的，構成重大責任事故罪。而出于泄憤報復等個人目的故意實施破壞生產經營行為的，構成破壞生產經營罪。
【法律依據】
《中華人民共和國刑法》
第二百七十六條 由于泄憤報復或者其他個人目的，毀壞機器設備、殘害耕畜或者以其他方法破壞生產經營的，處三年以下有期徒刑、拘役或者管制;情節嚴重的，處三年以上七年以下有期徒刑。

擾亂生產經營秩序處警告或者二百元以下罰款。有下列行為之一的，處警告或者二百元以下罰款；情節較重的，處五日以上十日以下拘留，可以并處五百元以下罰款：
1、擾亂機關、團體、企業、事業單位秩序，致使工作、生產、營業、醫療、教學、科研不能正常進行，尚未造成嚴重損失的；
2、擾亂車站、港口、碼頭、機場、商場、公園、展覽館或者其他公共場所秩序的；
3、擾亂公共汽車、電車、火車、船舶、航空器或者其他公共交通工具上的秩序的；
4、非法攔截或者強登、扒乘機動車、船舶、航空器以及其他交通工具，影響交通工具正常行駛的；
5、破壞依法進行的選舉秩序的。
《中華人民共和國治安管理處罰法 》
第二十六條
有下列行為之一的，處五日以上十日以下的拘留，可以并處五百元以下罰款；情節較重的，處十日以上十五日以下拘留，可以并處一千元以下罰款：
（一）結伙斗毆的；
（二）追逐、攔截他人的；
（三）強拿硬要或者任意損毀、占用公私財物的；
（四）其他尋釁滋事行為。