對侵犯商業(yè)秘密罪的認定和處罰是：行為人有披露、使用或者允許他人使用以前項手段獲取的權(quán)利人的商業(yè)秘密等行為，情節(jié)嚴重的，會構(gòu)成本罪，一般應處三年以下有期徒刑，并處或者單處罰金；情節(jié)特別嚴重的，處三年以上十年以下有期徒刑，并處罰金。

侵犯商業(yè)秘密行為的證據(jù)認定問題 1.公訴機關(guān)指控被告人侵犯商業(yè)秘密的舉證難。 這種舉證難主要表現(xiàn)在兩個方面：一方面表現(xiàn)為權(quán)利人的不配合。往往權(quán)利人對其擁有的商業(yè)秘密不愿提供作為證據(jù)，更不愿將技術(shù)信息送關(guān)相關(guān)部門進行鑒定，這就造成行為人侵犯商業(yè)秘密證據(jù)上存在問題。 2.對行為人泄露的信息是否屬商業(yè)秘密的鑒定問題。 如果具備鑒定的條件的話，有關(guān)技術(shù)信息應當委托專業(yè)權(quán)威部門進行鑒定。因為在審查行為人泄露的技術(shù)信息是否屬商業(yè)秘密時，往往會涉及很復雜的技術(shù)問題，法官對這類專業(yè)技術(shù)又知之甚少，如何來認定該專業(yè)技術(shù)屬商業(yè)秘密。在這種情況下，專業(yè)權(quán)威的鑒定就顯得尤為重要。因為專業(yè)人員對專業(yè)技術(shù)的國內(nèi)外最新情況比較了解，其通過對資料檢索并進行對比分析后得出的結(jié)論，具有一定的科學性和客觀性。法官是中立裁判者，據(jù)以定案的鑒定結(jié)論必須進行當庭質(zhì)證并聽取雙方意見后，結(jié)合其他證據(jù)進行全面審查判斷后決定是否采信。 關(guān)于損失的計算問題 中國刑法規(guī)定“給商業(yè)秘密的權(quán)利人造成重大損失”才構(gòu)成犯罪，如何認定“重大損失”、什么是“重大損失”便成為區(qū)分罪與非罪的關(guān)鍵。“造成重大損失”是構(gòu)成侵犯商業(yè)秘密罪必備要件。在刑事訴訟中，重大損失一般是指被害人由于犯罪人的犯罪行為而遭受的物質(zhì)損失，就侵犯商業(yè)秘密而言，刑法未對“重大損失”的含義明確界定和說明。在司法實踐中，商業(yè)秘密的“重大損失”的計算大致有以下幾種： 1.以商業(yè)秘密權(quán)利人因侵權(quán)行為遭受的損失作為定罪量刑的依據(jù)。 商業(yè)秘密一旦被泄露，權(quán)利人的損失往往是無法彌補的。在刑事審判中普遍認為這種損失應當指實際損失，而實際損失既包括直接損失和權(quán)利人必然失去的現(xiàn)實利益。而且侵犯商業(yè)秘密給權(quán)利人造成的損失不能僅僅以數(shù)額為標準，應當在重點考慮研制開發(fā)成本、利用周期、成熟程度、市場前景等直接因素的基礎上，綜合考慮各種相關(guān)因素，如競爭優(yōu)勢地位的喪失、商業(yè)信譽的下降等 2.以侵權(quán)人因侵權(quán)行為獲得的利益作為損失。 這種損失的計算以侵權(quán)人未再向他人泄露為前提。對于將商業(yè)秘密出賣給他人的，以其出賣收入加上買受人使用后的獲利額為損失額；使用商業(yè)秘密進行生產(chǎn)經(jīng)營活動的，以其獲得的利潤為損失額。在計算侵權(quán)人所獲得的利潤時，不能簡單地以銷售額為獲利額，也不能以已生產(chǎn)的產(chǎn)品總價款乘以平均利潤率為獲利額。一般情況下，以銷售額乘以平均利潤率為獲利額較為妥當。 3.以不低于商業(yè)秘密使用許可的合理使用費作為損失。 這是一種以正常許可使用的費用推定損失額的計算法，但并不意味著侵權(quán)人就此取得了該商業(yè)秘密的合法使用權(quán)。同時值得一提的是，這也不是簡單地將商業(yè)秘密的自身價值等同于損失。商業(yè)秘密是無形財產(chǎn)，其與有形財產(chǎn)有重大區(qū)別。侵權(quán)人使用商業(yè)秘密的同時，并沒有排斥合法權(quán)利人的使用。況且，大多數(shù)情況下，侵權(quán)人實施盜竊等不法行為取得商業(yè)秘密后，不久就被發(fā)現(xiàn)、制止，給被害人造成的損失遠遠小于商業(yè)秘密自身的價值。

法律分析：侵犯商業(yè)秘密罪立案條件如下：1、給商業(yè)秘密權(quán)利人造成損失數(shù)額在五十萬元以上的；2、因侵犯商業(yè)秘密違法所得數(shù)額在五十萬元以上的；3、致使商業(yè)秘密權(quán)利人破產(chǎn)的；4、其他給商業(yè)秘密權(quán)利人造成重大損失的情形。

法律依據(jù)：《最高人民檢察院公安部關(guān)于公安機關(guān)管轄的刑事案件立案追訴標準的規(guī)定(二)》 第七十三條 侵犯商業(yè)秘密，涉嫌下列情形之一的，應予立案追訴:(一)給商業(yè)秘密權(quán)利人造成損失數(shù)額在五十萬元以上的;(二)因侵犯商業(yè)秘密違法所得數(shù)額在五十萬元以上的;(三)致使商業(yè)秘密權(quán)利人破產(chǎn)的;(四)其他給商業(yè)秘密權(quán)利人造成重大損失的情形。