檢察院認為證據不足的案子的處理方法如下：
1、不符合起訴條件的，檢察院應當作出不起訴的決定。
2、證據不足，不能認定被告人有罪的，法院應當作出證據不足、指控的犯罪不能成立的無罪判決。
證據的種類如下：
1、當事人的陳述；
2、書證；
3、物證；
4、視聽資料；
5、電子數據；
6、證人證言；
7、鑒定意見；
8、勘驗筆錄。
綜上所述，公安機關提請批準逮捕書、人民檢察院起訴書、人民法院判決書，必須忠實于事實真象。故意隱瞞事實真象的，應當追究責任。
《刑事訴訟法》第一百七十五條
人民檢察院審查案件，可以要求公安機關提供法庭審判所必需的證據材料；認為可能存在本法第五十六條規定的以非法方法收集證據情形的，可以要求其對證據收集的合法性作出說明。人民檢察院審查案件，對于需要補充偵查的，可以退回公安機關補充偵查，也可以自行偵查。對于補充偵查的案件，應當在一個月以內補充偵查完畢。補充偵查以二次為限。補充偵查完畢移送人民檢察院后，人民檢察院重新計算審查起訴期限。對于二次補充偵查的案件，人民檢察院仍然認為證據不足，不符合起訴條件的，應當作出不起訴的決定。

【法律分析】：根據我國相關法律規定，對于證據不足的案件，其公安機關是可以以“證據不足”結束偵查終結，并以“證據不足”，無法結案進行結案的。

【法律依據】：《中華人民共和國刑事訴訟法(2018修正)》第九十條

人民檢察院對于公安機關提請批準逮捕的案件進行審查后，應當根據情況分別作出批準逮捕或者不批準逮捕的決定。對于批準逮捕的決定，公安機關應當立即執行，并且將執行情況及時通知人民檢察院。對于不批準逮捕的，人民檢察院應當說明理由，需要補充偵查的，應當同時通知公安機關。

第一百七十五條

人民檢察院審查案件，可以要求公安機關提供法庭審判所必需的證據材料；認為可能存在本法第五十六條規定的以非法方法收集證據情形的，可以要求其對證據收集的合法性作出說明。 人民檢察院審查案件，對于需要補充偵查的，可以退回公安機關補充偵查，也可以自行偵查。 對于補充偵查的案件，應當在一個月以內補充偵查完畢。補充偵查以二次為限。補充偵查完畢移送人民檢察院后，人民檢察院重新計算審查起訴期限。 對于二次補充偵查的案件，人民檢察院仍然認為證據不足，不符合起訴條件的，應當作出不起訴的決定。

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刑事案件證據不足事實不清一般情況下會不予起訴。刑事案件在證據不足的公安機關會予以撤案；如果移交審查起訴后檢察院認為證據不足，并且在補充偵查結束后還是不能滿足定罪證據的要求的，檢察院會作出不起訴的決定；起訴之后，如果存在證據不足的情形，法院會作出無罪判決。
【法律分析】
提起公訴的實體條件包括兩個，一是犯罪嫌疑人的犯罪事實已經查清，證據確實、充分；二是依法應當追究刑事責任。所謂犯罪事實已經查清是指檢察機關對下列事實已經查證屬實，確定犯罪嫌疑人實施的行為是犯罪，而不是合法行為或者一般違法行為的事實；確定被告人應當負刑事責任，而不是不負刑事責任或者可以免除刑事責任的事實，例如犯罪嫌疑人的年齡、精神狀況等；確定犯罪嫌疑人實施的是某一種或某幾種性質的犯罪的事實；確定對犯罪嫌疑人應當或者可以從輕、減輕或者從重處罰的量刑情節的事實。查清上述事實，就符合犯罪嫌疑人的事實已經查清的條件。在當代的社會，刑事類型的案件提起訴訟的時候需要注意一些事項。如果是公訴案件的話，應當是由檢察機關審查起訴的，如果證據不足并且事實不清楚，那么會對此決定不予起訴，也可以退回補充偵查。
【法律依據】
《中華人民共和國刑事訴訟法》
第一百七十一條 人民檢察院審查案件的時候，必須查明：（一）犯罪事實、情節是否清楚，證據是否確實、充分，犯罪性質和罪名的認定是否正確；（二）有無遺漏罪行和其他應當追究刑事責任的人；（三）是否屬于不應追究刑事責任的；（四）有無附帶民事訴訟；（五）偵查活動是否合法。
第一百七十五條 人民檢察院審查案件，可以要求公安機關提供法庭審判所必需的證據材料；認為可能存在本法第五十六條規定的以非法方法收集證據情形的，可以要求其對證據收集的合法性作出說明。人民檢察院審查案件，對于需要補充偵查的，可以退回公安機關補充偵查，也可以自行偵查。對于補充偵查的案件，應當在一個月以內補充偵查完畢。補充偵查以二次為限。補充偵查完畢移送人民檢察院后，人民檢察院重新計算審查起訴期限。對于二次補充偵查的案件，人民檢察院仍然認為證據不足，不符合起訴條件的，應當作出不起訴的決定。