1、含義上的區別

集體企業，是集體所有制企業。指生產資料和產品由社會主義勞動群眾集體占有的企業。

國有企業，是國務院和地方人民政府分別代表國家履行出資人職責的國有獨資企業、國有獨資公司以及國有資本控股企業。

2、分類上的區別

集體企業大體分為兩類，城鎮集體企業，包括區辦、縣辦、街道辦的集體企業，以及勞動者集資合伙辦的集體企業等等；鄉鎮集體企業，包括鄉村企業(過去的社隊企業)和農村合作企業(農民或農戶聯合舉辦的小型企業)。

國有企業分為特殊法人企業、國有獨資公司、國有控股公司、國有參股公司。特殊法人企業由政府全額出資并明確其法人地位，由國家通過專門的法規和政策來規范，不受公司法規范；國有控股公司、國有獨資公司由政府全額出資，受公司法規范；國有參股公司受到公司法規范。

3、性質上的區別

集體企業是獨立自主、自負盈虧的經濟組織，在其經營管理方面應有完全的自主選擇權。集體企業的收入由集體企業自己分配。

國企的性質，就是全民所有制企業的性質。所謂全民所有制企業，實質就是企業生產資料歸全體人民共同所有的企業。而所謂全民所有制企業的性質，就是生產資料歸全體人民共同所有的企業所具有的性質。因而,所謂國企的性質，實質就是生產資料屬于全體人民共同所有的企業所具有的性質。

參考資料來源：百度百科-集體企業

參考資料來源：百度百科-國有企業

法律分析：集體企業既非國有企業也非私營企業，部分勞動群眾集體擁有生產資料的所有權，共同勞動并實行按勞分配的經濟組織。私營企業是指資產歸私人所有、雇工8人以上的營利性經濟組織。混合所有制企業是指資產由不同所有制成分構成的企業。 集體所有制企業。指生產資料和產品由社會主義勞動群眾集體占有的企業。國有企業，是國務院和地方人民政府分別代表國家履行出資人職責的國有獨資企業、國有獨資公司以及國有資本控股企業。以生產資料的勞動群眾集體所有制為基礎的、獨立的商品經濟組織。集體所有制企業包括城鎮和鄉村的勞動群眾集體所有制企業。

法律依據：《中華人民共和國鄉村振興促進法》 第十六條 國家采取措施加強農業科技創新，培育創新主體，構建以企業為主體、產學研協同的創新機制，強化高等學校、科研機構、農業企業創新能力，建立創新平臺，加強新品種、新技術、新裝備、新產品研發，加強農業知識產權保護，推進生物種業、智慧農業、設施農業、農產品加工、綠色農業投入品等領域創新，建設現代農業產業技術體系，推動農業農村創新驅動發展。國家健全農業科研項目評審、人才評價、成果產權保護制度，保障對農業科技基礎性、公益性研究的投入，激發農業科技人員創新積極性。