公訴案件和自訴案件是刑事訴訟中的兩種不同類型的案件。它們最主要的區別在于起訴的主體和案件的范圍不同：公訴案件由國家機關提起訴訟，而自訴案件由被害人或其法定代理人、近親屬提起訴訟。

一、起訴主體的差異

公訴案件由人民檢察院代表國家提起訴訟，體現了國家對犯罪行為的追訴和懲罰；自訴案件則由被害人或其法定代理人、近親屬直接向法院提起訴訟，體現了對被害人權益的保護。

二、案件范圍的差異

公訴案件的范圍較廣，涵蓋絕大多數刑事犯罪；自訴案件的范圍較窄，僅限于法律規定的特定類型的犯罪。

1、公訴案件：一般包括偵查、審查起訴、審判三個階段。偵查機關負責收集證據，查明犯罪事實；人民檢察院審查案件材料，決定是否提起公訴；人民法院負責審判，依法作出判決。

2、自訴案件：被害人直接向法院提起訴訟，法院審查后決定是否立案。立案后，法院會組織開庭審理，并根據案件事實和證據作出判決。

一、舉證責任

1、公訴案件：舉證責任由人民檢察院承擔，即檢察院需要提供充分的證據證明被告人有罪。

2、自訴案件：舉證責任由自訴人承擔，即自訴人需要提供充分的證據證明被告人有罪。

二、調解機制

1、公訴案件：一般不適用調解，但對于一些輕微的刑事案件，檢察院在審查起訴階段可以進行調解。

2、自訴案件：除法律特別規定外，可以進行調解。自訴人可以在宣判前與被告人自行和解或撤回自訴。

《中華人民共和國刑事訴訟法》第一百一十四條：對于自訴案件，被害人有權向人民法院直接起訴。被害人死亡或者喪失行為能力的，被害人的法定代理人、近親屬有權向人民法院起訴。人民法院應當依法受理。

《中華人民共和國刑事訴訟法》第一百六十九條：凡需要提起公訴的案件，一律由人民檢察院審查決定。

《中華人民共和國刑事訴訟法》第二百一十條：自訴案件包括下列案件：（一）告訴才處理的案件；（二）被害人有證據證明的輕微刑事案件；（三）被害人有證據證明對被告人侵犯自己人身、財產權利的行為應當依法追究刑事責任，而公安機關或者人民檢察院不予追究被告人刑事責任的案件。

《中華人民共和國刑事訴訟法》第二百一十一條：人民法院對于自訴案件進行審查后，按照下列情形分別處理：（一）犯罪事實清楚，有足夠證據的案件，應當開庭審判；（二）缺乏罪證的自訴案件，如果自訴人提不出補充證據，應當說服自訴人撤回自訴，或者裁定駁回。自訴人經兩次依法傳喚，無正當理由拒不到庭的，或者未經法庭許可中途退庭的，按撤訴處理。法庭審理過程中，審判人員對證據有疑問，需要調查核實的，適用本法第一百九十六條的規定。

《中華人民共和國刑事訴訟法》第二百一十二條：人民法院對自訴案件，可以進行調解；自訴人在宣告判決前，可以同被告人自行和解或者撤回自訴。本法第二百一十條第三項規定的案件不適用調解。人民法院審理自訴案件的期限，被告人被羈押的，適用本法第二百零八條第一款、第二款的規定；未被羈押的，應當在受理后六個月以內宣判。

《中華人民共和國刑事訴訟法》第五十一條：公訴案件中被告人有罪的舉證責任由人民檢察院承擔，自訴案件中被告人有罪的舉證責任由自訴人承擔。

《中華人民共和國刑事訴訟法》第一百七十六條：人民檢察院認為犯罪嫌疑人的犯罪事實已經查清，證據確實、充分，依法應當追究刑事責任的，應當作出起訴決定，按照審判管轄的規定，向人民法院提起公訴，并將案卷材料、證據移送人民法院。犯罪嫌疑人認罪認罰的，人民檢察院應當就主刑、附加刑、是否適用緩刑等提出量刑建議，并隨案移送認罪認罰具結書等材料。