刑事案件卷宗整理的標準如下：
　　（一）法律文書卷裝訂順序
　　1、卷宗封面
　　2、卷內目錄
　　3、受案登記表
　　4、110接警記錄、行政機關移送函等其他首次接報案證明材料
　　5、受案回執
　　6、立案決定書
　　7、不予立案通知書、不予立案復議申請書、復核申請書、復議決定書
　　8、說明不立案理由通知書（檢察院）、不立案理由說明書
　　9、通知立案書（增加）
　　10、指定管轄決定書
　　11、移送案件通知書
　　12、拘傳證
　　13、拘留證、拘留通知書
　　14、延長拘留期限通知書
　　15、提請批準逮捕書、批準或不批準逮捕決定書、要求復議意見書、檢察機關的復議決定書、提請復核意見書、檢察機關的復核決定書
　　16、逮捕證、逮捕通知書
　　17、提請批準延長偵查羈押期限意見書、批準延長偵查羈押期限決定書、延長偵查羈押期限通知書
　　18、計算/重新計算偵查羈押期限通知書
　　19、變更逮捕措施通知書
　　20、不需要繼續羈押檢察建議書、不予釋放/變更強制措施通知書
　　21、釋放通知書
　　22、釋放證明書
　　23、入所健康檢查表（證明偵查行為合法的證據材料單獨立卷的，入所健康檢查表歸入該卷。）
　　24、取保候審決定書、執行通知書、被取保候審人義務告知書、取保候審保證書（保證人身份資料）、收取保證金通知書、保存證件清單、退還保證金決定書、通知書、沒收保證金決定書（沒收保證金復議、復核、維持、撤銷變更文書材料）、通知書、對保證人罰款決定書（復議、復核、維持、撤銷變更文書材料）、通知書、責令具結悔過決定書、解除取保候審決定書、通知書
　　25、監視居住決定書、執行通知書、指定居所監視居住通知書、解除監視居住決定書、通知書
　　26、通輯令
　　27、特殊身份犯罪嫌疑人（人大代表、政協委員、外國人）采取強制措施的請示、批復、通報材料
　　28、提供法律援助通知書
　　29、律師執業證書、律師事務所證明和委托書或者法律援助公函（復印材料）
　　30、會見犯罪嫌疑人申請表、準予會見犯罪嫌疑人決定書、通知書、不準予會見犯罪嫌疑人決定書
　　31、變更強制措施申請、不予釋放/變更強制措施通知書
　　32、告知書（犯罪嫌疑人被采取、變更、解除強制措施，延長偵查羈押期限、移送起訴等案件有關情況向辯護律師告知）
　　33、辯護律師意見
　　34、回避申請書、回避/駁回申請回避決定書、回避申請復議書、復議決定書
　　35、撤銷案件決定書、死亡通知書、告知書
　　36、終止偵查決定書、告知書
　　37、起訴意見書、要求復議意見書、檢察機關的復議決定書、提請復核意見書、檢察機關的復核決定書
　　38、沒收違法所得意見書、違法所得清單
　　39、強制醫療意見書
　　40、被害人提起附帶民事訴訟材料或因國家財產、集體財產遭受損失需要由檢察機關提起附帶民事訴訟的有關材料
　　41、卷宗封底
　　（二）證據材料卷裝訂順序
　　1、卷宗封面
　　2、卷內目錄
　　3、犯罪嫌疑人照片、身份證明
　　4、提訊提解證
　　5、訊問筆錄、傳喚證、傳訊證、未成年人法定代理人到場通知書、犯罪嫌疑人親筆供詞、犯罪嫌疑人訴訟權利義務告知書、接受證據清單、接受證據照片、鑒定意見通知書（訊問筆錄按采集的時間順序排列，采取傳訊、傳喚措施通知犯罪嫌疑人到案接受訊問的，傳喚證、傳訊證應與當次訊問筆錄一同列入卷宗，排在當次訊問筆錄之前）
　　6、被害人陳述材料、報案材料、詢問通知書、未成年人法定代理人到場通知書、被害人訴訟權利義務告知書、接受證據清單、接受證據照片（詢問筆錄按采集的時間順序排列，詢問通知書排放順序同傳喚證）
　　7、證人證言、詢問通知書、未成年人法定代理人到場通知書、接受證據清單、接受證據照片（詢問筆錄按采集的時間順序排列，詢問通知書排放順序同傳喚證）
　　8、現場勘驗筆錄、扣押決定書（扣押財物、文件價值較高或者可能嚴重影響正常生產經營的，應當經縣級以上公安機關負責人批準，制作扣押決定書）、扣押清單、現場勘查圖、現場照片
　　9、解剖尸體通知書、死因鑒定意見、尸檢工作記錄、尸體照片、傷情鑒定意見、鑒定意見通知書（需要告知鑒定意見的，應當將鑒定意見通知書放在相應的鑒定意見文書之后）
　　10、調取證據通知書、調取證據清單、調取證據或照片
　　11、搜查證、搜查筆錄、扣押決定書（扣押財物、文件價值較高或者可能嚴重影響正常生產經營的，應當經縣級以上公安機關負責人批準，制作扣押決定書）、扣押證據清單、登記保存清單、扣押證據或照片、登記保存證據照片
　　12、扣押決定書、扣押筆錄、扣押清單（登記保存清單）、扣押證據或照片
　　13查封決定書、查封筆錄、查封清單、查封證據照片
　　14、協助查封/解除查封通知書、查封/解除查封清單、查封/解除查封證據照片
　　15、協助查詢財產通知書（回執）、財產登記材料、記錄
　　16、協助凍結/解除凍結財產通知書、告知書（告知相關人員有權申請出售）
　　17、扣押/解除扣押郵件電報通知書
　　18、偵查實驗筆錄、辨認筆錄
　　19、檢查筆錄、復驗復查筆錄
　　20、鑒定聘請書、鑒定意見
　　21、發還清單、隨案移送清單、銷毀清單
　　22、犯罪嫌疑人前科、立功等與量刑有關的其他證據材料
　　23、其他說明性證明材料（抓獲經過、民警執行職務時目擊的犯罪情況）
　　24、卷宗封底
　　（三）補充偵查卷裝訂順序
　　1、卷宗封面
　　2、卷內目錄
　　3、換押證
　　4、退回補充偵查決定書、補充偵查報告書
　　5、補充偵查階段強制措施文書
　　6、偵查措施文書及證據材料、照片（排放順序按照證據材料卷執行）
　　7、卷宗封底
　　補充偵查卷也可以按照檢察機關補充偵查提綱所列事項逐一對應補充材料的順序進行排列。補查提綱所列事項較多，可以先分類合并，再將補查材料對應排列。
　　（四）秘密類證據材料卷裝訂順序
　　1、卷宗封面
　　2、卷內目錄
　　3、采取技術偵查措施決定書
　　4、執行技術偵查措施通知書
　　5、延長技術偵查措施期限決定書
　　6、解除技術偵查措施決定書
　　7、技術偵查、隱匿身份偵查、控制下交付獲取的證據材料
　　8、采取保護措施的證人、鑒定人、被害人作證材料
　　9、卷宗封底
　　（五）偵查工作卷裝訂順序
　　1、卷宗封面
　　2、卷內目錄
　　3、偵查終結報告
　　4、呈請報告書及法律審核手續（按時間順序排列）
　　5、偵查工作方案及呈請領導批示
　　6、訊問計劃、研究討論案件記錄等
　　7、辦案協作函
　　8、調查計劃
　　9、提請批準逮捕書、起訴意見書、復議、復核意見書底稿及有關領導批示的修改稿
　　10、其他有保存價值、反映偵查活動情況的材料，包括除訴訟使用外的偵查詢問材料；來往公函、信件；有關案件線索轉交通知單、移送清單；先期采取行政措施的有關文書、材料；案件審核、研究的其他材料等。