1.在遭受他人惡意指控涉嫌實施強奸行為時，相關人士有權選擇向公安機關進行舉報，以對誹謗者依法采取相應的懲罰措施。
2.如果惡意指控并未達到構成犯罪的嚴重程度，公安機關會依據相關規定給予誹謗者相應的治安管理處罰，例如處以行政拘留以及罰款等處罰方式。
3.若惡意指控已經涉及到觸犯刑法之事，那么應當根據誣告陷害罪相關的法律法規來對此類行為進行嚴肅處理，追究其刑事責任。

被人誣告強奸罪的反駁方式：可提出能證明自己未實施強奸罪的證據來進行反駁，例如書證、犯罪嫌疑人、被告人供述和辯解等證據。公安機關也會依法收集相關證據，如果查明被誣告人無犯罪事實的，不會處罰或判刑。
【法律依據】
《中華人民共和國刑事訴訟法》第五十條可以用于證明案件事實的材料，都是證據。證據包括：（一）物證；（二）書證；（三）證人證言；（四）被害人陳述；（五）犯罪嫌疑人、被告人供述和辯解；（六）鑒定意見；（七）勘驗、檢查、辨認、偵查實驗等筆錄；（八）視聽資料、電子數據。證據必須經過查證屬實，才能作為定案的根據?！吨腥A人民共和國刑事訴訟法》第五十二條審判人員、檢察人員、偵查人員必須依照法定程序，收集能夠證實犯罪嫌疑人、被告人有罪或者無罪、犯罪情節輕重的各種證據。嚴禁刑訊逼供和以威脅、引誘、欺騙以及其他非法方法收集證據，不得強迫任何人證實自己有罪。《中華人民共和國刑事訴訟法》第五十四條人民法院、人民檢察院和公安機關有權向有關單位和個人收集、調取證據。

1.被人誣告強奸犯罪，可以向公安機關提出要求受害者做陰道損傷鑒定及陰道分泌物（DNA）提取鑒定。強奸犯罪缺乏這種鑒定，是有可能罪名指控不成立。