醫療事故鑒定部門是由設區的市級地方醫學會和省、自治區、直轄市直接管轄的縣地方醫學會負責組織首次醫療事故技術鑒定工作。省、自治區、直轄市地方醫學會負責組織再次鑒定工作。
【法律依據】
《醫療事故處理條例》第二十條：衛生行政部門接到醫療機構關于重大醫療過失行為的報告或者醫療事故爭議當事人要求處理醫療事故爭議的申請后，對需要進行醫療事故技術鑒定的，應當交由負責醫療事故技術鑒定工作的醫學會組織鑒定；醫患雙方協商解決醫療事故爭議，需要進行醫療事故技術鑒定的，由雙方當事人共同委托負責醫療事故技術鑒定工作的醫學會組織鑒定。
醫療事故鑒定申請的流程如下：
步驟一：當事人申請衛生行政部門處理的，應當提出書面申請；
步驟二：當事人自知道或應當知道其身體健康受到損害之日起一年內，可以向衛生行政部門提出醫療事故爭議處理申請；
步驟三：發生醫療事故爭議，當事人申請衛生行政部門處理的，由醫療機構所在縣級人民政府衛生行政部門受理；
步驟四：衛生行政部門應當自收到醫療事故爭議處理之日起10天內進行審查，作出是否受理的決定。
對符合有關條例的，予以受理，需要進行醫療事故技術鑒定的，應當自作出受理決定之日起5日內將有關材料交由負責醫療事故技術鑒定工作的醫學會組織鑒定并書面通知申請人；對不符合有關條例規定，不予受理的，應當書面通知申請人并說明理由。
【法律依據】
《醫療事故處理條例》第二十條規定，衛生行政部門接到醫療機構關于重大醫療過失行為的報告或者醫療事故爭議當事人要求處理醫療事故爭議的申請后，對需要進行醫療事故技術鑒定的，應當交由負責醫療事故技術鑒定工作的醫學會組織鑒定；醫患雙方協商解決醫療事故爭議，需要進行醫療事故技術鑒定的，由雙方當事人共同委托負責醫療事故技術鑒定工作的醫學會組織鑒定。
醫療事故鑒定的鑒定部門是醫學會。具體是：設區的市級地方醫學會和省、自治區、直轄市直接管轄的縣(市)地方醫學會負責組織首次醫療事故技術鑒定工作。省、自治區、直轄市地方醫學會負責組織再次鑒定工作。
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