醫療事故鑒定與醫療過錯司法鑒定的區別有如下幾點：
（1）、鑒定的機構不同。事故鑒定是各地醫學會承擔，醫療過錯司法鑒定由有資格的司法鑒定機構承擔，上海就有一家比較權威的機構。
（2）、醫療事故鑒定有兩級，地級市醫學會鑒定后，如果當事人不服的，可以向省級醫學會申請第二次鑒定，但司法鑒定則無這樣的層級區別。如當事人不服，則可以另行委托其他有資質的機構重新鑒定。
（3）、公信力有差異：醫學會由于是在掛靠在當地衛生局的學術組織，可以說是衛生局的婢女，自然要偏向其屬下的醫院。公信力當然要差一些。司法鑒定的機構則和醫院沒有那么的瓜葛，偏心的情況可能會少一些。
（4）、性質上不同。醫療事故鑒定基本上是技術鑒定。司法鑒定則是獨立的專業機構所做鑒定，如果其鑒定行為違法并造成當事人損失的，依法要承擔賠償責任。但醫學會基本上沒有能力承擔賠償責任。
至于其利弊，如果患者是死亡或傷殘的損害結果，醫療事故按照原《醫療事故處理條例》來確定賠償標準的話，受害人所得的賠償大大少于醫療過錯損害賠償，差別太大了。

1、醫療事故鑒定是指國務院和有關醫療機關為了科學劃分醫療事故等級，正確處理醫療事故爭議，保護患者和醫療機構及其醫務人員的合法權益，所進行的有關醫療方面的鑒定。
2、司法鑒定指在訴訟活動中鑒定人運用科學技術或者專門知識對訴訟涉及的專門性問題進行鑒別和判斷并提供鑒定意見的活動。
司法鑒定一般包括：法醫類鑒定；物證類鑒定；聲像資料鑒定等。
法醫類鑒定，包括法醫病理鑒定、法醫臨床鑒定、法醫精神病鑒定、法醫物證鑒定和法醫毒物鑒定。
物證類鑒定，包括文書鑒定、痕跡鑒定和微量鑒定。
聲像資料鑒定，包括對錄音帶、錄像帶、磁盤、光盤、圖片等載體上記錄的聲音、圖像信息的真實性、完整性及其所反映的情況過程進行的鑒定和對記錄的聲音、圖像中的語言、人體、物體作出種類或者同一認定。

醫療糾紛案件，關鍵在于醫療鑒定，鑒定結論決定著醫院是否能夠賠償。根據我國現行法律規定和司法實踐，醫療鑒定包括醫療事故技術鑒定和醫療損害司法鑒定。二者在鑒定程序上和實體審查方面都存在明顯區別，現主要介紹如下：
一、鑒定的法律依據不同
醫療損害司法鑒定的主要法律依據是：《民事訴訟法》、《關于司法鑒定管理問題的決定》、《司法鑒定程序通則（試行）》、《司法鑒定機構登記管理辦法》、《司法鑒定人管理辦法》、《司法鑒定執業分類規定》等。現行有效的醫療衛生管理法律、行政法規、部門規章和診療護理規范、常規、醫學文獻也是鑒定的依據。
醫療事故鑒定的法律依據是《醫療事故處理條例》、《醫療事故技術鑒定暫行辦法》、《醫療事故分級標準（試行）》、《醫療事故技術鑒定專家庫學科專業組名錄》、《醫療事故爭議中尸檢機構及專業技術人員資格認定辦法》、《醫療機構病歷管理規定》、《病歷書寫基本規范(試行)》和《中醫、中西醫結合病歷書寫基本規范（試行）》，同時參照現行有效的醫療衛生管理法律、行政法規、部門規章和診療護理規范、常規醫學文獻等。
二、鑒定程序不同
醫療損害司法鑒定由人民法院委托有資質的司法鑒定機構完成。醫療司法鑒定分為初次鑒定、補充鑒定、重新鑒定、復核鑒定。任何一方當事人對初次鑒定結論不服的，可以申請補充鑒定、重新鑒定或復核鑒定。
醫療事故鑒定由人民法院、衛生行政部門委托當地醫學會完成。醫學會分為設區的市級和省級醫學會。初次鑒定由設區的市級醫學會進行，對初次鑒定不服的，由省級醫學會再次鑒定。
司法鑒定提交的材料主要是病歷資料，包括住院病歷、門診病歷、用藥明細、診斷證明、掛號單、收費憑證，以及醫生出具的和醫療行為有關的書面材料等。和醫療行為環境、人員資格有關的，還要提供相關證據材料。其中關鍵是患者認為醫院存在過錯的陳述意見和理由。司法鑒定有的有聽證程序，有的沒有。不管有沒有聽證程序，患者的陳述意見和理由，是確認醫院過錯的重中之重。鑒定機構結合陳述意見和理由，了解鑒定的目的，是司法鑒定的關鍵。
醫療事故鑒定有聽證程序，就像法院開庭一樣，雙方當事人分別陳述意見和理由。陳述順序先患方，后醫療機構。專家鑒定組成員根據需要可以提問，當事人應當如實回答。必要時，可以對患者進行現場醫學檢查。在陳述中，要掌握重點突出，觀點鮮明，不僅要說明醫療行為損害事實，也要有醫療過錯的法律法規文獻依據，讓人感覺有理有據。聽證程序也是鑒定的關鍵。
三、鑒定結論不同
醫療事故技術鑒定結論主要內容是醫療行為是否違反醫療衛生管理法律、行政法規、部門規章和診療護理規范、常規，醫療過失行為與人身損害后果之間是否存在因果關系，醫療過失行為在醫療事故損害后果中的責任程度和醫療事故等級，需要護理的，還有對醫療事故患者的醫療護理醫學建議。醫療事故責任程度分成四個級別：完全責任、主要責任、次要責任和輕微責任。醫療事故等級主要有一直四級，每一個級別又有詳細劃分。
司法鑒定結論內容重點是對醫療過錯與損害結果之間的因果關系、責任比例或損失參與度。事故等級需要單獨鑒定。
四、社會評價不同
醫療事故鑒定都在事故所在地設區的市醫學會完成，鑒定專家都是所在市的醫療行業的專業醫生，難免和患者就診醫院屬于同一個醫院。同一個醫院的醫生為本醫院醫療行為進行鑒定，難免有失公正。因此鑒定結論多傾向于醫療機構。另外，醫學會隸屬于衛生行政部門，醫療機構也隸屬于衛生行政部門，同出一門，仍然沒有擺脫以前父親給兒子鑒定的局面，社會認可度不高。
司法鑒定機構隸屬于司法行政部門，從隸屬關系上與醫療機構沒有任何關系。有的司法鑒定在患者就醫的醫療機構之外的鑒定機構進行，大大減少了人為因素的干擾，更具有科學性。因此司法鑒定是很大患者的共同選擇。
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