仲裁條款無效的情形有：
1、約定的仲裁事項超出法律規定的仲裁范圍的；
2、無民事行為能力人或者限制民事行為能力人訂立的仲裁協議；
3、一方采取脅迫手段，迫使對方訂立仲裁協議的。
仲裁流程如下：
1、申請和受理：當事人根據合同仲裁條款或事后達成的仲裁協議，將發生的爭議依法請求仲裁委員會進行仲裁。提起仲裁申請是當事人為獲得仲裁、解決糾紛的一種請求，是保護自身合法權益的一種手段，也是仲裁機構行使仲裁權的前提。只有當事人提起仲裁申請，仲裁委員會才能受理案件；
2、仲裁庭的組成：仲裁機構仲裁案件，不是仲裁委員會直接仲裁，而是通過一定的組織實現的，這個組織稱為仲裁庭。根據仲裁法的規定，仲裁庭組成有兩種組織形式：獨任仲裁庭，即由一名仲裁員組成的仲裁庭；合議仲裁庭，即由三名仲裁員組成的仲裁庭。仲裁庭的組織形式由當事人約定，仲裁員由當事人選定或委托仲裁委員會主任指定；
3、開庭和裁決：開庭是仲裁庭在雙方當事人和其他仲裁參與人參加下，對仲裁請求進行實體審理和裁決的活動。開庭是仲裁活動的實質階段。其目的是查明事實、分清是非、正確適用法律、確認當事人之間的權利義務關系。裁決是指仲裁庭在實體上對當事人權利義務作出裁斷。裁決是仲裁審理的最終程序，一經作出即發生法律效力。
綜上所述，仲裁協議對仲裁事項或者仲裁委員會沒有約定或者約定不明確的，當事人可以補充協議，達不成補充協議的，仲裁協議無效。
【法律依據】：
《中華人民共和國仲裁法》第十七條
有下列情形之一的，仲裁協議無效：
（一）約定的仲裁事項超出法律規定的仲裁范圍的；
（二）無民事行為能力人或者限制民事行為能力人訂立的仲裁協議；
（三）一方采取脅迫手段，迫使對方訂立仲裁協議的。

【答案】：A,B
【考點】仲裁協議無效的情形
【詳解】根據《仲裁法》第16條、第17條、第18條和第19條規定，A項中甲乙公司實際上通過后來的補充協議否定了原來的仲裁條款，原條款失效。這屬于雙方合意廢除仲裁條款的情形。8項中同時約定了兩種方式，屬于約定不明確，而且又沒有達成補充協議，因此是無效的。C項中甲公司申請撤訴并被法院允許，效果上相當于沒有起訴，因此簽訂仲裁條款是合法的，屬于有效條款。D項合同內容有瑕疵，根據仲裁協議的獨立性原則，合同因違犯法律禁止性規定而無效不影響仲裁條款的效力，因此該仲裁協議是有效的。綜上本題選A、B。