主要區(qū)別有：

1.自然人股東為—個(gè)具體的人，個(gè)人享有并直接行使股東權(quán)利并承擔(dān)義務(wù)，如參加股東會(huì)，查閱財(cái)務(wù)會(huì)計(jì)資料、領(lǐng)取股紅等。

2.法人股東是一個(gè)組織，作為抽象的依法擬制的實(shí)體，其權(quán)利義務(wù)的行使承擔(dān)，需通過具體人的行為來完成，方式為派出股東代表，憑授權(quán)委托手續(xù)代表其完成，后果由組織承擔(dān)。

實(shí)質(zhì)區(qū)別在于權(quán)利義務(wù)行使承擔(dān)方式不同。

自然人股東是相對(duì)法人股東而言的，是具有公民身份的個(gè)人投資者，在他進(jìn)行公司的投資以后通過公司所在地的工商局注冊(cè)，進(jìn)行公司股權(quán)登記，就成為自然人股東。自然人是基于自然出生而依法在民事上享有權(quán)利和承擔(dān)義務(wù)的個(gè)人。股東是股份制企業(yè)的出資人或叫投資人。

拓展資料：

法人是相對(duì)自然人而言的，是指擁有獨(dú)立支配的財(cái)產(chǎn)，能夠以自己和名義獨(dú)立地參加民事活動(dòng)．為自己取得民事權(quán)利和承擔(dān)義務(wù)的社會(huì)組織。

法人成立應(yīng)發(fā)具備的條件，根據(jù)民法通則第37條之規(guī)定，主要有以下四個(gè)方面：

1．法人必須依法成立．即必須符合法律規(guī)定，為法律所允許，經(jīng)國這認(rèn)可也允許成立．它包括兩方面的含義：第一，法人除依照民法成立外，還要依照規(guī)定的法律程序成立。

2．法人必須有自主經(jīng)營的財(cái)產(chǎn)．法人要進(jìn)行各種經(jīng)濟(jì)活動(dòng)和社會(huì)交往，必須有一定的物質(zhì)基礎(chǔ)作保障，這就是由法人自主支配的財(cái)產(chǎn)。

3．法人必須有明確的組織機(jī)構(gòu)．名稱和場所．法人是一嚴(yán)格的組織體，不是一個(gè)松散的聯(lián)合或聯(lián)盟，因此必須有一個(gè)明確有組織機(jī)構(gòu)，不是一個(gè)松散的聯(lián)合工聯(lián)盟，因此必須有一個(gè)明確有組織機(jī)構(gòu)，行使法人的職權(quán)和從事日常工作。

4．法人必須能夠獨(dú)立地承擔(dān)民事責(zé)任，法人在經(jīng)濟(jì)活動(dòng)和社會(huì)活動(dòng)中，由于違反合同．不履行債務(wù)，或者侵害了社會(huì)或其他人的財(cái)產(chǎn)及利益，就應(yīng)當(dāng)獨(dú)立地承擔(dān)民事責(zé)任。

上述四個(gè)條件中，法人必須具有必要的產(chǎn)或經(jīng)費(fèi)和能夠獨(dú)立地承擔(dān)民事責(zé)任這兩項(xiàng)，不法人最明顯，最突出的特征．并且，上述四個(gè)條件缺一不可，只有同時(shí)具備，才能成為法人。

法人股東，只是他除了是股東外，還被聘為法人代表。
做為法人代表，他代表公司對(duì)外從事業(yè)務(wù)，承擔(dān)法律責(zé)任。
一般股東只承擔(dān)資金責(zé)任。(可以是一個(gè)組織)
自然人股東為—個(gè)具體的人，個(gè)人享有并直接行使股東權(quán)利并承擔(dān)義務(wù)，如參加股東會(huì)，查閱財(cái)務(wù)會(huì)計(jì)資料、領(lǐng)取股紅等。

法人是想對(duì)企業(yè)來說的，自然人就是普通的投資者，個(gè)人投資者或者叫散戶投資者。還有一種是以機(jī)構(gòu)的名義持有的。比如：XXX證券投資公司持有A公司100萬流通股。
法人股東，只是他除了是股東外，還被聘為法人代表。
做為法人代表，他代表公司對(duì)外從事業(yè)務(wù)，承擔(dān)法律責(zé)任。
一般股東只承擔(dān)資金責(zé)任。

在公司制組織中區(qū)別如下：

自然人股東為—個(gè)具體的人，個(gè)人享有并直接行使股東權(quán)利并承擔(dān)義務(wù)，如參加股東會(huì)，查閱財(cái)務(wù)會(huì)計(jì)資料、領(lǐng)取股紅等。

法人股東是一個(gè)組織，作為抽象的依法擬制的實(shí)體，其權(quán)利義務(wù)的行使承擔(dān)，需通過具體人的行為來完成，方式為派出股東代表，憑授權(quán)委托手續(xù)代表其完成，后果由組織承擔(dān)。

由此：主要區(qū)別僅在于權(quán)利義務(wù)行使承擔(dān)方式上有別。權(quán)利義務(wù)的實(shí)質(zhì)內(nèi)容無區(qū)別。

法人的本意是指一個(gè)具有民事權(quán)利能力和民事行為能力,依法獨(dú)立享有民事權(quán)利和承擔(dān)民事義務(wù)的組織，比如某個(gè)基金、銀行、公司、某個(gè)工廠、礦，只要合法注冊(cè)了，就是法律意義上的法人。所以，法人股東指的就是一個(gè)組織參與了股份，成為法人股東。自然人指的是人，可以是你，也可以是我，參與了股份，就是自然人股東了。區(qū)別就在這里。

1.含義上的區(qū)別
法人股東亦稱單位股東，是指以公司或集團(tuán)(機(jī)構(gòu))名義占有其他企業(yè)股份的股東。
自然人股東是具有公民身份的個(gè)人投資者，在他進(jìn)行公司的投資以后通過公司所在地的工商局注冊(cè)，進(jìn)行公司股權(quán)登記，就成為自然人股東。自然人是基于自然出生而依法在民事上享有權(quán)利和承擔(dān)義務(wù)的個(gè)人。股東是股份制企業(yè)的出資人或叫投資人。
2.性質(zhì)上的區(qū)別
法人股東的性質(zhì)是一個(gè)組織，是作為抽象的依法擬制的實(shí)體。其權(quán)利義務(wù)的行使承擔(dān)，需通過具體人的行為來完成，方式為派出股東代表，憑授權(quán)委托手續(xù)代表其完成，后果由組織承擔(dān)。
自然人股東的性質(zhì)為—個(gè)具體的人。個(gè)人享有并直接行使股東權(quán)利并承擔(dān)義務(wù)，如參加股東會(huì)、查閱財(cái)務(wù)會(huì)計(jì)資料、領(lǐng)取股紅等。
3.主體資格上的區(qū)別
法人股東的主體資格是一般依法設(shè)立的各類企業(yè)法人，均有權(quán)對(duì)公司投資，成為公司的股東，而沒有專門的限制。企業(yè)法人對(duì)公司出資成為公司股東的前提是具有民事權(quán)利能力。該企業(yè)法人必須依法存續(xù)。
自然人股東的主體資格是在自然人進(jìn)行公司的投資以后，通過公司所在地的工商局注冊(cè)，進(jìn)行公司股權(quán)登記，就能成為公司的自然人股東。
由此：主要區(qū)別僅在于權(quán)利義務(wù)行使承擔(dān)方式上有別。權(quán)利義務(wù)的實(shí)質(zhì)內(nèi)容無區(qū)別，都享有知情權(quán)、收益權(quán)、優(yōu)先受讓和認(rèn)購新股權(quán)、選擇、監(jiān)督管理者權(quán)。

稅務(wù)上的比較
（1）從被投資企業(yè)分紅時(shí)
◆ 個(gè)人作為股東從被投資企業(yè)分紅時(shí)，根據(jù)《個(gè)人所得稅法》第2條、第3條的規(guī)定，應(yīng)按“利息、股息、紅利所得”的稅目，20%的稅率，計(jì)算繳納個(gè)人所得稅。
注：若是外籍個(gè)人從外商投資企業(yè)取得的股息、分紅，根據(jù)《財(cái)政部、國家稅務(wù)總局關(guān)于個(gè)人所得稅若干政策問題的通知》財(cái)稅字〔1994〕20號(hào)第2條的規(guī)定，免征個(gè)人所得稅 。
◆ 公司作為股東從被投資企業(yè)分紅時(shí)，根據(jù)《企業(yè)所得稅法》第26條第2項(xiàng)以及《企業(yè)所得稅法實(shí)施條例》第83條的規(guī)定，居民企業(yè)直接投資于其他居民企業(yè)取得的投資收益為免稅收入。因此，公司取得分紅時(shí)，免征企業(yè)所得稅。
（2）轉(zhuǎn)讓被投資企業(yè)的股權(quán)時(shí)
◆ 個(gè)人作為股東轉(zhuǎn)讓被投資企業(yè)的股權(quán)時(shí)，根據(jù)《個(gè)人所得稅法》第2條、第3條的規(guī)定，應(yīng)按“財(cái)產(chǎn)轉(zhuǎn)讓所得”的稅目，20%的稅率，計(jì)算繳納個(gè)人所得稅
◆ 公司作為股東轉(zhuǎn)讓被投資企業(yè)的股權(quán)時(shí)，根據(jù)《企業(yè)所得稅法實(shí)施條例》第16條以及《企業(yè)所得稅法》第5條的規(guī)定，轉(zhuǎn)讓企業(yè)股權(quán)時(shí)，需按25%的稅率，以賣出價(jià)減去買入價(jià)的差額，計(jì)算并繳納企業(yè)所得稅。
(注：若以公司的身份將取得的稅后分紅再向投資者個(gè)人進(jìn)行分配時(shí)，則投資者個(gè)人還需要繳納20%的個(gè)人所得稅。)
綜上，從稅務(wù)上來看，如下表所示，以公司的名義進(jìn)行投資，稅負(fù)比較輕。
法律上的比較
就法律上的比較而言，根據(jù)《公司法》第20條第3款“公司股東濫用公司法人獨(dú)立地位和股東有限責(zé)任，逃避債務(wù)，嚴(yán)重?fù)p害公司債權(quán)人利益的，應(yīng)當(dāng)對(duì)公司債務(wù)承擔(dān)連帶責(zé)任”的規(guī)定，在滿足下列條件時(shí)，公司債權(quán)人有權(quán)要求股東對(duì)公司債務(wù)承擔(dān)連帶責(zé)任。
（1）股東實(shí)施了濫用公司人格的行為，如人格混同、財(cái)產(chǎn)混同、虛假股東、不正當(dāng)控制等；
（2）上述行為造成了債權(quán)人利益的損害；
（3）公司沒有清償能力。
因此，在被投資企業(yè)的法人人格被否認(rèn)的情況下，即不再承認(rèn)股東的有限責(zé)任，個(gè)人身份的股東存在著承擔(dān)連帶責(zé)任從而導(dǎo)致財(cái)產(chǎn)“破產(chǎn)”的可能，而公司身份的股東即使承擔(dān)連帶責(zé)任導(dǎo)致破產(chǎn)通常也不會(huì)累及投資者個(gè)人。
綜上，使用公司的身份作為股東進(jìn)行投資，在法律上的風(fēng)險(xiǎn)要小于以個(gè)人的身份作為股東進(jìn)行投資。

自然人股東的優(yōu)勢(shì)：
1、公司操作靈活，不需要法人公司蓋章；
2、帳務(wù)比較單一，不需要法人公司進(jìn)行合并報(bào)表；
3、從表面上減少了與法人公司單的關(guān)聯(lián)性交易判斷。
自然人股東劣勢(shì)：
1、由于沒有法人公司作后盾，對(duì)外的實(shí)力不夠強(qiáng)；
2、分配股利時(shí)需要計(jì)算個(gè)人所得稅。

法人股東的劣勢(shì)：
1. 法人股東可能被監(jiān)管的力度更大，自然人股東被監(jiān)管的力度相對(duì)小
2. 年審稅審，有的地方法人股東必須要出報(bào)告。

1、含義上的區(qū)別
法人股東亦稱單位股東，是指以公司或集團(tuán)(機(jī)構(gòu))名義占有其他企業(yè)股份的股東。
自然人股東是具有公民身份的個(gè)人投資者，在他進(jìn)行公司的投資以后通過公司所在地的工商局注冊(cè)，進(jìn)行公司股權(quán)登記，就成為自然人股東。自然人是基于自然出生而依法在民事上享有權(quán)利和承擔(dān)義務(wù)的個(gè)人。股東是股份制企業(yè)的出資人或叫投資人。
2、性質(zhì)上的區(qū)別
法人股東的性質(zhì)是一個(gè)組織，是作為抽象的依法擬制的實(shí)體。其權(quán)利義務(wù)的行使承擔(dān)，需通過具體人的行為來完成，方式為派出股東代表，憑授權(quán)委托手續(xù)代表其完成，后果由組織承擔(dān)。
自然人股東的性質(zhì)為—個(gè)具體的人。個(gè)人享有并直接行使股東權(quán)利并承擔(dān)義務(wù)，如參加股東會(huì)、查閱財(cái)務(wù)會(huì)計(jì)資料、領(lǐng)取股紅等。

3、主體資格上的區(qū)別
法人股東的主體資格是一般依法設(shè)立的各類企業(yè)法人，均有權(quán)對(duì)公司投資，成為公司的股東，而沒有專門的限制。企業(yè)法人對(duì)公司出資成為公司股東的前提是具有民事權(quán)利能力。該企業(yè)法人必須依法存續(xù)。
自然人股東的主體資格是在自然人進(jìn)行公司的投資以后，通過公司所在地的工商局注冊(cè)，進(jìn)行公司股權(quán)登記，就能成為公司的自然人股東。
參考資料來源：搜狗百科-自然人股東
參考資料來源：搜狗百科-法人股東

法人的本意是指一個(gè)具有民事權(quán)利能力和民事行為能力,依法獨(dú)立享有民事權(quán)利和承擔(dān)民事義務(wù)的組織，比如某個(gè)基金、銀行、公司、某個(gè)工廠、礦，只要合法注冊(cè)了，就是法律意義上的法人。所以，法人股東指的就是一個(gè)組織參與了股份，成為法人股東。自然人指的是人，可以是你，也可以是我，參與了股份，就是自然人股東了。區(qū)別就在這里。