區別：辦理城市不一樣，并且簽證類別不一樣，一個是G，另外是L，具體如下：
國內開放到香港、或澳門個人游的城市，能申請“G”港澳通行證，就是申請下來的往來港澳簽證貼紙的第一行“往來港澳簽證”最后面應有字母“G”，這屬于個人旅游簽注簽證。
國內不是開放到香港、或澳門個人游的城市，只能申請“L”港澳通行證，就是申請下來的往來港澳簽證貼紙的第一行“往來港澳簽證”最后面應有字母“L”，這屬于團體旅游簽證。
入境都是一樣的，沒有什么麻煩的。
證件簡介
內地居民因私往來香港或澳門特別行政區旅游、探親、從事商務、培訓、就業等非公務活動，向戶口所在地的市、縣公安出入境管理部門提出申請。憑公安出入境管理部門簽發的往來港澳通行證及有效簽注前往。
內地居民前往香港或澳門特別行政區定居，向戶口所在地的市、縣公安出入境管理部門提出申請。憑公安出入境管理部門簽發的前往港澳通行證前往。
前往香港特別行政區定居的，持證人須于羅湖口岸、深圳灣口岸、蛇口碼頭口岸（乘船）、福田口岸出境；前往澳門特別行政區定居的，持證人須于珠海拱北口岸出境。
大陸居民前往臺灣地區定居、探親或應邀參加經濟、科技、文化、教育、學術等活動，向戶口所在地的市、縣公安機關出入境管理部門提出申請。憑公安出入境管理部門簽發的大陸居民往來臺灣通行證及有效簽注前往。
往來港澳通行證未滿十六周歲的有效期為5年，成年人電子往來港澳通行證有效期延長為10年，簽注分為探親簽注(T)、商務簽注(S)、團隊旅游簽注(L)、個人旅游簽注(G)、其他簽注(Q)和逗留簽注(D)。持證人須在往來港澳通行證和簽注有效期內，按照規定的次數和停留時限往來香港或者澳門。
來港澳前，必須取得內地公安部門簽發有關來港澳目的簽注（如團隊旅游、個人旅游、商務或其他簽注等）。
持中國公民有效護照經香港前往其它國家或地區的過境旅客如能符合一般的入境規定，包括持有前往目的地的有效入境證件及供海外旅游并已經確認的續程車/船/機票，可在每次入境時獲準在港逗留7天而無需事先領有進入認可。
港澳通行證 團隊和個人簽注，所對應的簽注次數等都是差不多的，最主要的區別在于前往時候是跟隨團隊還是個人前往，公民若跟隨旅游團前往是必須辦理團隊簽注，而個人前往就需要辦理個人簽注，主要根據前往性質來判斷辦理個人還是團隊。《往來港澳通行證、簽注申請須知》
（三）團隊旅游簽注（L）。申請赴香港，可以簽發3個月一次簽注、3個月二次簽注、1年一次簽注、1年二次簽注，每次在香港逗留不超過7天；屬于公安部出入境管理局規定的特別情形的，可簽發3個月一次簽注，每次在香港逗留不超過3天。申請赴澳門，可以簽發3個月一次簽注、1年一次簽注，每次在澳門逗留不超過7天。
（四）個人旅游簽注（G）。申請赴香港，可以簽發3個月一次簽注、3個月二次簽注、1年一次簽注、1年二次簽注，每次在香港逗留不超過7天；對經批準實施多次“個人游”試點政策的城市居民，符合公安部規定條件的，可按照有關規定簽發1年多次簽注，每次在香港逗留不超過7天。申請赴澳門，可以簽發3個月一次簽注、1年一次簽注，每次在澳門逗留不超過7天。
法律依據：
《中華人民共和國出境入境管理法》：
第十一條 中國公民出境入境，應當向出入境邊防檢查機關交驗本人的護照或者其他旅行證件等出境入境證件，履行規定的手續，經查驗準許，方可出境入境。
具備條件的口岸，出入境邊防檢查機關應當為中國公民出境入境提供專用通道等便利措施。
第十二條 中國公民有下列情形之一的，不準出境：
（一）未持有效出境入境證件或者拒絕、逃避接受邊防檢查的；
（二）被判處刑罰尚未執行完畢或者屬于刑事案件被告人、犯罪嫌疑人的；
（三）有未了結的民事案件，人民法院決定不準出境的；
（四）因妨害國（邊）境管理受到刑事處罰或者因非法出境、非法居留、非法就業被其他國家或者地區遣返，未滿不準出境規定年限的；
（五）可能危害國家安全和利益，國務院有關主管部門決定不準出境的；
（六）法律、行政法規規定不準出境的其他情形。

港澳通行證不可以更改簽注種類。
只能夠重新辦理的。
1、個人旅游（G簽）
（1）提交填寫完整的《內地居民往來港澳地區申請表》1份（用鋼筆或簽字筆填寫，不能使用圓珠筆），提交大一寸（48mmX33mm）背景為藍色的正面免冠光學光面彩色照片1張。(如首次申辦或換發往來港澳通行證，須提交廣東省出入境證件數碼相片檢測回執)
（2）交驗身份證、戶口簿原件（申請人未滿16周歲，只需交驗戶口簿；軍人只需交驗身份證明），并提交復印件。
（3）持有有效往來港澳通行證的，提交往來港澳通行證。
（4）已向公安部門通報出境備案的人員，申請辦理《往來港澳通行證》及港澳個人旅游簽注，須按干部管理權限提交單位意見。其他人員，無需提交單位或派出所意見。
2、團隊旅游（L簽）
（1）提交填寫完整的《內地居民往來港澳地區申請表》1份（用鋼筆或簽字筆填寫，不能使用圓珠筆），提交大一寸（48mmX33mm）背景為藍色的正面免冠光學光面彩色照片1張。(如首次申辦或換發往來港澳通行證，須提交廣東省出入境證件數碼相片檢測回執)
（2）交驗身份證、戶口簿原件（申請人未滿16周歲，只需交驗戶口簿；軍人只需交驗身份證明），并提交復印件。
（3）提交國家旅游局指定旅行社出具的全額旅游費用的發票復印件，交驗原件；
（4）已向公安部門通報出境備案人員，申請辦理《往來港澳通行證》及赴港澳團隊旅游簽注，須按干部管理權限提交單位意見。其他人員，無需提交單位或派出所意見。
（5）特別提示：申請人不得同時持有兩本（含兩本）以上有效往來港澳通行證，不得同時持有兩個（含兩個）以上同一前往地的有效簽注。申請簽注時須確保所持往來港澳通行證的有效期超過所申請的簽注有效期20天以上。

1、港澳通行證簽注的是團隊簽（L簽）的 只能是跟旅行社的團進入香港或澳門。如果在這種簽注下想自由行的 你可以飛深圳，然后到羅湖關口找深圳當地的旅行社讓你的簽注上旅行社的名單，讓當地的旅行社帶你進香港就可以了，回來是無所謂什么簽注的。
2、如果想要在團隊簽注下改為個人旅游簽注（G簽）的，有兩種方法：一，讓簽注自動過期，然后在重新簽注個人旅游簽注，二，去當地的出入境辦理注銷，然后再重新辦理個人旅游簽注 這樣就可以了
望采納