股權轉讓糾紛的處理方法如下： 協商處理； 協商不成的，可以申請調解； 向人民法院提起訴訟。

股權轉讓糾紛還可以分為不同的類型，針對不同的類型，應該按照不同的方式來處理。

第一種類型是轉讓雙方之間的股權轉讓合同糾紛，具體可以包括股權轉讓合同效力糾紛和履行股權轉讓合同糾紛。股權轉讓合同必須符合有效要件，如果股權轉讓合同被認定無效。轉讓方和受讓方可以要求返還財產，對于因自己的過錯造成實際損失的，應當賠償對方損失。

如果股權轉讓合同成立后，在尚未履行或尚未履行完畢時，受讓人可以起訴出讓人，要求其繼續履行合同。公司可以根據法院的通知，在一定期限內征求其他股東對該轉讓合同的意見。

第二種類型是涉及保護公司內部其他股東的優先購買權的糾紛。《公司法》規定，股東向股東以外的人轉讓股權時，不同意的股東應當購買該轉讓的股權，但關于購買價格如何確定，是以對外轉讓合同的價格，還是以公司凈資產重新進行評估確定價格，在實務中爭議較大。

股權自由轉讓制度，是現代公司制度最為成功的表現之一。隨著中國市場經濟體制的建立，國有企業改革及公司法的實施，股權轉讓成為企業募集資本、產權流動重組、資源優化配置的重要形式，由此引發的糾紛在公司訴訟中最為常見，其中股權轉讓合同的效力是該類案件審理的難點所在。

參考資料：百度百科—股權轉讓

法律分析：要依據具體情況而定。如果因無效而解除的，要退回股權。

法律依據：《中華人民共和國民法典》

第一百五十七條 民事法律行為無效、被撤銷或者確定不發生效力后，行為人因該行為取得的財產，應當予以返還;不能返還或者沒有必要返還的，應當折價補償。有過錯的一方應當賠償對方由此所受到的損失;各方都有過錯的，應當各自承擔相應的責任。法律另有規定的，依照其規定。

第五百六十六條 合同解除后，尚未履行的，終止履行;已經履行的，根據履行情況和合同性質，當事人可以請求恢復原狀或者采取其他補救措施，并有權請求賠償損失。

合同因違約解除的，解除權人可以請求違約方承擔違約責任，但是當事人另有約定的除外。

主合同解除后，擔保人對債務人應當承擔的民事責任仍應當承擔擔保責任，但是擔保合同另有約定的除外。

法律分析：股權轉讓合同解除后處理是，合同解除有溯及力的可以請求恢復原狀，合同解除后當事人可以要求恢復原狀。恢復原狀包括：返還財產所產生的孳息；支付一方在財產占有期間為維護該財產所花費的必要費用；因返還財產所支出的必要費用。

法律依據：《中華人民共和國民法典》 第一百五十七條 民事法律行為無效、被撤銷或者確定不發生效力后，行為人因該行為取得的財產，應當予以返還；不能返還或者沒有必要返還的，應當折價補償。有過錯的一方應當賠償對方由此所受到的損失；各方都有過錯的，應當各自承擔相應的責任。法律另有規定的，依照其規定。