處理倉儲合同中違約的方式是：其一，保管人驗收倉儲物后，在倉儲期間發生倉儲物的品種、數量、質量、規格、型號不符合合同約定的，承擔違約賠償責任。其二，存貨人沒有按合同的約定對倉儲物進行必要的包裝或該包裝不符合約定要求，造成倉儲物的毀損、滅失，自行承擔責任，并由此承擔給倉儲保管人造成的損失。
【法律依據】
《民法典》第九百零七條
保管人應當按照約定對入庫倉儲物進行驗收。保管人驗收時發現入庫倉儲物與約定不符合的，應當及時通知存貨人。保管人驗收后，發生倉儲物的品種、數量、質量不符合約定的，保管人應當承擔賠償責任。

倉單與倉儲合同不一致解決方法如下：
1、合同的雙方當事人應當先進行友好協商，爭取達成雙方比較滿意的協議。
2、合同雙方達不成協議，則可以由當地工商行政管理部門進行調解。
3、雙方協商或經過工商行政部門調解不成或者不愿調解的，可根據合同中規定的仲裁條款或雙方在糾紛發生后達成的仲裁協議向仲裁機構申請仲裁。
4、訴訟，合同中沒有訂立仲裁條款，事后也沒有達成仲裁協議，合同當事人可以將合同糾紛起訴到法院，尋求司法解決。