員工違反公司規章制度可以扣工資。勞動者和用人單位建立勞動關系，勞動者違反公司規定，用人單位非法克扣勞動者的合法工資是違法的，勞動者可以依照績效考核辦法，對違反考核內容的，可以酌情扣減績效工資。勞動者與用人單位因工資支付發生勞動爭議的，當事人可依法向勞動爭議仲裁機關申請仲裁。
公司的罰款既不合法也不合理。公司無權作出罰款的決定，更不能隨便克扣工資。對于員工違反規章制度的行為，公司可以采取警告等措施預防員工再犯。公司無權作出罰款的決定，更不能隨便克扣工資。
對于員工違反規章制度的行為，公司可以采取警告等措施預防員工再犯。如果員工因為遲到不會被罰款，但是有可能被公司扣款，扣款也是有一定的標準。員工的遲到行為沒有造成用人單位直接經濟損失，用人單位無權扣除員工工資。或者員工經常遲到，可以視為對勞動合同的嚴重違反，公司可以解除勞動合同，并不需要進行經濟補償。
在實踐中，因為員工的過錯，造成公司損失，公司可以要求勞動者賠償公司的經濟損失，但是公司支付給員工當月的工資不能低于當地的最低工資標準。公司不可以對員工進行處罰，這違反法律規定，勞務者對公司存在疑慮不滿，可以根據規矩合同簽訂，來保護自己的合法權益。對員工進行的處罰，也要符合公司管理規定和保護條例。
公司制度可以隨意扣錢嗎
1.公司基本制度的設置只要內容合法、程序合法，及對公司全體員工產生約束效力，公司員工如對公司基本制度制定過程中存在的問題有相關意見，可以在全體職工大會在相關制度的討論過程中提出個人的意見和想法。
2.如果建議不被接納，公司制度經過全體職工大會通過的，員工不認可公司制度可與公司協商一致解除勞動合同。
法律依據：
《工資支付暫行條例》
第十五條
用人單位不得克扣勞動者工資。有下列情況之一的，用人單位可以代扣勞動者工資：
（一）用人單位代扣代繳的個人所得稅；
（二）用人單位代扣代繳的應由勞動者個人負擔的各項社會保險費用；
（三）法院判決、裁定中要求代扣的撫養費、贍養費；
（四）法律、法規規定可以從勞動者工資中扣除的其他費用。

勞動者工資被扣的合法性，要根據實際的情況分析：
1、如果勞動者違反規定，造成公司的損失，扣工資是不違法的；
2、如果是無故的扣除勞動者的工資，那么就屬于違法，具體的原因如下：
（1）單位克扣工資是用人單位侵害勞動者合法權益，可以告知勞動局；
（2）由勞動行政部門責令支付勞動者的工資報酬、經濟補償，并可以責令支付賠償金；
（3）用人單位應當以貨幣形式按月支付給勞動者本人工資；不得克扣或者無故拖欠；
（4）對無故拖欠、克扣職工工資的，則應要求用人單位立即糾正并繳納滯納金，給職工以經濟補償；對情節嚴重的，要支持和幫助職工提請仲裁和訴訟。
法律依據：《中華人民共和國勞動法》第九十一條
用人單位有下列侵害勞動者合法權益情形之一的，由勞動行政部門責令支付勞動者的工資報酬、經濟補償，并可以責令支付賠償金：
（一）克扣或者無故拖欠勞動者工資的；
（二）拒不支付勞動者延長工作時間工資報酬的；
（三）低于當地最低工資標準支付勞動者工資的；
（四）解除勞動合同后，未依照本法規定給予勞動者經濟補償的。

公司對員工進行罰款需要符合相關法律法規和勞動合同約定，且罰款金額不能超出法定范圍。同時，應當確保罰款程序公正、透明，并告知員工有關權益和救濟途徑。

公司可以根據勞動合同、公司規定等約定對員工進行罰款。但是，罰款金額不得超過員工一個月工資的百分之二十，并必須符合國家法律法規的規定。另外，罰款前應當向員工說明具體情況和理由，以確保罰款程序的公正性和透明度。此外，公司還需注意罰款過程中的程序和細節。例如，應當在罰款前告知員工有關權益和救濟途徑，依法聽取員工的陳述和辯解，并對罰款決定進行書面確認或備案。同時，公司還需建立健全的罰款制度和流程，防止濫用權力或對某些員工進行歧視和不公平對待。

什么情況下公司可以對員工進行罰款？答：公司可以對員工進行罰款的情況通常包括：員工違反勞動合同、公司規定或法律法規的規定；員工因工作失誤或過失給企業造成損失等。但是，在實施罰款前，公司需要經過合法、公正的程序和決策，并符合有關法律法規和勞動合同約定的要求。

公司對員工進行罰款需要遵守相關法律法規和勞動合同約定，且罰款金額不得超出法定范圍。同時，罰款程序應當公正、透明，告知員工有關權益和救濟途徑。為了確保企業的健康發展，公司應當建立完善的罰款制度和程序，防止濫用權力或對某些員工進行不公平的處罰。

【法律依據】：
《中華人民共和國勞動法》第四十條 用人單位不得以罰款、扣發工資或者以其他形式降低勞動者的合法權益作為懲罰勞動者的手段。